ACE2下调的鉴定
确定ACE2是否作为连接COVID-19与代谢并发症的关键分子。
对SARS-CoV-2感染的HUVECs进行转录组分析,并结合DisGeNET和Open Targets数据库筛选四个代谢疾病的共享基因,比较这些基因在病毒感染后的表达变化,发现ACE2是持续下调的基因。
Imatinib and methazolamide ameliorate COVID-19-induced metabolic complications via elevating ACE2 enzymatic activity and inhibiting viral entry
包含细胞模型(HUVECs、Vero E6)、动物模型(DIO和hACE2转基因小鼠)及患者样本的多种证据,并进行了功能验证和机制研究。
HUVECs细胞系 Vero E6细胞系 DIO胰岛素抵抗小鼠模型 hACE2转基因小鼠模型 COVID-19患者血浆样本
HUVECs及Vero E6细胞SARS-CoV-2感染MOI=0.005 DIO小鼠(23周高脂饮食)灌胃给予250 mg/kg伊马替尼或100 mg/kg甲唑酰胺,每日一次,持续4周 hACE2转基因小鼠(6周高脂饮食后)灌胃给予250 mg/kg伊马替尼或100 mg/kg甲唑酰胺,每日一次,持续4周,然后鼻内攻毒4×10^4 FFU SARS-CoV-2,感染7天后检测 肾脏ACE2条件敲除(AAV9-shACE2经肾盂注射)用于验证ACE2依赖性 A779(MasR抑制剂)处理(3 mg/kg每日腹膜内注射,4周)验证ACE2酶活性下游机制
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定ACE2是否作为连接COVID-19与代谢并发症的关键分子。
对SARS-CoV-2感染的HUVECs进行转录组分析,并结合DisGeNET和Open Targets数据库筛选四个代谢疾病的共享基因,比较这些基因在病毒感染后的表达变化,发现ACE2是持续下调的基因。
在患者和细胞模型中验证ACE2酶活性是否降低。
ELISA检测COVID-19患者血浆中Ang II和Ang-(1-7)比值;检测SARS-CoV-2感染的HUVECs及高脂饮食hACE2转基因小鼠肝/肾中的ACE2表达和酶活性。
验证ACE2过表达能否改善肥胖小鼠的代谢紊乱。
通过AAV9-hACE2在ob/ob小鼠中过表达ACE2,进行GTT、ITT及组织学分析。
鉴定能够直接激活ACE2的小分子化合物。
使用Tianhe-2超算进行虚拟筛选,结合CMAP数据库,得到15个候选化合物,并通过HUVECs实验验证,最终确定伊马替尼、哈巴俄苷和甲唑酰胺。
确认候选化合物直接结合并激活ACE2。
使用SPR检测化合物与ACE2蛋白的结合亲和力;测量HUVECs中ACE2酶活性。
验证伊马替尼和甲唑酰胺能否改善胰岛素抵抗小鼠的代谢异常,并确认ACE2依赖性。
DIO小鼠给予伊马替尼或甲唑酰胺,进行GTT、ITT、生化分析、组织学染色;使用肾脏条件敲低ACE2的小鼠及MasR抑制剂A779阻断实验。
验证伊马替尼和甲唑酰胺能否改善SARS-CoV-2感染小鼠的代谢缺陷并抑制病毒。
hACE2转基因小鼠食源性肥胖后药物预给药4周,然后感染SARS-CoV-2,检测代谢指标和病毒载量。
验证药物是否抑制病毒入侵并阐明机制。
Vero E6细胞预处理药物后感染SARS-CoV-2,检测病毒RNA和病毒滴度;伪病毒实验检测入侵;coIP检测ACE2与刺突蛋白的结合。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 虚拟筛选 | 天河二号超级计算机 | -- | -- |
| 蛋白质结合分析 | Biacore T100 | GE Healthcare | -- |
| 细胞培养 | F-12K培养基 | Hyclone | -- |
| DMEM培养基 | Hyclone | -- | |
| DMEM/F12培养基 | Hyclone | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen | -- |
| RNA提取 | AG RNAex Pro试剂 | Accurate Biology | AG21102 |
| 反转录 | Evo M-MLV反转录试剂盒 | Accurate Biology | AG11711 |
| qPCR | SYBR Green Premix Pro Taq HS qPCR试剂盒 | Accurate Biology | AG11701 |
| ACE2酶活性检测 | ACE2活性检测试剂盒(荧光法) | Abcam | ab273297 |
| Western blot | 抗ACE2抗体 | Abcam | ab15348 |
| 抗FoxO1抗体 | Cell Signaling Technology | #2880 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | #4970 | |
| 抗SARS-CoV-2核衣壳抗体 | Sino Biological | #40143-R001 | |
| 抗HA抗体 | Cell Signaling Technology | #3724 | |
| 抗Flag抗体 | Cell Signaling Technology | #8146 | |
| 抗兔IgG HRP标记二抗 | Cell Signaling Technology | #7074 | |
| ELISA | 人血管紧张素II ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E04493h |
| 人血管紧张素-(1-7) ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E14242h | |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E04741m | |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E04639m | |
