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蛋白结合为什么荧光公定位能做出来免疫共沉淀不行?

相关实验:免疫共沉淀(Co-IP)

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丁香实验

IP两次都没结果,为什么?

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26 个回答

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是小杨同学

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我觉得可以试一下加大样本量呢,沉淀的蛋白量可能有多少,然后可以试一下优化ip条件
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lzy必有我师

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IP是金标准,IF是辅助,可能原因1.免疫荧光假阳性;2.免疫共沉淀试剂盒的特异性不够,结合不上或者结合不牢;3.洗脱过程中,洗脱力过强或者洗脱次数过多,把目标蛋白也洗脱了
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dxyhsx123

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荧光公定位和免疫共沉淀不是所有的蛋白都能同时做出来的,一些蛋白相互作用,会暴露出一些位点,体外一处理,就会变化,再加上一些抗体的特异性差,结果很不确定。
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内科小护士

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可以尝试优化一下IP条件,或者使用其他检测蛋白互作的方法。
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dxy_pggo2lp2

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如果IF可以做出来,IP做不出来可能是假阳性。IF上看见有共定位,可能是的细胞在那一刻两个蛋白刚好在空间上是处于同一位置,不能说两个蛋白有相互作用。IF是IP的辅助,IP是金标准。如果文献报道是互作蛋白,建议纯化提高蛋白浓度重复
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JCorona

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可能的原因:1.免疫荧光假阳性;2.免疫共沉淀试剂盒的特异性不够,结合不上或者结合不牢;3.洗脱过程中,洗脱力过强或者洗脱次数过多,把目标蛋白也洗脱了
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医往情深丁香园

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将洗脱液用于IB检测目的蛋白是否被拉下,确保工作后再进行后续实验。
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vae1476

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免疫共沉淀需要更多的蛋白量,考虑加大样本量再试试
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此用户已注销

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首先确认你的抗体能否用来做共沉淀,其次两个蛋白可能受其他因素影响,例如磷酸化等。
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dxy_50tk4bh8

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沉淀的蛋白量少,免疫共沉淀没有达到足够的量,而荧光比较灵敏,即使丰度低也可以检测到
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ZZDX-YILILI

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1.首先确定IP的抗体是否适合做IP,如果不适合,那抗体结合不上自然显示不出来。如何抗体合适摸索下投入的蛋白质和抗体的浓度,如果浓度都太低,最终显示不出来。 2.此外,共定位应该是细胞水平是检测,这种结合有可能是短暂的所以能看到有结合,但是蛋白互作类似体外实验,如果二者结合很弱在实验过程中外力影响就不一定能检测出来。
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dxy_bq4uxnd

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这要看你是怎么做的蛋白共定位,是直接用两个荧光抗体染色后观察共定位,还是bifc共定位,不论哪种共定位的方法,都存在假阳性,荧光的结果只是个参考,CO-IP结果才是比较准确的。
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dxy_qkedgrg7

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免疫荧光本来就不是很精确的验证蛋白互作的方法,一般都是先做co-ip,得出结果以后再做免疫荧光充实你的实验数据
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一支肾上腺素

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可能的原因,长时间高功率的超声有可能导致蛋白变性,如果你的抗体识别的是蛋白的空间表位,那就有可能拉不下来。
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dxy_h7vcp8v3

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这是两种不同的实验方法。检查后者的实验条件是否正确,是否因为实验条件不合适造成实验无期望结果。建议,如果还想做两个蛋白互做,可以采用ITC的方式进行检测。
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jey1235

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荧光定位实际上是一种空间定位,不一定提示有真实的相互作用,如果有其他实验证明存在相互作用,IP不到有可能是IP的抗体或者效率存在问题。 建议共转这两个蛋白,看一下在细胞的表达情况,确定之后再用合适的抗体比如标签抗体一般出问题的情况不常见。
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zxb597

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免疫共沉淀是建立在蛋白复合物成员间紧密结合的基础上,特点天然状态,还有蛋白复合物
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dxy_4uyyu09r

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荧光共定位有高清图吗?这个要求挺高的,其实普通的分辨率下很有可能是假的,我们之前的经验就有一个看上去共定位很强,后来换了新的仪器测就能看出来并没有共定位,ip做不出来的时候,如果抗体没问题,表达量也还可以就要多考虑这个原因!
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dxy_w4oj7yoe

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一方面,有共定位不一定有互作,或者说可能是互作比较弱,IP的buffer条件不合适,把弱互作的蛋白洗下来了,可以尝试优化一下IP条件,或者使用其他检测蛋白互作的方法,比如说酵母双杂,BiFC等
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隔壁家的小夜猫子

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荧光共定位只能显示出位置上在一起,并不能说明两者是直接结合,而且免疫荧光染色本身就有很多背景。当然IP的条件是可以优化的,比如调整一下盐浓度和洗脱条件,让一些结合力比较弱的也能IP下来,如果调整了之后还是没有结合,只能说荧光共定位的结果并不真实。
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