人类OCCC免疫微环境特征分析
描述OCCC肿瘤微环境中免疫细胞浸润模式和CD4⁺T细胞亚群转录特征。
对KINDAI队列12例OCCC进行免疫组化分析;对KYOTO队列53例(40 OCCC和13 HGSOC)进行RNA测序;分析JGOG3025队列180例OCCC的RNA测序数据,鉴定IL17A高表达亚群。
IL-17-driven tumor cell-intrinsic inflammatory programming creates an immunotherapy-permissive microenvironment
整合人类队列转录组分析、免疫组化、同基因小鼠模型、体外细胞实验、单细胞RNA测序及抗PD-L1治疗,包含机制验证(NF-κB敲低)和功能验证(体内IL-17处理、T细胞过继转移)。
人OCCC组织样本(KINDAI、KYOTO、JGOG3025队列) 免疫活性同基因OCCC小鼠模型(Arid1afl/fl;(Gt)Rosa26Pik3ca*H1047R,C57BL/6背景) 人OCCC细胞系OVISE和RMG1 小鼠OCCC细胞系(三株独立系)及ID8细胞系
IL17A高表达定义:JGOG3025队列中超过平均值+2SD的9例(5%),用于分组比较。 IL-17处理浓度:体外使用1、10、100 ng/mL(鼠)和1、10、20 ng/mL(人);体内静脉注射1 µg/100 µL。 抗PD-L1剂量和方案:250 µg/次,每周两次,共4周,从腺病毒-Cre后7周开始。 T细胞过继转移:每周一次,每次2×10⁷细胞,连续4周。 生存分析终点:出现腹水严重恶化或体重增加≥20%。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
描述OCCC肿瘤微环境中免疫细胞浸润模式和CD4⁺T细胞亚群转录特征。
对KINDAI队列12例OCCC进行免疫组化分析;对KYOTO队列53例(40 OCCC和13 HGSOC)进行RNA测序;分析JGOG3025队列180例OCCC的RNA测序数据,鉴定IL17A高表达亚群。
获得与人类OCCC基因表达特征相似且免疫背景匹配的小鼠模型,用于功能研究。
将Arid1afl/fl;(Gt)Rosa26Pik3ca*H1047R小鼠回交至C57BL/6背景8代,通过卵巢囊内注射腺病毒-Cre诱导肿瘤,建立3株小鼠OCCC细胞系,并通过RNA测序计算OCCC特征评分。
检测IL-17能否直接激活OCCC肿瘤细胞的炎症信号并诱导细胞因子分泌。
用IL-17刺激小鼠和人OCCC细胞系,进行RNA测序、多重细胞因子检测、Western blot和siRNA敲低NF-κB p65实验。
验证系统给予IL-17是否能增强肿瘤内T细胞浸润和激活。
对荷瘤小鼠静脉注射重组小鼠IL-17A,7天后收集肿瘤进行免疫组化、qPCR、流式细胞术和单细胞RNA测序。
测试Th17偏倚的免疫环境是否能增强OCCC对免疫检查点抑制剂的反应。
通过过继转移RORγt转基因T细胞或野生型T细胞生成部分嵌合小鼠,然后用抗PD-L1抗体治疗,评估总体生存。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | CD68抗体 | Abcam | ab783 |
| CD163抗体 | Novus Biologicals | NB110-59935 | |
| CD8抗体 | Leica Biosystems | LCL-L-CD8-4B11 | |
| CD103抗体 | Abcam | ab129202 | |
| CD4抗体 | Roche | -- | |
| CD20抗体 | Roche | -- | |
| CD138抗体 | Dako | -- | |
| PD-L1抗体 | Abcam | -- | |
| IL-6抗体 | Leica Biosystems | -- | |
| OptiView DAB通用试剂盒 | Ventana Medical Systems | -- | |
| NanoZoomer数字病理系统 | Hamamatsu Photonics | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基(高糖) | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | CORNING | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RPMI-1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Ham's F-12培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RNA提取和测序 | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| RNA测序 | NovaSeq测序平台 | Illumina | -- |
| 多重细胞因子检测 | Bio-Plex Pro小鼠细胞因子23-Plex检测板 | Bio-Rad | M60009RDPD |
| Bio-Plex Pro人细胞因子8-Plex检测板A | Bio-Rad | M50000007A | |
| RT-qPCR | PrimeScript RT试剂盒(Perfect Real Time) | Takara Bio | -- |
| TB Green预混Ex Taq II | Takara Bio | -- | |
| ROX参比染料 | Takara Bio | -- | |
| StepOnePlus实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| siRNA转染 | Opti-MEM减血清培养基 | Thermo Fisher Scientific | 31985062 |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | L3000001 | |
| Silencer Select阴性对照siRNA | Thermo Fisher Scientific | 4390844 | |
| 靶向NF-κB p65的Silencer Select siRNA | Thermo Fisher Scientific | 4390771 | |
