DNA 甲基化概述
1、概述
“表观遗传学现在成为了肿瘤研究中的热点问题。我们现在已经很清楚肿瘤的形成都伴随着DNA甲基化和组蛋白的修饰异常。全基因组的低甲基化（hypomethylation），抑癌基因启动子CpG岛高度甲基化(hypermethylation)，众多关键基因的组蛋白密码被改变，以及组蛋白H4去已酰化和三甲基化，这些都是肿瘤细胞异常表观遗传谱的明显特征。人类表观组计划是对这一必要性的响应。“
CpG岛的最新定义：
1、片断长度≥500 bp（最近略有改动，有文章指出大于200bp），G+C的含量≥50％，CpG二核甘酸的实际观察值与期望值之比≥65％；大约70％的哺乳动物基因组CpG被甲基化，并常发生在重复序列区域；
2、相比较而言，没有甲基化的的CpG往往出现在看家基因和抑癌基因的启动子区域，并在基因的表达调控和细胞分化中起着决定性的作用。
参考：MMASS: an optimized array-based method for assessing CpG island methylation DNA
2、甲基化通过两种机制参与转录调控：
（1）DNA甲基化直接干扰了特异性结合蛋白与该识别序列的结合；
（2）组蛋白去乙酰化酶（Histone deacetylases, HDAC）或组蛋白甲基化转移酶（Histone methyltransferases）与甲基化位点上的结合蛋白（methyl-CpG binding proteins）的形成牢固、紧缩的核小体结构，间接的抑制基因的表达。
