验证3BP2-TLR2相互作用及TLR2信号复合体组成
探究3BP2是否作为TLR2信号复合体成分参与信号传导
在HEK293T细胞中共表达3BP2、TLR2、MyD88、TRAF6等,通过免疫共沉淀检测蛋白相互作用;在原代巨噬细胞中检测3BP2与TLR2的共沉淀及配体诱导的复合体形成。
Tankyrase represses autoinflammation through the attenuation of TLR2 signaling
研究包含细胞水平(HEK293T、巨噬细胞)的分子机制验证(磷酸化、泛素化、蛋白互作),以及小鼠模型(条件敲除)的表型、组织学和遗传拯救实验,多个独立证据层级。
HEK293T细胞 小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM) 条件敲除小鼠(LysM-Cre介导的髓系特异性Tnks/Tnks2敲除,及Sh3bp2三重敲除)
TLR2胞内域Y647磷酸化对TLR2信号和稳定性至关重要 3BP2在TLR2信号复合体中招募SRC和SYK 髓系细胞特异性敲除Tnks和Tnks2导致全身性自身炎症 3BP2缺失可逆转Tnks/Tnks2敲除小鼠的炎症表型
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究3BP2是否作为TLR2信号复合体成分参与信号传导
在HEK293T细胞中共表达3BP2、TLR2、MyD88、TRAF6等,通过免疫共沉淀检测蛋白相互作用;在原代巨噬细胞中检测3BP2与TLR2的共沉淀及配体诱导的复合体形成。
确定TLR2胞内域酪氨酸磷酸化是否由SRC/SYK介导及其功能意义
构建TLR2胞内域酪氨酸突变体(6YF)和add-back突变体,检测NF-κB报告基因活性;利用质谱鉴定TLR2互作蛋白;用SRC/SYK抑制剂处理细胞检测NF-κB活性;通过免疫沉淀和Western blot检测TLR2酪氨酸磷酸化水平。
阐明酪氨酸磷酸化如何影响TLR2蛋白稳定性及泛素化
通过脉冲追踪实验比较野生型和6YF突变体TLR2的半衰期;检测TLR2泛素化水平及与E3泛素连接酶PPP1R11的相互作用。
研究Tankyrase在体内对免疫稳态和炎症的作用
通过LysM-Cre介导的条件敲除获得小鼠Tnks-/-Tnks2fl/fl LysM-Cre,观察发育、体征和组织病理变化;通过IHC和流式分析鉴定免疫细胞浸润;检测血清细胞因子水平。
确定Tankyrase缺失对巨噬细胞TLR2信号通路和细胞因子产生的影响
从WT和KO小鼠骨髓中分离巨噬细胞,用TLR2配体(HKPG或HKSA)刺激,检测IL-6产生、NF-κB核转位、IκBα磷酸化及TLR2、3BP2、SRC/SYK水平;使用激酶抑制剂验证通路依赖性。
验证Tankyrase缺失引起的炎症表型是否依赖于3BP2
将Sh3bp2fl/fl等位基因引入Tnks-/-Tnks2fl/fl LysM-Cre小鼠,获得三重敲除小鼠(TKO),比较其与KO小鼠的表型、细胞因子水平和信号通路变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | α-MEM培养基 | Gibco, Thermo Fisher Scientific | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Wisent | -- | |
| 细胞因子检测 | 小鼠磁珠多重因子检测试剂盒 | R&D Systems | -- |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | MilliporeSigma或RayBiotech | -- | |
| Western blot | 抗磷酸化酪氨酸抗体(4G10) | Millipore | 05-321 |
| 抗TLR2抗体(人) | Cell Signaling Technology | 12276 | |
| 抗TLR2抗体(小鼠) | Cell Signaling Technology | 13744 | |
| 抗磷酸化SRC抗体(Y416) | Cell Signaling Technology | 2101 | |
| 抗SRC抗体 | Cell Signaling Technology | 2109 | |
| 抗磷酸化SYK抗体(Y525/526) | Cell Signaling Technology | 2710 | |
| 抗SYK抗体 | Cell Signaling Technology | 2712 | |
| 抗磷酸化IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 2859 | |
| 抗IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 9242 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118 | |
| 抗NF-κB抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| 抗NF-κB抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 抗MyD88抗体 | MilliporeSigma | SAB3500472 | |
| 抗FLAG标签抗体 | MilliporeSigma | F3165 | |
| 抗Myc标签抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-40 | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| 抗HA标签抗体 | MBL International | M180-3 | |
| 抗PPP1R11抗体 | Abcam | ab171960 | |
| 抗3BP2抗体 | Abnova | H00006452-M01 | |
| Halt蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 药物处理 | SYK抑制剂 | Millipore | -- |
