miRNA和mRNA的测序区别?

mRNA组就是测某个条件下的mature mRNA，mRNA有一个Poly-A tail，mRNA测序文库构建时，利用「oligo(dT)磁珠能特异结合Poly-A tail」的原理，特异地将mRNA从总RNA中分离出来实现富集。

而「miRNA作用测序」主要是沉默mRNA以实现「调控基因表达」

「转录组」（Transcriptome）是组织中单个或一组细胞某个状态下DNA转录出的所有RNA集合，所有RNA可分为「编码RNA」（mRNA）和「非编码RNA」（miRNA , piRNA, SiRNA, SnRNA,lncRNA, NAT, eRNA, circ RNA, ceRNAs等等）。

一般所说的「转录组测序」仅指mRNA测序，实际研究中转录组测序按目的不同还会细分，如mRNA测序（Messenger RNAs）、miRNA测序（microRNAs，small RNA中研究的最多的的一种）、lncRNA测序（Long noncoding RNAs）、circRNA测序（Circular RNAs）、【单细胞转录组、空间转录组、三代测序的全长转录组、无比对参考基因组的无参转录组、物种进化相关的比较转录组与泛转录组测序、特定环境的宏转录组等等】。

mRNA组就是测某个条件下上图中的mature mRNA，从上图可看出mRNA有一个Poly-A tail，mRNA测序文库构建时，利用「oligo(dT)磁珠能特异结合Poly-A tail」的原理，特异地将mRNA从总RNA中分离出来实现富集。「mRNA生信分析重点关注」case组和control组之间差异表达基因，也会做基因与蛋白互作、新转录本预测、可变剪切、基因融合等方面分析。

miRNA组

「miRNA作用机制」主要是沉默mRNA以实现「调控基因表达」，植物和动物中作用机制不一样，上图为植物中miRNA的作用机制（剪切以降解mRNA或者抑制翻译）。

「miRNA建库方式」有别于其它组学，主要是利用其长度分布在20 nt左右，文库构建时「切胶回收」该范围的条带，条带中还包含rRNA，siRNA，piRNA，tRNA等非编码RNA，所有后续分析会使用Rfame数据库，miRBASE来剔除非miRNA。

「miRNA生信分析重点关注」case组和control组之间差异表达miRNA，差异表达miRNA的靶mRNA预测，也会功能分析。

测序本身没区别，都是RNA的转录序列；只是RNA的分类不同