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        引物设计

        相关实验:引物设计和末端标记实验

        user-title

        dxy_15c164e

        请问pre-miRNA和pri-miRNA引物怎么设计

        wx-share
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        2 个回答

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        设计pre-miRNA和pri-miRNA的引物需要注意以下几点:

        确定目标序列:首先需要确定目标miRNA的pre-miRNA或pri-miRNA的序列,可以通过基因组浏览器等工具获取。

        引物长度:通常选择长度为18-24bp的引物。

        Tm值:引物的Tm值需要在50-65摄氏度之间。

        特异性:引物需要具有较好的特异性,避免引物与非目标序列的杂交。

        引物设计软件:可以使用一些在线或离线的引物设计软件,例如Primer3、OligoCalc等,这些软件可以根据以上要求自动设计引物。

        引物设计策略:根据不同的miRNA类型,可以采用不同的引物设计策略。对于pre-miRNA,通常选择在其上下游设计引物,以确保引物能够特异性地放大pre-miRNA序列;对于pri-miRNA,由于其较长,可以选择在序列的两端设计引物,或者选择一些保守的区域进行引物设计。

        总之,引物设计需要结合实验的具体情况进行,可以通过试验不同的引物进行优化。

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        pre-mir 可以直接从mirbase 找到序列,它本身就有个颈环,有80来bp,所以你设计引物的话,就上下各取一段就可以的

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