回顾性队列分析
评估RLICi在KRAS突变和非突变LUAD患者中的疗效差异。
收集71例接受骨靶向药物联合ICIs治疗的LUAD患者,其中30例接受RLICi,41例接受双膦酸盐联合ICIs。比较KRAS突变与野生型患者的PFS和DCB。
RANKL/PD-1 dual blockade demonstrates survival benefit for patients with advanced lung adenocarcinoma harboring KRAS mutations.
包含回顾性临床队列、TCGA/GEO/CPTAC转录组及蛋白质组分析、体外细胞系实验(RANKL过表达/敲低、通路抑制剂)、巨噬细胞功能实验、C57BL/6J小鼠肿瘤模型、前瞻性单臂II期临床试验,且包含功能与机制验证。
NCC回顾性队列(71例晚期LUAD骨转移患者) CICAMS队列(216例LUAD组织样本) TCGA/GEO/CPTAC公开数据集 细胞系(H358、A427、LLC、CMT167等) C57BL/6J小鼠皮下移植瘤模型(LLC、CMT167) DEMAIN试验(20例KRAS突变LUAD患者)
KRAS突变状态与RANKL表达的关系:需在多个数据集中验证,且需区分KRAS突变亚型。 RANKL通过PI3K-AKT通路下调PD-L1:需验证通路抑制剂的浓度和作用时间(如alpelisib 10–20 μM处理24 h)。 RANKL抑制巨噬细胞趋化和分泌功能:需验证sRANKL浓度(0、10、100 ng/mL)对CXCL9-11分泌和CD8+ T细胞趋化的影响。 RLICi在动物模型中的剂量和给药方案:抗PD-1和抗RANKL抗体均每三周一次10 mg/kg,pemetrexed每两周一次10 mg/kg。 DEMAIN试验的疗效评估:PFS1和PFS2的定义及维持治疗方案(denosumab+PD-1抑制剂)。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估RLICi在KRAS突变和非突变LUAD患者中的疗效差异。
收集71例接受骨靶向药物联合ICIs治疗的LUAD患者,其中30例接受RLICi,41例接受双膦酸盐联合ICIs。比较KRAS突变与野生型患者的PFS和DCB。
比较KRAS突变与野生型LUAD中RANKL表达,并分析其与免疫标志物的相关性。
利用TCGA、GEO和CPTAC数据集分析RANKL表达及与PD-L1、CD8A、CXCL9-11等的关系,并通过CICAMS队列的IHC验证。
验证RANKL高表达对PD-L1表达和巨噬细胞功能的影响。
建立RANKL过表达和敲低细胞系,检测PI3K-AKT通路分子和PD-L1表达。用sRANKL刺激巨噬细胞,检测CXCL9-11分泌和CD8+ T细胞趋化。
验证RLICi在KRAS突变LUAD小鼠模型中的抗肿瘤疗效和免疫微环境变化。
使用LLC(KRASG12C)和CMT167(KRASG12D)细胞皮下接种C57BL/6J小鼠,分别给予抗PD-1、抗RANKL单药或联合治疗,以及化疗联合PD-1组,评估肿瘤生长和免疫标志物表达。
评估RLICi维持治疗在KRAS突变LUAD患者中的疗效和安全性。
单臂II期试验(DEMAIN),20例KRAS突变LUAD患者接受denosumab联合PD-1抑制剂维持治疗,主要终点为PFS,次要终点为OS和安全性。与接受ICIs联合化疗维持治疗的历史对照组比较。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | RANKL抗体 | Novus Biologicals | NB100-56512 |
| RANK抗体 | Abcam | ab13918 | |
| CD68抗体 | Abcam | ab213363 | |
| PD-L1抗体 | Ventana Medical Systems | 740-4907 | |
| CD8抗体 | Zsbio Tech | ZA-0508 | |
| CXCL9抗体 | Proteintech | 22355-1-AP | |
| CXCL10抗体 | R&D Systems | MAB2662-SP | |
| CXCL11抗体 | R&D Systems | MAB672-SP | |
| 蛋白质印迹 | PD-L1抗体 | Cell Signaling Technology | 13684T |
| Erk1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| Phospho-Erk1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4691 | |
| Phospho-AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| β-actin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| 动物实验 | 抗PD-1抗体 | BioXCell | BE0146 |
| 抗RANKL抗体 | BioXCell | BE0191 | |
| 流式分析 | BD Multitest™ CD3 FITC/CD8 PE/CD45 PerCP/CD4 APC | Becton, Dickinson and Company | 340499 |
| 细胞培养 | BEGM培养基 | Lonza | CC-3170 |
| RPMI-1640培养基 | KeyGEN BioTECH | -- | |
