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        细菌胞外囊泡提取要超滤吗?提取多少量的培养液才够做一些基础实验,WB、PCR这些?

        相关实验:病原微生物染色实验

        user-title

        dxy_8n1kmuy9

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        2 个回答

        user-title

        鱼小

        有帮助

        通常需结合差速离心+超滤浓缩以获得足够纯度与浓度,基础实验建议起始培养液至少500 mL–2 L(小规模WBqPCR、纳米颗粒分析够用),具体体积取决于菌种产率与下游灵敏度。  你可以讲的更具体一点。

        user-title

        萧莣苼

        有帮助

        1. 细菌胞外囊泡提取建议做超滤:细菌 EV 在培养液里的浓度比哺乳动物细胞外泌体还低,先 0.22 µm 过滤去掉残菌和大碎片后,上清体积往往 50-500 mL,直接往下做超速离心耗时且回收率低。

        用 100 kDa 离心超滤管(50 mL→1 mL,50× 浓缩)可先把体积缩小,再 100 000×g 超速离心,沉淀量明显多,后续 WB/NTA 更容易出信号。

        2. 用量
        最小起始体积:细菌分泌量与菌株、诱导条件有关,经验值如下(按常规 LB,37 ℃,OD600≈0.8,Tween-20 或缺铁诱导 2 h):

        WB(1-2 个膜蛋白 marker,如 OmpA、OmpF):

        20-30 mL 培养液 → 超滤浓缩至 0.5 mL → 超速离心 → 20-30 µL PBS 重悬 → BCA 约 20-40 µg 总蛋白,上样 5-10 µg/孔即可跑胶。

        qPCR(提取 EV-RNA,测 16S 或囊泡内 RNA 片段):

        50 mL 培养液 → 浓缩后超速离心 → RNA 抽提得率 5-15 ng,做 20 µL 逆转录体系足够,qPCR 可连续测 10 个以上基因。

        NTA 粒径/浓度、TEM 形态:

        同上 50 mL 起始,最终 100 µL 重悬,稀释 100-1000×后检测,颗粒数 1×10^9-1×10^10 /mL,刚好在 NS300 检测线性范围。

        若菌株分泌能力弱(如革兰阳性菌),或要做蛋白组/质谱,建议 200-500 mL 起步,并采用“超滤+超速离心”两步法,可把总蛋白提到 100-300 µg,足够跑 1 块 SDS-PAGE 胶做 LC-MS/MS 。

        做 WB/PCR 的“入门级”实验,30-50 mL 细菌培养液 + 0.22 µm 过滤 → 100 kDa 超滤浓缩 → 100 000×g 超速离心 是最常用、最省钱、信号也够的方案;超滤不是绝对必须,但能显著提高回收率和实验成功率 。

         

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