确认肺纤维化性别差异及GCA表达
验证小鼠和人肺纤维化中是否存在性别差异,并筛选可能的关键分子。
使用博来霉素诱导雄性和雌性小鼠肺纤维化,通过组织染色、肺功能检测评估性别差异;对BALF和骨髓免疫细胞进行转录组分析,结合公共数据库筛选差异基因,并通过ELISA和免疫荧光验证GCA表达。
Sexual dimorphism of lung immune-regulatory units imprint biased pulmonary fibrosis
包含体外细胞实验、骨髓移植、条件性基因敲除小鼠、单细胞测序、体内抗体治疗等多层级验证,并涵盖功能验证和机制解析。
小鼠博来霉素诱导肺纤维化模型 GcaLyz2-KO小鼠 Htr2cLyz2-KO小鼠 PtprtCD4-KO小鼠
GCA在男性/雄性小鼠肺部的表达水平显著高于女性/雌性 HTR2C+肺泡巨噬细胞在女性/雌性小鼠中富集并通过ANGPTL4抑制GCA产生 GCA通过PTPRT受体激活ROCK1-MLC通路促进Th17细胞迁移 GCA中和抗体单独或联合吡非尼酮可减轻肺纤维化并提高生存率
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证小鼠和人肺纤维化中是否存在性别差异,并筛选可能的关键分子。
使用博来霉素诱导雄性和雌性小鼠肺纤维化,通过组织染色、肺功能检测评估性别差异;对BALF和骨髓免疫细胞进行转录组分析,结合公共数据库筛选差异基因,并通过ELISA和免疫荧光验证GCA表达。
确定巨噬细胞来源的GCA是否直接加重肺纤维化。
给雌性小鼠注射重组GCA蛋白,观察对纤维化的影响;同时构建髓系特异性Gca敲除小鼠(GcaLyz2-KO),评估其对纤维化的保护作用。
探索雌性小鼠中抑制GCA表达的细胞类型及其分子机制。
通过单细胞RNA测序分析肺组织免疫细胞,鉴定HTR2C+ AMs在雌性小鼠中富集;通过细胞转移、共培养实验验证其抑制GCA的作用,并鉴定关键因子ANGPTL4及其受体NRP1。
阐明HTR2C+ AMs如何通过代谢途径调节GCA产生。
用HTR2C+ AMs的条件培养基处理巨噬细胞,检测代谢变化;发现其促进脂解和OXPHOS,抑制糖酵解和GCA表达;沉默Atgl或使用抑制剂Atglistatin逆转该效应。
确定GCA促进Th17细胞迁移的分子受体。
通过质谱和分子对接筛选GCA在Th17细胞上的候选受体,鉴定为PTPRT;通过免疫共沉淀验证结合;利用Ptprt条件敲除小鼠和transwell实验证明PTPRT介导GCA诱导的Th17迁移。
解析GCA-PTPRT轴激活的分子通路。
发现GCA刺激增强ROCK1-MLC磷酸化,而Ptprt缺失消除此效应;GCA抑制MYBPH表达,进而解除对ROCK1的抑制;ERK1/2信号通过TTF-1调控MYBPH表达。
确证PTPRT介导的Th17迁移对纤维化的必要性。
使用PtprtCD4-KO小鼠进行博来霉素诱导,观察GCA刺激下纤维化程度;同时通过过继转移实验证实PTPRT缺失减少Th17细胞肺部浸润。
探索靶向GCA的治疗策略对肺纤维化的改善作用。
在博来霉素模型中给予GCA中和抗体,检测其对肺功能、纤维化程度和Th17细胞比例的影响;并与吡非尼酮单独或联合使用比较效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | 博来霉素 | -- | -- |
| 药物处理 | 吡非尼酮 | -- | -- |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 流式分析 | 抗CD3抗体 | BioLegend | 100340 |
| 抗CD28抗体 | BioLegend | 102116 | |
| 细胞因子处理 | 白细胞介素-6 | Novoprotein | -- |
| 转化生长因子-β | Novoprotein | -- | |
| 白细胞介素-1β | Novoprotein | -- | |
| 白细胞介素-23 | Novoprotein | -- | |
| 抗IFNγ抗体 | BioLegend | 505709 | |
| 白细胞介素-2 | Novoprotein | -- | |
| 白细胞介素-12 | Novoprotein | -- | |
| 巨噬细胞培养 | 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | -- | -- |
| ELISA | GCA ELISA试剂盒 | MyBiosource | MBS9360023 |
| ANGPTL4 ELISA试剂盒 | MyBiosource | MBS2885878 | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | Beyotime Technology | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Technology | -- | |
| 抗PTPRT抗体 | BOSTER | A05344 | |
| 抗GCA抗体 | Invitrogen | PA5-77127 | |
| 抗DYKDDDK标签抗体 | CST | 14793 | |
| 抗Myc标签抗体 | CST | 2276 | |
| 抗β-连环蛋白抗体 | CST | 8480 | |
| 抗磷酸化β-连环蛋白抗体 | CST | 9561 | |
| 抗SMAD2/3抗体 | CST | 8685 | |
| 抗磷酸化SMAD2抗体 | CST | 3108 | |
| 抗磷酸化MLC抗体 | CST | 3671 | |
| 抗RHOA抗体 | CST | 2117 | |
| 抗ROCK1抗体 | CST | 4035 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| 抗MLC抗体 | Proteintech | 55462-1-AP | |
| 抗α-SMA抗体 | CST | 19245 | |
| 抗COL1A1抗体 | CST | 91144 | |
| 抗MYBPH抗体 | Proteintech | 19190-1-AP | |
| 免疫共沉淀 | INVI DNA RNA转染试剂 | Invigentech | -- |
| 抗Flag抗体 | CST | 14793S | |