| DMEM培养基 | KeyGEN BioTECH | -- | |
| 胎牛血清 | Corning | 35-081-CV | |
| 青链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| 阿培利司 | Selleck | BYL719 | |
| 可溶性RANKL | Novoprotein | CK63 | |
| 佛波醇酯 | Sigma-Aldrich | 16561-29-8 | |
| 巨噬细胞极化 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L2880 |
| 干扰素-γ | PeproTech | 300-02 | |
| T细胞趋化 | 白细胞介素-2 | Novoprotein | C013 |
| 动物实验 | 培美曲塞 | Selleck | S1148 |
| T细胞趋化 | CXCL9 | Novoprotein | C437 |
| CXCL10 | Novoprotein | C054 | |
| CXCL11 | SinoBiological | 10876-HNAE | |
| ELISA | 人CXCL9 ELISA试剂盒 | J&I Biological | JL14160 |
| 人CXCL10 ELISA试剂盒 | J&I Biological | JL11028 | |
| 人CXCL11 ELISA试剂盒 | J&I Biological | JL11358 | |
| 人sRANKL ELISA试剂盒 | J&I Biological | JL10664 | |
| 人NTX ELISA试剂盒 | J&I Biological | JL36684 | |
| 人CTX ELISA试剂盒 | J&I Biological | JL14458 | |
| RNA提取 | RNA快速纯化试剂盒 | Yishan Biotechnology | RN001 |
| cDNA合成 | TransScript® II cDNA合成试剂盒 | TransGen Biotech | AH341-01 |
| RT-qPCR | TransStart® qPCR SuperMix | TransGen Biotech | AQ132 |
| 蛋白质印迹 | PAGE凝胶快速制备试剂盒 | Dakewe | 8012011 |
| CD8+ T细胞分离 | 人CD8磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-045-201 |
| 流式分析 | Trucount™ 绝对计数管 | Becton, Dickinson and Company | 340334 |
| 蛋白质印迹 | PVDF膜 | APPLYGEN | P2120-2 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 回顾性队列分析 | 患者纳入标准:晚期LUAD伴骨转移,接受骨靶向药物联合ICIs治疗;治疗分组:RLICi vs 非RLICi;KRAS突变状态;样本量:71例;时间范围:2020年12月至2022年12月。 阅读提示:见STAR Methods中“Retrospective cohort enrollment (NCC cohort)”部分 |
| 转录组数据分析 | TCGA、GEO、CPTAC数据集中的样本量、KRAS突变分类方法;RANKL表达分组标准(按中位数);相关性分析(Pearson相关)和免疫浸润分析(quanTIseq)方法。 阅读提示:见STAR Methods中“Bioinformatic data source and reprocessing”部分 |
| 体外细胞实验 | 细胞系来源和培养条件;RANKL过表达/敲低构建方法;alpelisib浓度(10-20 μM)和处理时间(24h);sRANKL刺激浓度(100 ng/mL)和时间(24h);巨噬细胞分化条件(PMA浓度和时间);M1极化细胞因子浓度(LPS 100 ng/mL, IFN-γ 10 ng/mL);检测方法(Western blot、RT-qPCR、ELISA)。 阅读提示:见STAR Methods中“Construction of RANKL-knockdown/overexpressing cells”, “RT-qPCR and western blotting”, “Chemotaxis and secretory function assay of macrophages”部分 |
| 动物实验 | 小鼠品系(C57BL/6J,雌性,6周龄);细胞接种量(1×10^6);治疗剂量(抗PD-1和抗RANKL 10 mg/kg,三周一次;pemetrexed 10 mg/kg,两周一次);肿瘤测量和计算方式;实验终点(第18天)。 阅读提示:见STAR Methods中“Mice and tumor models”部分 |
| 前瞻性临床试验 | 试验设计(Simon两阶段);样本量(20例);纳入标准(KRAS突变LUAD);治疗方案(denosumab联合PD-1抑制剂维持治疗);主要和次要终点(PFS、OS和安全性);疗效评估标准(RECIST v1.1);不良事件评估(CTCAE v5.0)。 阅读提示:见STAR Methods中“Prospective trial design and recruitment (DEMAIN trial)”部分 |