验证UL23对病毒抵抗T细胞杀伤的作用
确定UL23是否增强HCMV抵抗T细胞介导的细胞毒性。
将HCMV Towne或ΔUL23感染HFFs,与抗CD3/CD28激活的Jurkat细胞共培养,检测病毒滴度、GFP表达、IE1水平。
Human cytomegalovirus UL23 exploits PD-L1 inhibitory signaling pathway to evade T cell-mediated cytotoxicity.
包含体外细胞共培养、基因敲除/过表达、RNA-seq、PD-L1中和/敲低、PBMC验证等多个独立证据层级,且明确功能与机制验证。
HFFs(人包皮成纤维细胞) Jurkat T细胞系 外周血单个核细胞(PBMCs) HCMV Towne株及ΔUL23突变株
HCMV感染复数(MOI=3)及共培养比例(Jurkat:T细胞=3:1) IFN-γ中和抗体浓度(10 µg/mL)及处理时间(30分钟) PD-L1 siRNA敲低效率(qPCR和Western blot验证) anti-CD3/CD28激活Jurkat细胞的浓度(各1 µg/mL)及时间(24小时) 共培养时间(24小时至5天)及病毒滴度检测方法(PFU)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定UL23是否增强HCMV抵抗T细胞介导的细胞毒性。
将HCMV Towne或ΔUL23感染HFFs,与抗CD3/CD28激活的Jurkat细胞共培养,检测病毒滴度、GFP表达、IE1水平。
探讨IFN-γ是否为UL23介导的T细胞杀伤调控的主要因子。
使用不同阻断剂(EGTA、Kp7-6、IFN-γ NAb、TRAIL NAb、infliximab)处理共培养体系,检测病毒滴度;同时使用siR-IFNGR1敲低受体,观察IE1表达。
验证UL23是否影响T细胞活化、增殖和凋亡。
在共培养体系中检测IL-2分泌(ELISA)、CFSE稀释(流式)、annexin V/7-AAD染色(流式)及cleaved Caspase-3表达(Western blot)。
确定UL23是否通过调节免疫检查点分子(如PD-L1)影响T细胞。
通过RNA-seq比较Towne和ΔUL23感染HFFs差异表达基因,筛选候选调节因子,并使用中和抗体或siRNA敲低验证。
证实PD-L1是否为UL23抑制T细胞功能的关键介质。
通过siRNA敲低或中和抗体阻断PD-L1,检测IFN-γ、IL-2分泌、T细胞增殖和凋亡,并评估病毒滴度。
明确UL23是否促进PD-L1表达及机制。
利用PD-L1启动子荧光素酶报告实验、qPCR、Western blot、流式分析及ELISA检测PD-L1表达。
确认PD-L1在UL23介导的病毒抵抗T细胞杀伤中的必要性。
在siRNA敲低或中和PD-L1条件下,检测病毒滴度及IE1表达,并在PBMC中验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | Gibco | C11995500BT |
| 胎牛血清 | ExCell Bio | FSS500 | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| RPMI 1640培养基 | Gibco | C11875500BT | |
| 病毒制备 | HCMV Towne株 | -- | -- |
| DNA提取 | 病毒DNA/RNA提取试剂盒 | Yeasen | 19321ES50 |
| qPCR | SYBR Green qPCR试剂盒 | Yeasen | 11201ES08 |
| RNA提取 | 总RNA提取试剂盒 | Yeasen | 19221ES50 |
| cDNA合成 | 逆转录试剂盒 | Vazyme | R223-01 |
| qPCR仪器 | CFX96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- |
| qPCR | SYBR Green预混液试剂盒 | Yeasen | 11201ES08 |
| PCR | Taq预混液 | Vazyme | P111 |
| Western blot裂解 | Western blot细胞裂解液 | Beyotime | P0013 |
| Western blot封闭 | 脱脂奶粉 | Bio-Rad | 1706404 |
| Western blot二抗 | 辣根过氧化物酶标记二抗 | Proteintech | SA00001-1 |
| Western blot检测 | 增强化学发光检测试剂 | Yeasen | 36208ES60 |
| Western blot一抗 | 抗PD-L1抗体 | Proteintech | 66248-1-Ig |
| GAPDH抗体 | Yeasen | 30201ES60 | |
| 抗IE1抗体 | Abcam | ab53495 | |
| DYKDDDDK抗体(FLAG) | Proteintech | 66008-3-lg | |
| 抗IFNGR1抗体 | Santa Cruz | sc-12755 | |
