求助引物设计实验中要找细菌的特征性序列的步骤

你所说的细菌特征性序列是指特定种属还是特定菌株？特定种属的话可以直接找论文看大家用的比较多的。特定菌株的得需要全基因组测序你自己比对查找了。

首先要对相应序列进行比对，blast，找到特异位点或区间，然后再根据位点或区间设计相应PCR引物进行扩增，如果仅有位点是特异的，可将位点设计为引物的3‘端，如果是一段DNA特异，只要扩增这一段就可以了。