RT-PCR的数据处理方法如何选择？

常用的相对定量数据分析方法有双标曲线法， ΔCt法， 2-ΔΔCt法(Livak法)，用参照基因的ΔCt法和Pfaffl法。

对比如下图：

1. 双标曲线法：每次实验都分别用标准品做内参基因和目的基因的标准曲线， 并同时扩增各待测样本中的目的基因和内参基因。然后使用标准曲线来计算待测样本中的目的基因和内参基因的表达量。最后使用如下公式得出目的基因表达差异。双标曲线法不受扩增效率差异的干扰。但是对每一个基因，每一轮实验都必须做标准曲线，而且必须有固定的标准品做标准曲线。

2. ΔCt 法：不用内参基因作为标准，实验设计简单，数据分析处理简单。需要准确量化初始材料（如细胞数目或核酸微克数），扩增效率为 100%。计算公式如下：2‐ΔCt=2‐（实验组 Ct‐对照组 Ct）

3. 2‐ΔΔCt法：这是最常用的进行相对基因表达分析的方法，得到的结果是实验组中目的基因相对于对照组中目的基因表达的差异倍数。要求目的基因和内参基因的扩增效率都接近100%，且相对偏差不超过5%。

4. 用参照基因的ΔCt 法：这个方法的使用前提与2‐ΔΔCt法相同。

看你的实验目的，一般都是用ΔΔCT法的。