| Western blotting | 细胞裂解缓冲液 | Nacalai Tesque | 22352-04 |
| e-PAGEL梯度凝胶 | ATTO | -- | |
| NF-κB p65兔单克隆抗体(克隆D14E12) | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| IκBα抗体(克隆44D4) | Cell Signaling Technology | 4812 | |
| 磷酸化IκBα(Ser36)抗体(克隆EPR6235(2)) | Abcam | ab133462 | |
| β-actin抗体(克隆C4) | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| 抗兔IgG,HRP偶联抗体 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 兔抗小鼠IgG [H+L],HRP | Invitrogen | 61-6520 | |
| Immobilon Western化学发光HRP底物 | Merck Millipore | -- | |
| LAS-4010成像系统 | Cytiva | -- | |
| 体内实验 | 重组小鼠IL-17A蛋白(无载体) | R&D Systems | 421-ML-010/CF |
| 免疫组织化学(小鼠) | 抗NF-κB p65抗体(克隆D14E12) | Cell Signaling Technology | -- |
| Novolink聚合物 | Leica Biosystems | -- | |
| ImmPACT DAB | VECTOR Laboratories | -- | |
| 流式细胞术 | Liberase TM | Sigma-Aldrich | -- |
| Zombie Aqua可固定活力染料 | BioLegend | -- | |
| CD4(BV421) | BioLegend | -- | |
| CD8a(BV785) | BioLegend | -- | |
| CD44(APC) | BioLegend | -- | |
| CD69(FITC) | BioLegend | -- | |
| TIGIT(PE) | BioLegend | -- | |
| PD-1(PE/Cy7) | BioLegend | -- | |
| CD45.1(BUV737) | BioLegend | -- | |
| IL-17A抗体(克隆TC11-18H10.1) | BioLegend | -- | |
| IL-17F抗体(克隆9D3.1C8) | BioLegend | -- | |
| BD LSRFortessa流式细胞仪 | Becton, Dickinson and Company | -- | |
| 单细胞RNA测序 | 胶原酶D | Merck | -- |
| 抗CD45抗体(克隆30-F11) | BioLegend | -- | |
| 7-AAD | BioLegend | -- | |
| BD FACSAria II细胞分选仪 | BD Biosciences | -- | |
| BD Rhapsody卡夹 | BD Biosciences | -- | |
| BD Rhapsody卡夹试剂盒 | BD Biosciences | -- | |
| BD Rhapsody cDNA试剂盒 | BD Biosciences | -- | |
| 免疫反应检测板(小鼠) | BD Biosciences | -- | |
| NovaSeq 6000 S4流动槽 | Illumina | -- | |
| T细胞过继转移和抗PD-L1治疗 | 抗PD-L1抗体(克隆10F.9G2) | Bio X Cell | -- |
| T细胞富集 | 链霉亲和素磁珠Plus-DM | BD Biosciences | -- |
| BD IMag细胞分离系统 | BD Biosciences | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人类样本分析 | 样本来源:KINDAI队列12例OCCC、KYOTO队列40例OCCC和13例HGSOC、JGOG3025队列180例OCCC;IL17A高定义:超过平均值+2SD 阅读提示:Methods: Immunohistochemistry for human ovarian clear cell carcinoma samples; RNA sequencing and data analysis; Results: 图1 |
| 细胞培养处理 | 细胞系:OVISE和RMG1、三株小鼠OCCC细胞系和ID8;IL-17浓度:小鼠1,10,100 ng/mL、人1,10,20 ng/mL;处理时间:24小时(小鼠),24和48小时(人) 阅读提示:Methods: Culture of human ovarian clear cell carcinoma cell lines; Establishment of an inbred ovarian clear cell carcinoma mouse model; Multiplex cytokine assay |
| NF-κB敲低实验 | siRNA靶向NF-κB p65(s72857和s72858)、转染试剂Lipofectamine 3000、IL-17浓度10 ng/mL,处理24小时 阅读提示:Methods: siRNA-mediated NF-κB knockdown |
| 体内IL-17治疗 | IL-17剂量:1 µg/100 µL静脉注射;时间:7天后取材;对照组:PBS 阅读提示:Methods: IL-17 treatment in vivo; Results: 图4 |
| 抗PD-L1治疗 | 抗PD-L1抗体:克隆10F.9G2,剂量250 µg/次,每周两次,持续4周,开始时间:腺病毒-Cre后7周;对照组和处理组每组10只小鼠 阅读提示:Methods: T cell transfer and anti-PD-L1 antibody treatment; Results: 图6 |