| 小鼠血管紧张素II ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E04495m | |
| 小鼠血管紧张素-(1-7) ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E13763m | |
| 小鼠肾损伤分子1(KIM-1)ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E08809m | |
| 小鼠胰岛素ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E05071m | |
| 生化检测 | 甘油三酯检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A110-1-1 |
| 总胆固醇检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A111-1-1 | |
| SPR | Series S传感器芯片CM7 | GE Healthcare | 10281415 |
| 药物处理 | 伊马替尼 | MedChemExpress | HY-15463 |
| 甲唑酰胺 | MedChemExpress | HY-B0553 | |
| 哈巴俄苷 | MedChemExpress | HY-N0396 | |
| A779 | MedChemExpress | HY-P0216 | |
| DX600 | MedChemExpress | HY-P2222 | |
| 二脒那秦(DIZE) | MedChemExpress | HY-12404 | |
| 细胞因子处理 | 人TNF-α | Sino Biological | 10602-HNAE |
| 人IL-4 | Sino Biological | 11846-HNAE | |
| 人IL-6 | Sino Biological | 10395-HNAE | |
| 人IFN-γ | Sino Biological | 11725-HNAS | |
| SPR | 人ACE2蛋白 | Sino Biological | 10108-H05H |
| 动物实验 | AAV9-CAG-humanACE2-EGFP | PackGene Biotech | -- |
| AAV9-CAG-mACE2shRNA-EGFP | PackGene Biotech | -- | |
| 60%高脂饲料 | Trophic Animal Feed High-Tech Co.,Ltd | TP23300 | |
| 成像 | Vevo3100 | VisualSonics | -- |
| DM 2500B显微镜 | Leica | -- | |
| Leica DMI8荧光显微镜 | Leica | -- | |
| qPCR | LightCycle480 II | Roche | -- |
| 酶活性检测 | SpectraMax 5 | -- | -- |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | -- | -- |
| BCA蛋白定量试剂 | ComWin Biotech | -- | |
| ECL化学发光试剂 | Millipore | -- | |
| 免疫共沉淀 | Dynabeads Protein G磁珠 | Invitrogen | -- |
| 3×Flag肽 | -- | -- | |
| ELISA | TMB底物 | -- | -- |
| 细胞系 | 人脐静脉内皮细胞 | ATCC | CRL-1730 |
| 人胚胎肾细胞293T | NICR, China | -- | |
| 小鼠肝细胞AML12 | ATCC | CRL-2254 | |
| 非洲绿猴肾细胞Vero E6 | ATCC | CRL-1586 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| SARS-CoV-2感染实验中ACE2激活剂处理 | hACE2转基因小鼠的周龄(12周)、高脂饮食持续时间(6周)、药物剂量(250 mg/kg伊马替尼、100 mg/kg甲唑酰胺)、给药方式(灌胃,每日一次,4周)、SARS-CoV-2攻毒剂量(4×10^4 FFU)、感染时间(7天) 阅读提示:STAR Methods中的Animal studies,图6图注 |
| DIO小鼠代谢改善实验 | 小鼠周龄(28周)、高脂饮食持续时间(23周)、药物剂量(同前)、给药方式(灌胃,每日一次,4周)、GTT和ITT时间点(30周和31周)、处死时间(32周) 阅读提示:STAR Methods中的Animal studies,图5图注 |
| 肾脏ACE2敲低验证 | 肾盂注射AAV9-shACE2的剂量(每肾0.5×10^13 GC)、给药恢复时间(2周)、药物处理时间(4周) 阅读提示:STAR Methods中的Animal studies,图5图注 |
| MasR抑制剂A779阻断实验 | A779剂量(3 mg/kg,每日腹腔注射)、处理时间(4周) 阅读提示:STAR Methods中的Animal studies,图5图注 |
| 体外病毒抑制实验 | Vero E6细胞预处理药物浓度(25 μM伊马替尼、100 μM哈巴俄苷、100 μM甲唑酰胺)和预处理时间(6小时)、感染MOI(0.005)和感染时间(42小时) 阅读提示:STAR Methods中的Focus formation assay,图6R图注 |
| 伪病毒入侵实验 | HEK293T/ACE2细胞预处理药物浓度(同前)和时间(6小时)、伪病毒处理时间(66小时) 阅读提示:STAR Methods中的Pseudovirus Entry Assays,图6S图注 |