验证gp120诱导TREM1表达及凋亡标志物变化
确定gp120是否足以在MMG中诱导TREM1表达并伴随凋亡调节蛋白的变化。
用不同浓度gp120处理MMG 24小时,通过Western blot检测BCL2、BCLXL、BAX、BAD和TREM1表达;使用中和抗体VRC01和还原剂验证特异性。
HIV gp120 induces TREM1 expression through TLR-PGE₂ signalling in human monocyte-derived microglia
包含体外细胞模型(人单核细胞来源小胶质细胞)上的多重功能验证(siRNA敲低、药理学抑制、中和抗体)和机制验证(信号通路抑制剂、转录因子核转位),以及凋亡和细胞毒性检测。
人单核细胞来源的小胶质细胞(MMG) 原代人单核细胞
gp120浓度:2 ng/mL TLR2和TLR4双敲低 PGE2合成依赖PTGS2和PTGES 钙离子依赖的CAMKII和钙调磷酸酶-NFATC1信号
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定gp120是否足以在MMG中诱导TREM1表达并伴随凋亡调节蛋白的变化。
用不同浓度gp120处理MMG 24小时,通过Western blot检测BCL2、BCLXL、BAX、BAD和TREM1表达;使用中和抗体VRC01和还原剂验证特异性。
探究TREM1是否调控gp120诱导的凋亡和细胞毒性。
用TREM1 siRNA转染MMG 48小时,再gp120处理24小时,检测凋亡ssDNA(ELISA)和LDH释放。
确定gp120诱导TREM1是否依赖TLR2/TLR4或CCR5。
用siRNA敲低TLR2、TLR4或CCR5,或使用CCR5拮抗剂maraviroc,再gp120处理,检测TREM1表达。
确定gp120诱导TREM1是否需要PGE2合成。
检测gp120处理后PTGS1、PTGS2、PTGES、PTGES3表达和PGE2释放;使用PTGS1/PTGS2抑制剂(SC560、celecoxib)和PTGES抑制剂MF63处理,检测TREM1表达;并检测PGE2受体拮抗剂对TREM1的影响。
探究gp120诱导PTGS2/PGE2是否依赖钙离子和钙调磷酸酶-NFAT通路。
用EGTA螯合细胞外钙,或用KN93(CAMKII抑制剂)、tacrolimus(钙调磷酸酶抑制剂)处理,检测PTGS2、PTGES、TREM1表达及PGE2;检测NFATC1磷酸化和核转位;siRNA敲低NFATC1后检测PTGS2和PGE2。
评估NF-κB在gp120诱导的TREM1表达中的作用。
用siRNA敲低RELA(NF-κB亚基),检测TREM1、PTGS2、PTGES表达和PGE2水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Ficoll-Paque Plus | Cytiva | -- |
| RPMI 1640 Glutamax培养基 | Gibco | -- | |
| 青霉素 | Gibco | -- | |
| 链霉素 | Gibco | -- | |
| β-神经生长因子 | R&D Systems | -- | |
| CCL2 | R&D Systems | -- | |
| CSF1 | R&D Systems | -- | |
| CSF2 | R&D Systems | -- | |
| IL-34 | R&D Systems | -- | |
| 杜氏磷酸盐缓冲液 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | HIV-1 gp120 Ba-L | NIH HIV Reagent Program | HRP-20082 |
| 中和实验 | VRC01抗体 | NIH HIV Reagent Program | 12033 |
| 中和对照 | IgG1同型对照 | Abcam | ab288147 |
| 药物处理 | 脂多糖 | Sigma | L2630 |
| EGTA | Sigma | E0396 | |
| L-798,106 | Sigma | L4545 | |
| 细胞培养 | 胰蛋白酶 | Gibco | 25200 |
| 药物处理 | 塞来昔布 | Selleck Chemicals | S1261 |
| KN93 | Selleck Chemicals | S6787 | |
| 马拉维若 | Selleck Chemicals | S2003 | |
| PF 04418948 | Selleck Chemicals | S7211 | |
| SC560 | Selleck Chemicals | S6686 | |
| 他克莫司 | Selleck Chemicals | S5003 | |
| MF63 | ApexBio | A3600 | |
| SC51322 | Tocris | 1292 | |
| E7046 | MedChemExpress | HY-103088 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | D2650 | |
| 细胞功能检测 | 抗ssDNA抗体 | Enzo Life Sciences | ALX-804-192 |
| CyQuant LDH细胞毒性检测试剂盒 | Invitrogen | C20301 | |
| 炎症标记物检测 | PGE₂竞争性酶免疫分析试剂盒 | R&D Systems | SKGE004B |
| 人TNF-α DuoSet ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY210 | |
| 人IL-10 DuoSet ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY217B | |
