DS处理对hPSC聚集体大小和肝向分化的影响
评估DS是否减少hPSC聚集体大小并影响其分化潜能。
在3D静态悬浮培养中加入100 μg/ml DS培养5天,观察聚集体形态和直径,并通过肝向分化实验检测分化效果。
Dextran sulfate prevents excess aggregation of human pluripotent stem cells in 3D culture by inhibiting ICAM1 expression coupled with down-regulating E-cadherin through activating the Wnt signaling pathway.
包含细胞聚集体培养、RNA-seq、qRT-PCR、Western blot、免疫荧光、功能干扰(shRNA、抑制剂)及分化实验,验证了ICAM1和Wnt/E-cad机制。
H9人胚胎干细胞系 人诱导多能干细胞系 293T细胞系(用于慢病毒包装)
DS浓度100 μg/ml处理5天。 ICAM1抑制剂A-205804浓度10 μM和50 μM。 Wnt抑制剂IWR-1和IWP2浓度5 μM。 Dox诱导shRNA浓度1 μg/ml处理48小时。 细胞接种密度2×10^5 cells/ml。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估DS是否减少hPSC聚集体大小并影响其分化潜能。
在3D静态悬浮培养中加入100 μg/ml DS培养5天,观察聚集体形态和直径,并通过肝向分化实验检测分化效果。
验证DS是否下调细胞粘附分子表达。
通过qRT-PCR检测一系列粘附相关基因和干性基因的表达变化。
探究ICAM1是否与聚集体大小相关。
通过自然沉降分离大、小聚集体,进行qRT-PCR和Western blot检测ICAM1和E-cad表达。
验证ICAM1是否影响hPSC粘附和聚集体大小。
使用ICAM1抑制剂A-205804处理,观察聚集体大小变化;通过shRNA敲低ICAM1,检测聚集体大小和干性表达。
验证DS是否通过激活Wnt信号通路抑制E-cad表达。
通过RNA-seq KEGG分析、qRT-PCR、Western blot、免疫荧光检测Wnt通路相关基因表达和β-catenin核转位。
验证DS的作用可通过Wnt抑制剂部分逆转。
在DS存在下加入Wnt抑制剂IWR-1或IWP2,观察细胞粘附(2D克隆形成)和聚集体大小(3D培养)变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Matrigel基质胶(hESC级) | Corning | 354277 |
| mTeSR1培养基 | STEMCELL Technologies | 85850 | |
| ReLeSR | STEMCELL Technologies | 05872 | |
| 药物处理 | 硫酸葡聚糖 | Sigma-Aldrich | 42867 |
| 细胞培养 | 温和细胞解离试剂 | STEMCELL Technologies | 07174 |
| 台盼蓝 | Solarbio | C0040 | |
| Y-27632 | Selleck | S1049 | |
| TrypLE | Thermo Fisher | 12604021 | |
| RNA提取与RT-PCR | RNAiso Plus试剂盒 | Takara | 9109 |
| PrimeScript RT预混液 | Takara | RR036B | |
| PowerUp SYBR Green | Thermo Fisher | A25742 | |
| Quant Studio 1实时荧光定量PCR系统 | ABI | ABI7500 | |
| 流式分析 | PE抗人OCT4(OCT3)抗体 | STEMCELL | 60093PE |
| PE抗人TRA-1-81抗体 | STEMCELL | 60065PE | |
| PE抗人SSEA-4抗体 | STEMCELL | 60062PE | |
| PE小鼠同型对照抗体 | BD | 556650 | |
| 免疫荧光 | 兔抗β-连环蛋白抗体 | Bioss | bs-23663R |
| Alexa Fluor 594标记的山羊抗兔IgG | Cell Signaling Technology | 8889S | |
| DAPI | Solarbio | C0065 | |
| 单光子共聚焦显微镜 | Nikon | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | R0020 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Sangon Biotech | C503021 | |
| 兔抗MMP7抗体 | Bioss | bs-0423R | |
| 兔抗MMP-3抗体 | Bioss | bs-0413R | |
| 兔抗LEF-1抗体 | Bioss | bs-1843R | |
| 兔抗Frizzled 8抗体 | Bioss | bs-13219R | |
| 兔抗WNT7B抗体 | Bioss | bs-6244R | |
| CD54/ICAM1抗体 | Cell Signaling Technology | 4915 | |
| E-钙黏蛋白兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 3915 | |
| Slug兔单克隆抗体 | CST | 9585T | |
| Twist-1抗体 | R&D | MAB6230 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab128915 | |
| 抗兔IgG HRP偶联抗体 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 细胞活力检测 | A-205804(ICAM1抑制剂) | Selleck | S2885 |
| CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0037 | |
| 单细胞克隆形成 | IWR-1-endo | Selleck | S7086 |
| IWP2 | Selleck | S7085 | |
| 碱性磷酸酶染色试剂盒 | Beyotime | C3206 | |
| 肝向分化 | RPMI 1640培养基 | Thermo Fisher | 61870036 |
| B27添加剂 | Gibco | 17504044 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma | SRE0098 | |
| CHIR99021 | Selleckchem | S1263 | |
| 激活素A | Peprotech | 120-14 | |
| DMEM/F12培养基 | Gibco | 11330032 | |
| 敲除血清替代物 | -- | -- | |
| 成纤维细胞生长因子4 | Peprotech | 100-31 | |
| 肝细胞生长因子 | Peprotech | 100-39 | |
| 无EGF肝细胞培养基 | Lonza | CC-3198 | |
| 抑瘤素M | Peprotech | 300-10 | |
| 地塞米松 | Sigma | D4902 | |
| 基因干扰 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher | L3000015 |
| Lenti-X p24快速滴度检测试剂盒 | Takara | 632200 | |
| 聚凝胺 | Sigma | TR-1003 | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 多西环素 | -- | -- | |
| 观测 | JuLI Stage实时细胞历史记录仪 | NanoEntek | JS1000S |
| 统计分析 | GraphPad Prism 6 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| hPSC培养与维持 | 细胞系:H9(38-52代)和hiPSC(24-29代);培养基:mTeSR1;基质:hESC-qualified Matrigel;传代比例1:6;传代试剂ReLeSR 阅读提示:Methods: hPSC culture and maintenance |
| 聚集体悬浮培养 | 接种密度2×10^5 cells/ml;培养基mTeSR1含10 μM Y-27632;超低吸附6孔板;DS浓度100 μg/ml;培养5天 阅读提示:Methods: Aggregate suspension culture of hPSCs |
| ICAM1抑制实验 | A-205804浓度:剂量依赖性实验(文中未明确说明全部浓度,但10 μM和50 μM具体使用);细胞活力检测 阅读提示:Methods: Cell viability assay; Results: Fig. 4 |
| Wnt信号通路验证 | DS处理组与对照组;β-catenin核转位检测;Wnt通路上调基因(WNT7B, FZD8等) 阅读提示:Results: Fig. 6; Methods: Subcellular fractionation, Western blot |
| 肝向分化 | 分化培养基组分:RPMI 1640, B27, 0.1% BSA;CHIR99021 6 μM(第1天),Activin A 10 ng/ml(2-3天);后续FGF4, HGF, HCM, oncostatin M, dexamethasone浓度 阅读提示:Methods: Integrated 3D hepatic differentiation of hPSC aggregates |