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        iTRAQ/TMT和Label-free技术都有哪些优缺点?

        相关实验:DNA 甲基化分析

        user-title

        Eason老歌迷

        如题,想做蛋白组学,可以交流。

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        3 个回答

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        iTRAQ/TMT和Label-free都是蛋白质组学研究中常用的定量技术,它们各有优缺点:


        iTRAQ/TMT的优点:


        1. 可以在同一实验中标记和定量多个样本,提高实验效率。


        2. 标记后样本混合检测,有利于减少技术误差。


        3. 标记反应简便,易于操作。


        4. 标记覆盖面广,可以定量绝大部分肽段。


        iTRAQ/TMT的缺点:


        1. 需要额外的标记实验步骤,增加实验复杂度。


        2. 标记试剂价格较高,会增加实验成本。


        3. 标记物会影响碎裂模式,使数据分析更复杂。


        Label-free的优点:


        1. 不需要额外标记,操作简便。


        2. 可以进行高补全比定量。


        3. 价格低廉。


        Label-free的缺点:


        1. 需要分样分别检测,技术误差较大。


        2. 定量覆盖范围有限,仅可以定量在各样本中都检测到的肽段。


        3. 需要复杂的生物信息学分析。


        4. 对仪器稳定性和精度要求较高。


        根据研究需要选择适合的方法,充分发挥其优势,弥补不足。

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        (1)定量准确性: iTRAQ/TMT的定量准确性和重现性要明显优于Label-free, Label-free的样本之间不能直接混合,导致定量的结果受到的影响因素多,因此定量结果的准确度较低;

        (2)鉴定通量:Label-free通量相对较高,而iTRAQ/TMT由于标记基团的影响,鉴定通量较label-free低;

        user-title

        sswei

        有帮助

        Label Free优点

        (1)不需要对蛋白质进行标签标记,样品前处理程序简单;

        (2)实验成本较低,投入产出比较高;

        (3)不受样本限制,且通量相对较高;

        (4)可鉴定泛素化修饰定量组学。


        Label Free缺点

        (1)样本之间不能直接混合,可能造成富集不平行,质谱重复性低,导致定量的结果准确性较低;

        (2)需要对原始数据进行复杂的预处理才能提取离子信号强度信息。


        iTRAQ优点

        (1)修饰肽段的富集是各组标记、混合后同时进行的,数据重现性好,灵敏度高,定量结果较准确;

        (2)对样品要求量低,且不受样品来源限制。


        iTRAQ缺点

        (1)需要使用同位素标签,实验成本较高;

        (2)通量较Label Free 低,一次性最多只能检测10种样品;

        (3)在标记过程中可能会引起蛋白结构变化,产生相应的实验误差。


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