| 抗caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662S | |
| siRNA转染 | Lipo2000转染试剂 | Invitrogen | 11668030 |
| siRNA | siR-PD-L1 | Shanghai GenePharma | -- |
| 人IFNGR1 siRNA | Santa Cruz | sc-29357 | |
| siRNA对照 | 对照siRNA | Santa Cruz | sc-37007 |
| 质粒转染 | Lipo293转染试剂 | Beyotime | C0521 |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Beyotime | C0037 |
| 双荧光素酶报告实验 | pGL3载体 | Promega | E1751 |
| pRL-TK海肾荧光素酶质粒 | Promega | E2241 | |
| 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Yeasen | 11402ES60 | |
| 流式分析 | CD274-PE抗体 | eBioscience | 12-5983-42 |
| 流式分析对照 | 小鼠IgG1 K同型对照PE | eBioscience | 12-4714-81 |
| 可溶性PD-L1检测 | ELISA试剂盒 | R&D Systems | DB7H10 |
| T细胞激活 | 抗CD3抗体 | BD Biosciences | 555329 |
| 抗CD28抗体 | BD Biosciences | 555725 | |
| IFN-γ检测 | IFN-γ ELISA试剂盒 | Proteintech | KE00146 |
| IL-2检测 | IL-2 ELISA试剂盒 | Proteintech | KE00017 |
| T细胞增殖 | CFSE染料 | Beyotime | C1031 |
| 凋亡检测 | 膜联蛋白V-7-AAD凋亡检测试剂盒 | Vazyme | A213-01 |
| 通路抑制 | 乙二醇双(2-氨基乙基醚)四乙酸 | MedChemExpress | HY-D0861 |
| Kp7-6 | Calbiochem | 341291 | |
| 纯化抗人CD253(TRAIL)抗体 | BioLegend | 308202 | |
| 纯化抗IFN-γ抗体 | BioLegend | 502401 | |
| 英夫利昔单抗 | MedChemExpress | HY-P9970 | |
| 抗CD274(PD-L1,B7-H1)抗体 | eBioscience | 16-5983-82 | |
| 纯化抗人CD66a/b/c/e(CEACAM1/1/5/6/8)抗体 | BioLegend | 398902 | |
| 抗人IL-10R β抗体 | R&D Systems | MAB874 | |
| 通路抑制对照 | 小鼠IgG同型抗体 | eBioscience | 16-4714-82 |
| 重组蛋白 | 重组PD-L1蛋白(PD-L1 Fc) | Sino Biological | 10084-H02H |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 统计软件 | GraphPad Prism 8软件 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 共培养实验 | HFFs和Jurkat细胞比例(3:1)、MOI(3)、激活抗体浓度(anti-CD3/CD28各1 µg/mL)、共培养时间(24小时至5天) 阅读提示:Methods: 'IFN-γ and IL-2 expression assay' 和 'T cell proliferation assay' |
| IFN-γ中和实验 | 抗IFN-γ抗体浓度(10 µg/mL)及预处理时间(30分钟) 阅读提示:Figure 2 legend |
| PD-L1敲低/中和实验 | siR-PD-L1转染浓度(50 pmol)、PD-L1中和抗体浓度(10 µg/mL)、敲低效率验证(qPCR和Western blot) 阅读提示:Methods: 'siRNA interference and plasmid transfection' 和 'Pathway inhibition' |
| 病毒滴度检测 | MOI(3)、感染时间(0-8天)、PFU检测方法 阅读提示:Methods: 'Viral infection and viral titer analysis' |
| 细胞功能检测 | CFSE浓度(2.5 µM)、凋亡检测试剂(Annexin V-7-AAD)、ELISA试剂盒(IFN-γ和IL-2) 阅读提示:Methods: 'T cell proliferation assay' 和 'T cell apoptosis assay' |