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细胞培养
土井挞克树
胎儿生长受限受多方面因素调控,可能是孕激素,细胞通常采用胚胎细胞研究
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问
求助|大鼠胰腺星状细胞分离提取
土井挞克树
可以增加消化酶的浓度或者延长消化时间
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问
时空组学:比起组织显微切割细胞进行空间检测,GeoMx DSP 有什么优势吗?
sswei
DSP技术最大的特色在其“靶向性”,它可以靶向研究组织切片目标区域基因/蛋白表达特征,预先缩小了研究范围,极大提高了研究效率。这一点主要依赖于DSP与多重免疫荧光技术的融合,通过对切片的多重免疫荧光染色,预先了解切片的形态学特征,用户可以根据自己的研究目的针对性圈选目标区域进行测序分析,直接获取目标信息,有效规避了全切片无差别检测所带来的数据挖掘的压力,这一点也是DSP与10X Visium空间转
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问
时空组学中数字化空间蛋白质组检测时,对于标本要求是什么啊?要不要提前加入什么抗体啊?
sswei
样品准备的基本原则1、代表性和一致性原则,2、迅速性原则,3、低温原则。
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问
若要反映细胞增殖能力和活力是否可以只绘制生长曲线而不计算克隆生成率
z流沙z
可以,生长曲线反应细胞增殖能力,克隆形成主要反应细胞成瘤能力
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问
测定药物对细胞增殖抑制的实验
z流沙z
可以只做其中一个,文献中使用多种方法做实验主要是为了多方面证明,另外一个是体现工作量
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问
LDH检测细胞活力,两次检测的OD值结果差别大
z流沙z
可能是计数不够精准导致铺板的细胞量不一样,也有可能是细胞活力的差别
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问
测序后,核酸序列比对是载体序列,蛋白比对可以比对出来,请问测序结果合适吗?
z流沙z
有可能是载体比较长,测序还没有测到目的序列,可以测通或者反向测序
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问
小鼠胰腺癌细胞panc02有没有同学养过呀,有没有低密度时候的照片呢 为什么不同厂家推荐的培养基不同呢?
z流沙z
可以去ATCC上面查询,有细胞照片和培养基等信息
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问
时空组学有哪些测序方法?以及这些测序方法的对比
sswei
(1)空间重构的计算策略空间重构的计算方法可以充分地利用内在基因表达模式或共表达的趋势,从单个细胞的大量转录组的数据中重现细胞和环境的总体布局。(2)基于激光捕获显微切割技术(LSM)结合高通量基于LSM的转录组学和基因组学成功地获得了单个细胞的空间转录组,可以将少量细胞的数据粗略地整合入组织或器官的背景当中;但其通量很低。(3)基于图像的原位转录组学基于图像的转录组学增加了可检测区域,但问题在于
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问
时空组学最主要的应用方向是什么?
sswei
时空组学技术是一种新兴的技术,它将时间和空间信息结合起来,通过对大量数据的分析和挖掘,可以揭示出生物体内的复杂生物学过程。这种技术的应用范围非常广泛,可以用于研究基因表达、蛋白质组学、代谢组学等多个领域。
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问
时空组学和空间组学有什么区别?
sswei
空间组学技术深入了解细胞功能、表型和组织微环境中位置的关系等信息而生。而在空间转录组学技术的基础上叠加不同时间点取样,则能为研究者提供时间及空间两个维度的信息,因此被称为「时空组」技术。
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问
用PLKO.1构建knockdown质粒,然后包病毒感染A375,使用puro杀完后传个三四代细胞就自己死了,这是为什么?
z流沙z
首先需要对细胞摸索药筛浓度,然后转染后药筛3-5d就恢复正常培养
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问
各位大佬好,不知道为什么我跑出来的电泳带子是歪的,180v 20min,之前夜出现过一次,后来没出现,现在又出现了,
z流沙z
胶要溶解好,然后电压不要太高,120v左右就差不多了
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问
单因素分析求助
sswei
部分未检测的患者不能纳入单因素分析,否则会造成数据错误。
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问
roc曲线问题
sswei
ROC曲线图是反映敏感性与特异性之间关系的曲线。横坐标X轴为 1 – 特异性,也称为假阳性率(误报率),X轴越接近零准确率越高;纵坐标Y轴称为敏感度,也称为真阳性率(敏感度),Y轴越大代表准确率越好。根据曲线位置,把整个图划分成了两部分,曲线下方部分的面积被称为AUC(Area Under Curve),用来表示预测准确性,AUC值越高,也就是曲线下方面积越大,说明预测准确率越高。曲线越接近左上角
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问
qPCR | Undetermined
z流沙z
部分目的基因表达量低,就没有测出来,这些基因就不适合稀释
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问
MDCK狗肾细胞形态问题,中间有圆圈
z流沙z
这应该是混入了其他细胞,细胞不纯导致的。可以尝试多稀释一下细胞,或者根据不同细胞的消化时间逐步消化去除
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问
多糖促进肿瘤细胞凋亡,qpcr细胞周期趋势为逆的
z流沙z
可以考虑换一个内参试试,比如actin,GAPDH可能不适合于细胞周期实验
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求助:NF-κB通路激活后检测靶基因
z流沙z
理论上转染后24h即可,但需要考虑转染这个质粒后是否能够激活NF-KB?还是得需要LPS能激动剂?
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