临床样本分析PTK7表达与临床病理特征
评估PTK7在HNSCC中的表达水平及其与临床病理特征和预后的关系。
利用TCGA数据库、RT-PCR、western blot和IHC检测PTK7在HNSCC组织和正常组织中的表达,并分析其与β-Catenin表达及临床病理特征的相关性。
Periostin secreted by cancer-associated fibroblasts promotes cancer stemness in head and neck cancer by activating protein tyrosine kinase 7.
包含临床样本分析、体外细胞功能实验、体内异种移植和转移模型,以及机制验证(Wnt/β-Catenin信号)。
HNSCC细胞系HN6、SCC-25、CAL 27 CAFs与NFs原代培养细胞 BALB/C裸鼠异种移植模型 Rca-T细胞肺转移模型
PTK7表达水平(高/低分组,H-score cutoff 121.4275) rhPOSTN处理浓度(100ng/mL)和时间(0-72h) PTK7敲低或过表达细胞系构建(HN6 shPTK7、CAL 27 Lv-PTK7) 体内模型中PTK7抗体给药剂量(10μg/肿瘤结节)和erlotinib剂量(50mg/kg/day) 动物模型细胞接种数量(1×10^6或2×10^6)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估PTK7在HNSCC中的表达水平及其与临床病理特征和预后的关系。
利用TCGA数据库、RT-PCR、western blot和IHC检测PTK7在HNSCC组织和正常组织中的表达,并分析其与β-Catenin表达及临床病理特征的相关性。
验证PTK7抑制是否增强erlotinib的抗肿瘤效果并减少肺转移。
使用HN6细胞皮下移植瘤模型,分别给予vehicle、PTK7抗体、erlotinib或联合治疗,评估肿瘤体积、重量、增殖标志物和β-Catenin表达;同时利用Rca-T细胞尾静脉注射建立肺转移模型,观察PTK7抗体对转移的影响。
确定CAFs中与PTK7相互作用的配体蛋白。
通过免疫共沉淀和质谱分析鉴定CAFs中与PTK7结合的蛋白,并通过western blot、共聚焦显微镜验证POSTN与PTK7的共定位和相互作用。
确定POSTN和PTK7对HNSCC细胞干性、增殖、迁移和侵袭的影响。
通过shRNA敲低PTK7和过表达PTK7,结合rhPOSTN处理,检测CSC标志物表达、球形成、集落形成、增殖、迁移和侵袭能力,以及erlotinib敏感性。
评估POSTN和PTK7在体内对肿瘤形成和生长的作用。
以HN6 shNC和shPTK7细胞皮下注射裸鼠,联合或不联合rhPOSTN,测量肿瘤体积和重量,并通过IHC检测Ki67和β-Catenin表达。
探究POSTN是否通过PTK7激活Wnt/β-Catenin通路。
用rhPOSTN处理细胞,通过western blot检测p-LRP6、Dvl2、Naked2、p-GSK3β和β-Catenin的表达,并用免疫荧光观察β-Catenin的核转位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| IHC | PTK7抗体 | Proteintech | 17799-1-AP |
| Ki67抗体 | Dako | -- | |
| β-Catenin抗体 | Proteintech | 51067-2-AP | |
| IF | POSTN抗体 | Proteintech | 19899-1-AP |
| SignalStain® Boost IHC检测试剂 | CST | #8114 or #8125 | |
| TSA® Plus扩增试剂 | -- | NEL760001KT | |
| ProLong® Gold抗淬灭封片剂(含DAPI) | CST | #8961 | |
| RT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| PrimerScript反转录试剂盒 | Takara | -- | |
| SYBR Premix Ex Taq试剂盒 | Takara | -- | |
| ABI StepOne实时PCR系统 | Life Technologies | -- | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Yeasen | -- |
| p-Lrp6抗体 | CST | #2568 | |
| Dvl2抗体 | CST | #3224 | |
| Naked2抗体 | CST | #2073 | |
| GSK3β抗体 | Proteintech | 22104-1-AP | |
| p-GSK3β抗体 | Signalway Antibody | #11002 | |
| E-cadherin抗体 | Proteintech | 20874-1-AP | |
| Vimentin抗体 | Proteintech | 10366-1-AP | |
| alpha-Tubulin抗体 | Proteintech | 11224-1-AP | |
| HRP标记二抗 | CST | -- | |
| ECLUltra化学发光液 | New Cell and Molecular Biotech | -- | |
| co-IP | Pierce经典免疫沉淀试剂盒 | Thermo Scientific | -- |
| 对照IgG | CST | #2729 | |
| POSTN抗体 | Abcam | ab219056 | |
| 蛋白质银染 | 蛋白质银染试剂盒 | Yeason | -- |
| MS分析 | 胰蛋白酶 | -- | -- |
| 慢病毒感染 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| 球形成实验 | 超低吸附六孔板 | Corning | -- |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | -- | -- | |
| 表皮生长因子 | -- | -- | |
| N2添加剂 | -- | -- | |
| B27添加剂 | Gibco | -- | |
| 细胞增殖实验 | CCK8试剂 | Dojindo | -- |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Merck Millipore | -- |
| Matrigel基质胶 | BD Biosciences | -- | |
| 体内实验 | 厄洛替尼 | -- | -- |
| 重组人Periostin | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 组织样本分析 | 组织微阵列包含10例正常和98例HNSCC,PTK7 H-score cutoff值121.4275 阅读提示:Materials and methods: Patients and samples, IHC and Immunofluorescence |
| 细胞培养 | HNSCC细胞系(CAL 27, SCC-25, HN6等)和CAFs/NFs的分离和培养条件,培养基(DMEM或DMEM/F12)和血清浓度 阅读提示:Materials and methods: Cell cultures |
| 体外功能实验 | rhPOSTN浓度100ng/mL,处理时间0-72小时;sphere/colony形成和transwell实验的具体操作 阅读提示:Materials and methods: Sphere-forming assay, colony formation assay, transwell assay |
| 体内实验 | BALB/C裸鼠,细胞接种数量(1×10^6或2×10^6),PTK7抗体和erlotinib剂量,治疗时间 阅读提示:Materials and methods: Animal experiments |
| 机制验证 | rhPOSTN处理时间(0-240分钟),检测蛋白(p-LRP6, Dvl2等)的抗体和稀释比例 阅读提示:Materials and methods: Western blot analysis, Figure 6 legends |