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        CHIP超声摸条件

        相关实验:用T4 RNA 连接酶连接 RNA 分子

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        准备做CHIP实验,正在摸超声破碎条件,用的设备是新芝(scientz)超声破碎仪,设置超声功率20%,超3s,停10s(即5次/min),超声结束后想看一看破碎后的DNA大小(准备打碎到500-800bp大小),用了三种方法跑琼脂糖胶得到的结果不太一样,其中方法一得到的条带感觉像RNA条带,所以方法三加RNaseA处理后再提。不知道该信那种,特请教园子里CHIP高手帮忙看下,谢谢。

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        2 个回答

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        蓝莓小布丁

        有帮助

        您超声摸条件的预实验没问题,方法三加Nrasea可以一试。

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        在进行CHIP实验中,使用新芝超声破碎仪设置20%的超声功率,超3s,停10s(即5次/min)可能不够达到您想要的500-800bp大小。您可以尝试增加超声时间或加大超声功率。

        对于破碎后的DNA大小的检测,琼脂糖胶电泳是一种常用的方法,但结果可能会因为提取和制备方法不同而有所差异。您可以尝试使用其他方法,如高效液相色谱(HPLC)或限制酶切割来确定DNA大小。

        由于您提到方法一得到的条带感觉像RNA条带,所以使用方法三加RNaseA处理后再提取是一个不错的选择。

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