患者样本生存与相关性分析
评估IL-17RA表达与CRC患者临床预后及CSC标志物表达的相关性
从生物样本库获取68例CRC肿瘤组织,通过qRT-PCR检测IL-17RA和CSC标志物表达,进行Kaplan-Meier生存分析和相关性分析。
Interleukin-17 receptor A drives cancer stem-like properties in colorectal cancer through STAT3 activation.
包含患者样本生存分析、细胞系功能验证(过表达、球体形成、5-FU耐药)及机制通路抑制剂实验,多个独立证据层级。
SW620细胞系(淋巴结转移) SW480细胞系(原发肿瘤) 68例结直肠癌患者肿瘤组织样本
IL-17RA过表达稳定性及CSC标志物表达验证(SW620和SW480) 球体形成实验条件(接种密度、培养时间、生长因子浓度) 5-FU耐药性IC50测定(浓度梯度和处理时间) STAT3抑制剂Stattic处理对CSC标志物和球体形成的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估IL-17RA表达与CRC患者临床预后及CSC标志物表达的相关性
从生物样本库获取68例CRC肿瘤组织,通过qRT-PCR检测IL-17RA和CSC标志物表达,进行Kaplan-Meier生存分析和相关性分析。
建立稳定过表达IL-17RA的CRC细胞模型以研究其功能
通过慢病毒转导在SW620和SW480细胞中稳定过表达人IL-17RA基因,使用blasticidin筛选。
验证IL-17RA过表达对CSC标志物表达的影响
通过RT-qPCR和Western blot检测IL-17RA过表达细胞中CD133、LGR5、ALDH1、SOX2、c-MYC等表达水平。
评估IL-17RA过表达对细胞自我更新能力的影响
将细胞培养在超低吸附96孔板中,加入生长因子培养7天,计数和测量球体大小和数量。
评估IL-17RA过表达对化疗药物5-FU耐药性的影响
用不同浓度的5-FU处理细胞72小时,通过MTT法检测细胞代谢活性,计算IC50值。
探究IL-17RA促进CSC特性的下游信号通路
使用STAT3抑制剂Stattic处理IL-17RA过表达SW620细胞,检测CSC标志物表达、STAT3磷酸化水平及球体形成能力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Invitrogen | -- | |
| 慢病毒生产 | T-Pro NTR II转染试剂 | T-Pro Biotechnology | -- |
| 慢病毒感染 | 杀稻瘟菌素 | Thermo Fisher Scientific | A1113903 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Life Technologies | -- |
| 逆转录 | RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RT-qPCR | QuantiFast SYBR Green PCR试剂盒 | QIAGEN | -- |
| 7900HT Fast实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | cOmplete蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- |
| PVDF膜 | EMD Millipore | -- | |
| SuperSignal West Femto最大灵敏度底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ImageQuant LAS-4000成像系统 | GE Healthcare Life Sciences | -- | |
| 球体形成实验 | 超低吸附96孔板 | Corning | -- |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 人重组表皮生长因子 | Sigma-Aldrich | -- | |
| B27添加剂 | Invitrogen | -- | |
| MTT实验 | 噻唑蓝 | -- | -- |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 机制研究 | Stattic | -- | -- |
| 细胞转染 | pLAS3w.Pbsd质粒 | National RNAi Core Facility | -- |
| pCMV-deltaR8.91包装质粒 | National RNAi Core Facility | -- | |
| pMD.G包膜质粒 | National RNAi Core Facility | -- | |
| 抗体孵育 | 抗IL-17RA抗体 | Cell Signaling Technology | #12661 |
| 抗CD133抗体 | Cell Signaling Technology | #5860 | |
| 抗LGR5抗体 | GeneTex | GTX129862 | |
| 抗ALDH1抗体 | GeneTex | GTX123973 | |
| 抗SOX2抗体 | GeneTex | GTX101507 | |
| 抗c-MYC抗体 | GeneTex | GTX103436 | |
| 抗磷酸化STAT3 (Ser727)抗体 | Cell Signaling Technology | #9134 | |
| 抗STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | #12640 | |
| 抗磷酸化p38抗体 | Cell Signaling Technology | #4511 | |
| 抗p38抗体 | Cell Signaling Technology | #8690 | |
| 抗β-连环蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | #8480 | |
| 抗微管蛋白抗体 | GeneTex | GTX101279 | |
| 抗GAPDH抗体 | GeneTex | GTX100118 | |
| 辣根过氧化物酶标记的二抗 | Jackson ImmunoResearch | 711-035-152 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本分析 | IL-17RA表达分组标准;患者预后终点定义;样本量(68例) 阅读提示:Methods 2.1 和 2.8;Figure 1 legend |
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件(DMEM + 10% FBS + 抗生素);传代条件;支原体检测 阅读提示:Methods 2.2 |
| 慢病毒转导 | 质粒和包装体系;MOI;转染试剂;筛选浓度和时间 阅读提示:Methods 2.3 |
| CSC标志物表达 | 引物序列;PCR循环条件;内参基因(GAPDH);抗体稀释度 阅读提示:Methods 2.4 和 2.5 |
| 球体形成实验 | 细胞接种密度;培养时长;培养基添加物(bFGF、EGF、B27)浓度;计数标准 阅读提示:Methods 2.6 |
| 5-FU耐药性 | 5-FU浓度梯度;处理时间;MTT浓度和孵育时间;IC50计算模型 阅读提示:Methods 2.7 |
| 机制验证 | Stattic浓度;处理时间;p-STAT3检测方法(膜剥离与重杂交) 阅读提示:Methods 2.5;Figure 5 legend |