实验问答

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科研学霸天团，48小时有问必答

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问单细胞测序多样本两组比较分析

loveliufudan

针对单细胞测序多样本的两组比较，您可以尝试使用以下工具和流程：差异基因分析工具：常用的差异基因分析工具包括DESeq2，edgeR，limma-voom等，您可以根据您的数据特点选择适合的工具。这些工具可以识别出在两个不同组别中表达显著差异的基因，从而帮助您了解它们的生物学意义和相关的通路信息。数据预处理：在进行差异基因分析之前，您需要对数据进行预处理，例如，质量控制，过滤低质量细胞和基因，归一化

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问Annexin V-FITC/PI染色出现假阳性？

sswei

在凋亡实验中，经常会出现假阳性或与预期结果不符的情况，可能的原因有补偿调节不当、细胞浓度过高、消化过度、药物干扰、药物处理时间过长、样本自身问题等多个方面，过度消化和机械损伤都会引起细胞膜的损伤，造成假阳性。

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问有没有做磁珠分离大鼠肺组织肺间质巨噬细胞的老师呢

loveliufudan

下面是一些可能适用于您的实验室的试剂盒和磁珠供您参考：大鼠肺间质巨噬细胞磁珠分离试剂盒，例如 Miltenyi Biotec 公司的大鼠肺间质巨噬细胞分离试剂盒。这个试剂盒采用磁珠分离技术，能够高效地纯化大鼠肺组织中的巨噬细胞。Dynabeads 公司的 CD11b+ 磁珠。这种磁珠可以选择大鼠 CD11b+ 阳性细胞，包括肺间质巨噬细胞等，从单细胞悬液中高效纯化。大鼠巨噬细胞表面标记的特定抗体和

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问求助，生信分析怎么做呀？

loveliufudan

进行两个蛋白的生信分析需要根据具体情况选择不同的方法，以下是一些可能的方向和方法：蛋白质互作网络分析：可以通过蛋白质相互作用数据库（如STRING）或文献资料中已有的蛋白质互作信息，构建蛋白质相互作用网络，并分析两个蛋白在该网络中的位置和关系。基因表达谱分析：可以通过公共基因表达数据库（如GEO、TCGA等）或实验室自己的基因表达数据，筛选和比较两个蛋白相关的基因，进行差异分析和富集分析，了解其相

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问LPS诱导炎症模型用于后期实验是先做转染还是先诱导炎症

loveliufudan

在进行LPS诱导炎症模型后期实验时，一般的操作步骤是先诱导炎症，然后进行转染。这是因为LPS诱导炎症是一种化学物质处理的方式，能够诱导机体产生炎症反应，从而模拟实际的疾病情况，这是实验的基础。而转染则是在诱导炎症后对细胞进行基因转染，用于检测某些基因在炎症反应中的作用。具体而言，实验步骤可以如下进行：培养待处理的细胞系。给细胞系加入LPS，使其产生炎症反应。在产生炎症反应的同时，进行转染实验，将感

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问caspase1提蛋白时候，有什么特别的细节吗？，其他指标都很清楚，但是它爆出来就很淡

loveliufudan

在进行Caspase-1的蛋白提取时，有几个细节需要注意，这些细节可以帮助提高Caspase-1的检测灵敏度：细胞裂解条件的优化：不同的细胞类型和不同的实验条件可能需要不同的细胞裂解条件。一般来说，使用含有蛋白酶抑制剂的细胞裂解缓冲液可以提高Caspase-1的稳定性和活性。此外，应该注意避免过度处理细胞，以避免Caspase-1的降解和失活。样品保存和处理：样品的保存和处理可能会影响Caspas

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问cbioportal生信分析

loveliufudan

是的，cBioPortal可以分析某基因在不同子宫内膜癌分子分型中的表达差异。以下是步骤：进入 cBioPortal 的网站并选择 TCGA-UCEC 数据集。在左侧的“Quick Select”栏中，选择您感兴趣的基因名称，例如PAX8。点击“Case Sets”选项卡，选择您感兴趣的子宫内膜癌分子分型。点击“Charts”选项卡，选择您想要的表达分析类型，例如“mRNA Expression

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问单细胞测序seurat分析为什么合并样本分析后图还是五个导入样本

loveliufudan

在单细胞测序的分析中，合并多个样本可以增加数据量，提高分析的可信度和准确性。一般来说，单细胞测序实验的数据量较小，单个细胞的表达水平变化也较大，因此需要对多个样本进行合并，才能获得稳定的结果。对于您提到的情况，可能是因为在Seurat分析中，您在合并样本之前已经导入了五个样本，然后合并前两个样本，但是在后续的质控步骤中，您可能没有正确更新分析的对象，导致分析结果显示了所有五个导入的样本。您可以检查

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问骨关节炎与卵泡刺激素多肽序列

loveliufudan

最近的研究表明，FSHβ C末端多肽片段（FSHβ-CTP）具有潜在的药理活性，可以通过与FSHR结合来刺激卵巢激素的产生，从而调节生殖系统的功能。此外，一些FSH多肽片段也被用于治疗乳腺癌等癌症。因此，未来研究中可以考虑探索FSH多肽片段在治疗人类FSHR表达阳性的骨关节炎软骨细胞方面的潜在作用。需要进一步的实验和临床研究来评估这些分子在骨关节炎治疗中的应用前景。

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问如何判断CCK8的复孔是否差异过大需要舍去，根据标准差可以吗？

loveliufudan

可以使用一些统计方法来判断是否存在离群值，比如：计算每一组数据的平均值和标准差，以及所有组数据的平均值和标准差。使用z-score方法来检测离群值，将每个数据点的值减去其对应的组平均值，然后除以该组的标准差，计算得到z-score值。如果z-score值大于3或小于-3，则可以认为该数据点是离群值。如果存在离群值，则可以使用Grubbs' test进行检测。该检验可以计算得到可能的最大离群值，然后