| WARS ELISA试剂盒 | Cusabio | CSB-E11789h | |
| siRNA转染 | Silencer Select siRNA | Ambion | -- |
| Lipofectamine RNAiMAX | Thermo Fisher | -- | |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | -- | |
| Lipofectamine 2000 | Invitrogen | -- | |
| BLOCK-iT Alexa Fluor Red荧光对照 | Invitrogen | -- | |
| Countess 3 FL自动细胞计数器 | Thermo Fisher | -- | |
| Western blot | HEPES | Gibco | -- |
| 氯化钠 | Fisher | -- | |
| EDTA | Sigma | -- | |
| Triton X-100 | Sigma | -- | |
| Halt蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Scientific | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | Thermo Scientific | -- | |
| 碱性磷酸酶偶联二抗 | Invitrogen | WP20007 | |
| CDP-Star | Applied Biosystems | -- | |
| Nitro-Block II | Applied Biosystems | -- | |
| 抗ACTB抗体 | Cell Signaling Technology | 4967 | |
| 抗BAD抗体 | Cell Signaling Technology | 9268 | |
| 抗BAX抗体 | Cell Signaling Technology | 5023 | |
| 抗BCL2抗体 | Cell Signaling Technology | 15071 | |
| 抗BCLXL抗体 | Cell Signaling Technology | 2764 | |
| 抗NFATC1抗体 | Cell Signaling Technology | 8032 | |
| 抗PTGS1抗体 | Cell Signaling Technology | 9896 | |
| 抗PTGS2抗体 | Cell Signaling Technology | 12282 | |
| 抗RELA抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 抗TLR2抗体 | Cell Signaling Technology | 12276 | |
| 抗TLR4抗体 | Cell Signaling Technology | 38519 | |
| 抗CCR5抗体 | BD Pharmingen | 555991 | |
| 抗PTGES抗体 | Novus | NBP3-15084 | |
| 抗PTGES3抗体 | Novus | NB110-96879 | |
| 抗TREM1抗体(Abcam) | Abcam | ab90808 | |
| 抗TREM1抗体(R&D Systems) | R&D Systems | MAB1278 | |
| 抗ACTB抗体(Sigma) | Sigma | A2228 | |
| Fiji | -- | -- | |
| RT-qPCR | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| NanoDrop 1000分光光度计 | -- | -- | |
| High-Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | -- | |
| TaqMan Fast Advanced预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| QuantStudio 384孔实时定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| TaqMan探针(PTGES、PTGES3、PTGS1、PTGS2、TREM1、POLR2A) | Applied Biosystems | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞分化 | PBMC分离、单核细胞分化配方、培养时间、细胞密度、供体数量 阅读提示:Materials and methods: Microglia culture |
| gp120处理 | gp120浓度、处理时间、中和抗体浓度、对照 阅读提示:Materials and methods: Chemicals; Figure legends 1-4 |
| 信号通路抑制 | 抑制剂浓度、预孵育时间、DMSO浓度 阅读提示:Materials and methods: Chemicals; Figure legends 4-6 |
| siRNA敲低 | siRNA序列ID、转染试剂、siRNA浓度、敲低确认时间 阅读提示:Materials and methods: Small interfering RNA transfection |
| PGE2检测 | 检测试剂盒、样本类型、时间点 阅读提示:Materials and methods: Cell death and inflammatory markers; Figure legends 3-4 |
| 免疫印迹 | 抗体克隆号、稀释比例、阻断条件、定量方法 阅读提示:Materials and methods: Western blotting; Figure legends |