| PP2 SRC激酶抑制剂 | Selleckchem | -- | |
| BMS 345541 IKK抑制剂 | Selleckchem | -- | |
| RNA提取 | RNeasy Plus 微型试剂盒 | QIAGEN | -- |
| RT-qPCR | ImProm-II逆转录系统 | Promega | -- |
| Step One Plus 实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 免疫沉淀 | Dynabeads Protein A或G磁珠 | Life Technologies, Thermo Fisher Scientific | -- |
| GST pull-down | 谷胱甘肽琼脂糖凝胶4B | GE Healthcare | -- |
| Western blot | PVDF膜(Immobilon) | MilliporeSigma | -- |
| 免疫荧光 | DAPI染料 | Life Technologies, Thermo Fisher Scientific | -- |
| Aqua Mount封片剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 显微镜 | Olympus IX81倒置显微镜 | Olympus | -- |
| 组织学 | 抗F4/80抗体 | Abcam | ab6640 |
| 抗Mac2抗体 | Cedarlane | CL8942AP | |
| 抗CSF-1R抗体 | Abcam | ab215441 | |
| 抗CD45R抗体 | BD Biosciences | 550286 | |
| 抗MPO抗体 | Abcam | ab9535 | |
| 抗EPX抗体 | Biorbyt | orb5168 | |
| Simple Stain MAX PO检测系统 | Nichirei | -- | |
| DAB底物试剂盒 | Nichirei | -- | |
| 流式细胞术 | LSRFortessa X-20流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| FACSAria III细胞分选仪 | BD Biosciences | -- | |
| 抗原微阵列 | FAST硝酸纤维素膜载玻片 | GVS | -- |
| Cy3标记羊抗鼠IgG Fc二抗 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | -- | |
| Cy5标记羊抗鼠IgM二抗 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | -- | |
| Axon 4200A扫描仪 | Molecular Devices | -- | |
| 质谱分析 | Orbitrap Elite质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Q-Exactive质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Lumos质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| C18 StageTips | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 转染 | LipoD293 DNA体外转染试剂 | SignaGen Laboratories | -- |
| 报告基因实验 | NF-κB荧光素酶报告质粒 | Promega | -- |
| phRL-CMV对照质粒 | Promega | -- | |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- | |
| 脉冲追踪实验 | Click-IT蛋白质代谢标记试剂 | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | -- |
| AHA(甲硫氨酸类似物) | Invitrogen | -- | |
| Click-IT蛋白质反应缓冲液试剂盒 | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 生物素炔基 | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Dynabeads M-280链霉亲和素磁珠 | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 基因分型 | Wizard SV基因组DNA纯化系统 | Promega | -- |
| GoTaq Green预混液 | Promega | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和原代巨噬细胞 | BMDM分离和培养方法,培养基(α-MEM),FBS浓度,M-CSF条件培养基(CMG) 阅读提示:Methods中Cell culture部分 |
| 信号通路分析 | TLR2配体(HKSA/HKPG)浓度(107 cells/mL)和刺激时间(0-120分钟) 阅读提示:图1、7、8的图注和对应结果部分 |
| 小鼠模型 | 小鼠基因型(WT, Tnks-/-Tnks2fl/fl LysM-Cre, Tnks-/-Tnks2fl/fl Sh3bp2fl/fl LysM-Cre),年龄(12周龄) 阅读提示:Methods中Mice部分和图4-6的图注 |
| 蛋白质稳定性分析 | 脉冲追踪实验中AHA标记和追踪时间点 阅读提示:Methods中Nonradioactive pulse-chase assay部分 |
| 抑制剂处理 | SYK抑制剂浓度(10-50μM),PP2浓度(10μM),BMS 345541浓度(10μM),处理时间 阅读提示:图7和8的图注及方法部分 |