| 抗MYC抗体 | CST | 2276S | |
| 流式分析 | 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | Beyotime | S1819 |
| 离子霉素 | Beyotime | S1672 | |
| 布雷菲德菌素A | Beyotime | S1536 | |
| 固定/破膜试剂盒 | BD Biosciences | -- | |
| Zombie NIR活力染料 | BioLegend | -- | |
| APC-Cy7-CD45抗体 | BioLegend | -- | |
| Percp/Cy5.5-CD3抗体 | BioLegend | -- | |
| FITC-CD4抗体 | BioLegend | -- | |
| PE-Cy7-CD8抗体 | BioLegend | -- | |
| PE-IL17A抗体 | BioLegend | -- | |
| BV421-T-bet抗体 | BioLegend | -- | |
| Alexa Fluor® 647-FOXP3抗体 | BioLegend | -- | |
| 5HT2C受体抗体 | Affinity | DF3501 | |
| Alexa Fluor 647偶联抗兔IgG | Invitrogen | -- | |
| PE-SiglecF抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗HTR2C抗体 | -- | MAB5764 | |
| 外源GCA结合实验 | His标记重组GCA蛋白 | MedChemExpress | HY-P70334 |
| 抗His抗体 | Proteintech | 66005-1-Ig | |
| Alexa Fluor 555偶联抗小鼠抗体 | Invitrogen | A31570 | |
| 质谱分析 | HisPur Ni-NTA磁珠 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 组织染色 | 抗α-SMA抗体 | CST | 19245T |
| 抗CD68抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-17832 | |
| 抗IL17A抗体 | Abcam | ab79056 | |
| 抗CD4抗体 | Proteintech | 67786-1-Ig | |
| 肺功能检测 | 强制肺功能操作仪 | Buxco Research Systems | -- |
| CT成像 | MILabs U-OICT成像系统 | MILabs | -- |
| 细胞外通量分析 | Seahorse XFe96细胞外通量分析仪 | Agilent | -- |
| D-葡萄糖 | Sigma | -- | |
| 寡霉素A | Glpbio | -- | |
| 2-脱氧-D-葡萄糖 | Sigma | -- | |
| 鱼藤酮 | Sigma | -- | |
| 代谢实验 | Atglistatin | -- | -- |
| 信号通路抑制 | Y27632 | -- | -- |
| LY2109761 | -- | -- | |
| 细胞迁移实验 | PKH26染料 | Solarbio | -- |
| 趋化实验 | IBIDI μ-Slides趋化小室 | IBIDI | -- |
| 单细胞RNA-seq | 10x Genomics Chromium单细胞30试剂盒v3 | 10x Genomics | -- |
| RNA-seq | NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- |
| 蛋白质印迹 | 聚偏二氟乙烯膜 | Bio-Rad Laboratories | -- |
| 增强化学发光试剂盒 | Amersham Biosciences | -- | |
| 动物实验 | 羧甲基纤维素 | -- | -- |
| AAV注射 | AAV-CMV-FLEX-ShPtprt | GeneChem Company | -- |
| AAV-CMV-FLEX-Scramble | GeneChem Company | -- | |
| AAV-CMV-FLEX-ShAtgl | GeneChem Company | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型制备 | 小鼠品系、年龄、性别、博来霉素剂量(3 mg/kg)、给药途径(气管内注射) 阅读提示:Methods中Animal models部分 |
| GCA过表达或敲除 | rGCA剂量(2 mg/kg)、给药频率(每周两次)、给药途径(尾静脉或气管内);GcaLyz2-KO小鼠的构建方法 阅读提示:Methods中Animal models和Mice部分 |
| HTR2C+ AMs分离和转移 | HTR2C+ AMs分离方法、转移细胞数量(5×10^5)、给药途径(气管内)、克隆磷酸盐脂质体预处理 阅读提示:Methods中Intratracheal transplantation of HTR2C− or HTR2C+ AMs部分 |
| 细胞代谢分析 | 巨噬细胞培养条件、LPS刺激浓度、高糖/低糖浓度、2-DG浓度(0.5 mM)、Seahorse分析参数 阅读提示:Methods中Extracellular flux assays部分 |
| Th17细胞迁移实验 | Th17细胞分化条件、rGCA浓度(50 ng/mL)、transwell孔径(8 μm)、迁移时间(24小时) 阅读提示:Methods中T-cell differentiation in vitro和T-cell migration assay部分 |
| 抗体治疗 | GCA-NAb剂量(3 mg/kg)、给药频率(每周两次)、给药途径(静脉);吡非尼酮剂量(300 mg/kg)、给药频率(每日一次)、给药途径(灌胃) 阅读提示:Methods中Animal models部分 |
| PTPRT功能验证 | PtprtCD4-KO小鼠构建方法、AAV注射剂量(2×10^11 vg)、注射后等待时间(3周) 阅读提示:Methods中T-cell migration assay部分 |