• 我要登录|
  • 免费注册
    |
  • 我的丁香通
    • 企业机构:
    • 成为企业机构
    • 个人用户:
    • 个人中心
  • 移动端
    移动端
丁香通 logo丁香实验_LOGO
搜实验

    大家都在搜

      大家都在搜

        0 人通过求购买到了急需的产品
        免费发布求购
        发布求购

        请问引物序列在NCBI blast后的结果如何解读?

        相关实验:PCR 引物设计及评价实验

        user-title

        芒果遇上梨

        如图中所示,输入引物序列后,查询到该引物在模板DNA上匹配到的位置范围,而这个范围内的碱基是合引物序列互补呢?还是与引物序列一致?如果是互补,按照DNA从5'到3'端合成的原则,前向引物对应的模板应该是3'到5'端 所以应该是1139到1119,而不是图中的1119到1139(5'到3'端);如果是序列一致,而后向引物对应的模板应该是5'端到3'端 所以应该是1281到1301,而不是1301到1281(5'端到3'端)图片描述

        wx-share
        分享

        3 个回答

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        如果是序列一致,而后向引物对应的模板应该是5'端到3'端也就是1281到1301

        user-title

        juyue2010

        有帮助

        显示的是引物序列,都是5’到3’序列

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        NCBI BLAST会根据输入的引物序列,在目标数据库中搜索与之匹配的模板序列。输出结果中,包含了引物匹配到模板上的位置范围。这些位置范围中的碱基序列是与引物序列互补的,而非与其相同。

        在这个结果中,Forward primer 1 匹配到了模板的 1139 到 1119 的位置范围,而 Reverse primer 1 匹配到了模板的 1301 到 1281 的位置范围。这些位置范围中的碱基序列是与引物序列互补的,而非与其相同。这意味着 Forward primer 1 对应的模板序列应该是从 3' 到 5' 的方向,而 Reverse primer 1 对应的模板序列应该是从 5' 到 3' 的方向。

        因此,你所提出的推断是正确的。Forward primer 1 对应的模板应该是从 1139 到 1119,而 Reverse primer 1 对应的模板应该是从 1281 到 1301。

        ad image
        提问
        扫一扫
        丁香实验小程序二维码
        实验小助手
        丁香实验公众号二维码
        扫码领资料
        反馈
        TOP
        打开小程序