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问FSH与F骨关节炎的关系

loveliufudan

据目前的研究，滑膜细胞中也存在FSHR的表达。事实上，FSHR的表达不仅局限于卵巢组织中，还可以在其他组织中找到。研究表明，FSHR在人类和动物的滑膜细胞中均有表达，并且其表达水平可能会受到关节疾病的影响。因此，如果您发现自己的软骨细胞表面有高表达的FSHR，那么在滑膜组织中也有可能存在FSHR的表达。

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问请问大家想要测定细胞中乳酸含量是测上清还是胞内的

loveliufudan

要测定细胞中的乳酸含量，需要分别测量细胞内和上清中的乳酸含量。通常来说，细胞内的乳酸含量比上清中的乳酸含量高。关于你提到的南京建成乳酸检测试剂盒测定乳酸含量的问题，如果上清吸光度很高而细胞内和空白对照吸光度差不多，可能有以下几种情况需要考虑：细胞破裂不充分：如果在细胞处理过程中，没有完全破裂细胞膜，就会导致细胞内的乳酸不能充分释放到上清中。这种情况下，上清中的乳酸含量会相对较低，而细胞内的乳酸含量

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问构建RAW264.7泡沫细胞模型应该用哪一种氧化低密度脂蛋白？

loveliufudan

构建RAW264.7泡沫细胞模型通常会使用不同浓度的氧化低密度脂蛋白（oxLDL），而选择使用哪种氧化低密度脂蛋白则取决于实验目的和可用资源。有多种方法可用于制备氧化低密度脂蛋白，例如CuSO4法、AAPH法和MPO法等。其中，CuSO4法是最常用的方法之一，它通过在氧气存在下使用CuSO4氧化LDL制备氧化LDL。在选择氧化LDL时，应考虑其质量和活性。通常情况下，使用含有高水平氧化物的氧化LD

3 回答433 围观

问请教trizol法提取外泌体RNA该如何弄。

loveliufudan

以下是Trizol法提取外泌体RNA的步骤：收集外泌体：用离心或超声波等方法收集培养基或生理液中的外泌体。建议在收集前，预先处理样品，如去除细胞残留物、碎片等。加入Trizol：向外泌体悬液中加入 Trizol 试剂，建议加入试剂体积是悬液体积的 10% 到 20%。轻轻摇晃管子使 Trizol 均匀分散。加入氯仿：加入氯仿等有机溶剂，摇晃离心管混合均匀。离心管在室温下放置5-10分钟，让混合物充

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问平板制作

sswei

一般来说，涂布培养常用的涂布量是100ul，也就是0.1ml。平时100~200ul涂布起来比较舒服。

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问倾向性评分匹配求助

loveliufudan

SPSS和R都可以用于处理和分析多分类变量。事实上，SPSS作为一种广泛使用的统计软件，也可以支持处理多分类变量。您可以使用SPSS的分类变量功能来对多分类变量进行编码和分析。SPSS还提供了各种多变量分析技术，如多元方差分析（MANOVA）、逐步回归分析、主成分分析（PCA）等等，可以用于处理多分类变量和其他变量。R作为一种开源的统计软件，也提供了广泛的支持多分类变量的函数和包。R具有更大的灵活

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问R语言的cox预测模型的校准曲线

loveliufudan

似乎是在 calibrate 函数的调用中出现了问题。具体来说，错误信息中提示说您必须在原始拟合函数中指定 x=T 和 y=T，但是在您的代码中并没有明确指定这些参数。因此，您需要检查以下几点：在 cph 函数的调用中，您是否明确指定了 x=T 和 y=T。这两个参数分别指定是否返回风险比例和生存概率，是 calibrate 函数需要的参数之一。检查 calibrate 函数的调用中是否有语法错误

2 回答943 围观

问总氮检测

loveliufudan

总氮标曲中需要对标液进行稀释测定是因为标液中的氮浓度一般都很高，如果直接使用未稀释的标液测定，可能会导致测量结果超过光度计的量程，从而无法准确测定标液的吸光值。此外，如果未稀释的标液的空白吸光值很大，那么直接使用未稀释的标液测定也可能会导致误差增大，影响测量结果的准确度。

3 回答441 围观

问求助|文章相关|如何分辨时间序列研究和病例交叉研究？

loveliufudan

时间序列研究是一种纵向研究，旨在研究一个或多个变量随时间的变化趋势，通常是通过收集一系列时间点上的数据来进行分析。这种研究设计通常应用于研究时间趋势、季节性变化、政策干预效果等问题。例如，研究空气污染对呼吸系统疾病发生率的影响，可以收集多年来的每日空气污染指数和呼吸系统疾病发生率数据，然后进行时间序列分析。病例交叉研究是一种横向研究，旨在研究一个或多个因素与疾病发生的关系，通常是通过收集患者的病史

3 回答841 围观

问肿瘤专业投稿经验

loveliufudan

您可以尝试以下方法来找到帮助修改文章的老师或网站：寻找专业的写作辅导机构或论文编辑服务，这些机构通常会提供专业的写作和编辑服务，帮助您修改文章并提高文章的质量。在线寻找专业的写作指导网站或社区，如Academia.edu、ResearchGate等。这些网站通常会有专业的学者和编辑提供帮助和建议。联系相关专业领域的学者或医学专家，请求他们给予您的文章评价和修改建议。寻找志同道合的作者或论文写作小组

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