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        设计引物时酶切位点的保护碱基一定要在两侧加吗,酶切后的残留碱基要添加保护碱基使之是3的倍数吗?

        相关实验:PCR 引物设计及评价实验

        user-title

        dxy_kn3xxo30

        另外,请问Sal I Af III Age I Hpa I 的保护碱基一般都是什么呢?

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        4 个回答

        user-title

        bamboopiggy

        有帮助

        设计保护碱基一般是2-3个就可以,主要为了平衡primer的GC含量

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        1.在设计引物时,一般考虑在酶切位点的两侧加入保护碱基。这样可以避免非特异性酶切,提高引物的特异性。

        2.在酶切后的残留碱基上添加保护碱基并不是必须的,但是添加3'或5'端的保护碱基可以增加引物的稳定性。

        3.Sal1, AflII, AgeI, HpaI 是四种常用的酶,它们的保护碱基一般是G/C和A/T。

        Sal1 保护碱基是 G/C

        AflII 保护碱基是 A/T

        AgeI 保护碱基是 G/C

        HpaI 保护碱基是 C/G

        这些保护碱基是酶切位点的共同特点,在设计引物时需要避免这些位置。


        user-title

        huarenqiang5

        有帮助

        设计引物时酶切位点的保护碱基要在两侧加。

        user-title

        简简单单的8872

        有帮助

        可以去NEB官网搜索或者直接百度搜索限制性内切酶保护性碱基,有详细的每一种内切酶的保护性碱基

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