动物模型建立与暴露
建立PM2.5暴露模型,评估其对衰老指标的影响。
雄性C57BL/6J小鼠(12周龄)暴露于过滤空气或浓缩环境PM2.5(CAP),每日6小时,持续9天。
Inhalation of concentrated ambient PM2.5 promotes inactivation of telomerase reverse transcriptase, telomere shortening, and senescence of multiple cell types in mice
包含动物模型(小鼠CAP暴露)、体外细胞培养(EPCs)、分子检测(端粒长度、β-半乳糖苷酶活性、Tert活性)、基因表达分析及抗氧化干预(肌肽)等多个独立证据层级,并进行功能验证和机制验证。
雄性C57BL/6J小鼠 外周血单个核细胞(PBMNCs) 内皮祖细胞(EPCs) 骨髓c-kit+细胞
小鼠品系:C57BL/6J,雄性,12周龄 暴露方式:HEPA过滤空气或浓缩环境PM2.5(CAP),每日6小时,持续9天 CAP平均浓度:67.1 µg/m3 抗氧化剂干预:饮用水含1 mg/ml肌肽 恢复实验:暴露后14天正常空气条件
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立PM2.5暴露模型,评估其对衰老指标的影响。
雄性C57BL/6J小鼠(12周龄)暴露于过滤空气或浓缩环境PM2.5(CAP),每日6小时,持续9天。
获取PBMNCs、EPCs和c-kit+细胞进行后续检测。
PBMNCs通过Ficoll密度梯度离心从血液中分离;EPCs从骨髓细胞中培养于纤连蛋白包被的培养皿中10天;c-kit+细胞通过磁珠分选从骨髓细胞中分离。
评估CAP暴露对细胞端粒长度的影响。
使用定量实时PCR(rtPCR)测量DNA样本中端粒重复序列与单拷贝基因(36B4)的比率。
评估CAP暴露对细胞衰老标志物水平的影响。
使用流式细胞术检测β-半乳糖苷酶活性,并分析PBMNC亚型(CD4+、CD8+等)的差异。
探讨端粒缩短的分子机制。
通过rtPCR检测Tert、端粒酶相关蛋白及Shelterin复合物基因的表达;通过Western blot分析Tert亚细胞定位;通过TRAP法检测Tert活性。
评估抗氧化剂肌肽和暴露后恢复对CAP诱导的衰老表型的影响。
部分小鼠在暴露前一周及整个暴露期间饮用含肌肽的水;另一部分小鼠在9天暴露后在正常空气条件下恢复14天。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物暴露 | 通用气溶胶浓缩富集系统 | -- | -- |
| 细胞分离 | Ficoll | Cytiva | 17544652 |
| 细胞培养 | 纤连蛋白包被的培养皿 | Corning | 354451 |
| EBM-2培养基 | Lonza | CC-3162 | |
| 细胞分离 | 磁珠分选试剂盒 | Stem Cell Technologies | C18757 |
| DNA提取 | WizardSV基因组DNA纯化试剂盒 | Promega | A2360 |
| RNA提取 | miRNeasy分离试剂盒 | Qiagen | 217004 |
| RT-PCR | High-Capacity cDNA反转录试剂盒 | Thermo Fisher | 4368814 |
| TaqMan 2x通用PCR预混液 | Thermo Fisher | 4324018 | |
| Western blot | NE-PER核和胞质提取试剂盒 | Thermo Fisher | 78833 |
| 蛋白定量染料 | Bio-Rad | 5000006 | |
| 抗Tert抗体 | Bioss | bs-1411R | |
| 抗Lamin抗体 | Cell Signaling Technology | 4777 | |
| 抗Gapdh抗体 | Cell Signaling Technology | 2118 | |
| Tert activity | TRAPeze XL端粒酶检测试剂盒 | Millipore | S7700FR |
| 流式细胞术 | Cell Event衰老绿色流式检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | C10840 |
| 抗CD45抗体 | BioLegend | 103134 | |
| 抗CD4抗体 | BioLegend | 100568 | |
| 抗CD8a抗体 | BioLegend | 100762 | |
| 抗CD3抗体 | BioLegend | 100220 | |
| 抗CD19抗体 | BioLegend | 115540 | |
| 抗CD161抗体 | BioLegend | 108720 | |
| 抗CD11b抗体 | BioLegend | 101243 | |
| 细胞计数 | TC-20自动细胞计数器 | Bio-Rad | -- |
| DNA浓度测量 | Nanodrop One分光光度计 | Thermo Scientific | -- |
| 实时PCR | Quant Studio 5热循环仪 | Thermo Fisher | -- |
| Western blot成像 | ChemiDoc XRS+分子成像仪 | Bio-Rad | -- |
| Tert活性PCR | MiniAmp热循环仪 | Thermo Fisher | -- |
| 凝胶染色 | SYBR Safe DNA凝胶染色试剂 | Invitrogen | S33102 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物暴露 | 小鼠品系、性别、年龄、暴露方式(CAP浓度、持续时间)、每日暴露时长 阅读提示:Materials and methods, Animals and exposures |
| 细胞分离 | 血液和骨髓采集方法、Ficoll离心条件、EPCs培养条件(培养基、基质、时间) 阅读提示:Materials and methods, Cell isolation |
| 端粒长度测量 | DNA提取方法、PCR条件(引物浓度、循环参数)、标准曲线构建 阅读提示:Materials and methods, Telomere length assessment |
| β-半乳糖苷酶活性检测 | 细胞数量、固定剂浓度、染色探针、孵育时间、流式细胞仪设置 阅读提示:Materials and methods, β-Galactosidase activity assay |
| Tert活性检测 | 蛋白提取方法、蛋白量、扩增循环参数、对照设置 阅读提示:Materials and methods, Tert activity |