TTM单药处理BRAFV600E黑色素瘤细胞
验证TTM对细胞活力和MAPK信号的影响,并评估是否诱导凋亡。
用不同浓度TTM处理451-Lu、A375、WM88、WM983B细胞,检测细胞活力(CellTiter-Glo)和凋亡(Annexin V/PI、CASPASE-3/PARP切割)以及MAPK通路磷酸化水平。
Inhibition of BCL2 Family Members Increases the Efficacy of Copper Chelation in BRAFV600E-Driven Melanoma
包含体外细胞活力筛选、凋亡检测、基因敲低、异种移植瘤模型及体内药效评估,并涉及耐药细胞系和机制验证。
A375细胞 WM88细胞 451-Lu细胞及耐药衍生物
TTM与BH3 mimetic联合处理的剂量和时间 BCL2家族蛋白(BCL-W、BCL-XL、MCL-1)的敲低或抑制 细胞活力检测方法(CellTiter-Glo)及处理时间 凋亡检测方法(Annexin V/PI、CASPASE-3和PARP切割) 异种移植瘤模型中的给药方案(TTM、ABT-263、MAPKi)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TTM对细胞活力和MAPK信号的影响,并评估是否诱导凋亡。
用不同浓度TTM处理451-Lu、A375、WM88、WM983B细胞,检测细胞活力(CellTiter-Glo)和凋亡(Annexin V/PI、CASPASE-3/PARP切割)以及MAPK通路磷酸化水平。
识别与TTM协同抑制BRAFV600E黑色素瘤细胞活力的生物活性化合物。
在A375和WM88细胞中进行2123种生物活性化合物库的高通量筛选,结合IC20浓度的TTM,计算Bliss指数识别协同组合。
验证选定的BH3 mimetics与TTM联合对细胞活力和凋亡的影响。
在A375和WM88细胞中联合TTM与ABT-737,检测细胞活力、凋亡标志物,并计算Bliss Index。
确定哪些BCL2家族蛋白的抑制增强TTM敏感性。
使用Dox诱导的shRNA敲低BCL2家族成员,或用BH3 mimetics抑制,检测TTM IC50的变化。
阐明TTM与BH3 mimetics联合诱导凋亡的分子机制。
免疫印迹检测BCL2家族蛋白表达和MAPK磷酸化,检测线粒体细胞色素c释放,并评估CASPASE抑制剂的影响。
测试TTM与BH3 mimetics联合是否能克服MAPKi耐药。
在亲本及耐药细胞系(451-Lu-BRAFiR、451-Lu-MEKiR等)中,评估TTM、MAPKi和ABT-737组合的细胞活力和凋亡。
评估TTM与ABT-263联合在体内对肿瘤生长的影响。
建立A375、451-Lu及耐药细胞系的皮下异种移植瘤模型,给予不同药物组合,监测肿瘤体积、增殖和凋亡标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | GE Lifesciences | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 细胞活力检测 | CellTiter-Glo®细胞活力检测试剂盒 | Promega | G7571 |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒I | BD Biosciences | 556547 |
| 流式分析 | Attune NxT流式细胞仪 | Thermo Scientific | -- |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| Halt™蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Scientific | 78441 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | -- | |
| 抗磷酸化(Thr202/Tyr204)-ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| 抗ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9107 | |
| 抗磷酸化(Ser217/221)-MEK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9154 | |
| 抗MEK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4694 | |
| 抗PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9542 | |
| 抗切割PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9541 | |
| 抗CASPASE-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662 | |
| 抗β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 3700 | |
| 抗BCL2抗体 | Cell Signaling Technology | 4223 | |
| 抗BCL-W抗体 | Cell Signaling Technology | 2724 | |
| 抗BCL-XL抗体 | Cell Signaling Technology | 2764 | |
| 抗MCL-1抗体 | Cell Signaling Technology | 94296 | |
| 抗细胞色素c抗体 | Cell Signaling Technology | 11940 | |
| 抗HSP60抗体 | Cell Signaling Technology | 4870 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 3873 | |
| 山羊抗兔IgG二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 山羊抗小鼠IgG二抗 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| SignalFire ECL检测试剂 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 线粒体分离 | 线粒体/胞浆分离试剂盒 | BioVision | K256 |
| 药物处理 | 四硫代钼酸盐 | Sigma-Aldrich | 323446 |
| ABT-737 | Selleck Chemicals | S1002 | |
| ABT-263 | AbMole | M1637 | |
| ABT-199 | Selleck Chemicals | S8048 | |
| WEHI-539盐酸盐 | ApexBio | A8634 | |
| A1210477 | ApexBio | B6011 | |
| 曲美替尼 | Selleck Chemicals | S2673 | |
| 维莫非尼 | -- | CT-P4032 | |
| 凋亡抑制 | Z-DEVD-FMK | Selleck Chemicals | S7312 |
| 基因敲低 | 盐酸多西环素 | Fisher Scientific | AAJ67043AE |
| 动物实验 | 甲基纤维素 | Sigma-Aldrich | M0512 |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 聚乙二醇400 | EMD Millipore | 8.07485.1000 | |
| Phosal 50PG | Lipoid | 368315 | |
| 免疫荧光 | 抗Ki67抗体 | Novus Biologicals | NB100-89717 |
| Alexa Fluor 647偶联的抗兔IgG | Thermo Scientific | A27040 | |
| DeadEnd™比色TUNEL检测系统 | Promega | G3250 | |
| 显微成像 | Leica DMI6000B倒置共聚焦显微镜 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活力检测 | 细胞系来源、培养条件、细胞数量、处理时间和药物浓度 阅读提示:详见Materials and Methods的Cell viability assay部分 |
| 凋亡检测 | 处理时间、Annexin V/PI染色条件、CASPASE-3/PARP检测 阅读提示:详见Materials and Methods的Flow cytometry和Immunoblot analysis部分 |
| 异种移植瘤模型 | 细胞数量、注射部位、治疗分组、给药剂量和方式、肿瘤体积监测 阅读提示:详见Materials and Methods的Mouse xenografts and drug treatments部分 |
| BCL2家族蛋白敲低 | shRNA序列、Dox诱导浓度和时间、感染方法 阅读提示:详见Materials and Methods的Plasmids部分和Figure 3图注 |
| 高通量筛选 | 细胞系、化合物浓度、TTM IC20、处理时间和筛选标准 阅读提示:详见Materials and Methods的High throughput small molecule library screen部分和Figure 2图注 |