miRNA,cicrRNA的引物设计与编码RNA有什么不同呢？

2. 研究时命名规则不同
miRNA相对来讲，研究较多，也有一套广为人知的命名体系。一个系统命名包含三部分内容，即物种，microRNA类别，序号。三者间用短线连接。物种一般用三个小写字母表示，如hsa,mmu和rno分别代表人，小鼠和大鼠。MicroRNA类别是指所命名的microRNA是pre-miRNA还是mature miRNA。pre-miRNA用mir表示，mature miRNA用miR表示。序号为一阿拉伯数字，c先后。一般而言，数字越小，发现越早。
3. 研究物种选择需谨慎
miRNA一般物种保守性较好，就是说，在人和鼠上，都是同一个序列，可以做鼠的实验，来推测在人身上的功能。circRNA 的表达水平具有种属、组织、时间特异性，序列保守性比一般的线性lncRNA 高，和miRNA一样，可以用同一个序列去研究人和鼠。而lncRNA，物种的保守性就比较差一些了。

4. 研究方法选择不同
miRNA较短，稳定性好，不易被破坏。针对它的表达，可以选择Northern印迹法，微点阵分析和荧光定量PCR。lncRNA长度较长，做Northern印迹的难度较大，一般选用荧光定量PCR或者荧光原位杂交。circRNA和lncRNA一样，一般选用荧光定量PCR或者荧光原位杂交。

研究RNA时，常常需要进行过表达和沉默操作。miRNA 很小，转染操作较方便，过表达的时候可以用mimics（模拟物），沉默的时候可以用inhibitor（抑制物）。用质粒或者病毒都可以达到稳定转导的效果。但是，对于lncRNA和circRNA就不一样了。核定位的 lncRNA 如果用 RNAi 技术，可能效果是很差的，因为 RNAi主要在细胞浆发挥作用。替代的方式可以用 CRISPR 基因编辑技术，直接把lncRNA 的基因给knockout。这里需要注意的一点是，circRNA是环状RNA，虽然在研究手段和机制上面，大多和lncRNA相类似，已知的circRNA作用模式也和某些lncRNA一样，通过分子“海绵”的模式与miRNA结合来发挥作用的，但是它需要论证成环的问题。