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科研学霸天团,48小时有问必答
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聚类分析和多重对应分析(MCA)
huarenqiang5
1.聚类通过把目标数据放入少数相对同源的组或“类”(cluster)里。分析表达数据。 (1)通过一系列的检测将待测的一组基因的变异标准化,然后成对比较线性协方差。 (2)通过把用最紧密关联的谱来放基因进行样本聚类,例如用简单的层级聚类(hierarchical clustering)方法。这种聚类亦可扩展到每个实验样本,利用一组基因总的线性相关进行聚类。 (3)多维
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meta分析直接把 发病率IRR 直接当成OR值进行比较
huarenqiang5
把发病率直接当成OR值进行比较肯定不合适。
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求教:Meta分析数据合并
loveliufudan
在这种情况下,您需要将A文献中的亚组合并为一个整体亚组,然后将所有文献中相应的影响因素整体进行比较。您可以使用元回归(meta-regression)或子组分析(subgroup analysis)来探究这些亚组之间的异质性,进而确定是否可以将这些亚组合并为一个整体亚组。此外,您还可以使用敏感性分析(sensitivity analysis)来检验不同的合并方法是否对最终结果产生影响。需要注意的是
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问
求问关于质粒转酵母的问题
huarenqiang5
考虑问题出在质粒上,首先需要对质粒进行电泳检测,电泳结果需为大小正确且明亮的条带;其次核对筛选培养基的选用和配制是否正确;排除上述因素,就需要复查酵母菌的外观气味是否正常,或者进行镜检。
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问
求助(要质粒的信该)
龙大人驾到
先介绍自己的实验目的和背景,让对方了解你的研究方向和需要。表达你对对方实验室的研究工作的兴趣,如果你能提到对方实验室的相关研究,会让对方更愿意帮助你。
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电镜分析
huarenqiang5
绿色和红色分别是溶酶体和蛋白颗粒。
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碱性氨基酸转移到蓝藻与大肠杆菌上
土井挞克树
可能性不高,真菌与动物的转导通路没有共同性,动物的酶通常不适用于真菌。
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连接产物转化大肠杆菌DH5α感受态致死的原因?
loveliufudan
产物转化后感受态大肠杆菌死亡的原因可能有多种,包括连接体系的DNA浓度过高或过低、连接反应时间过长或过短、连接体系的酶和缓冲液质量不佳等等。针对您提供的实验细节,我建议您考虑以下几点改进:调整连接体系的DNA浓度:连接体系的DNA浓度是影响连接产物转化的关键因素之一。您可以尝试调整基因和质粒的加入体积,以调整连接体系的DNA浓度。如果浓度过高可能导致细胞感受态死亡,如果浓度过低则可能导致连接效率低
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求助:多水平重复测量数据分析
huarenqiang5
这种情况可以使用非参数统计法进行分析。
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co-IP/pre-clear/磁珠封闭
loveliufudan
对于内源co-IP实验,如果预处理(pre-clearing)过的上清液与抗体过夜孵育,第二天加磁珠时最好使用已经用BSA封闭过的磁珠,以减少非特异性结合。BSA的浓度可以根据具体实验需要来定,一般建议使用1% BSA。封闭时间通常为30分钟至1小时,不需要太长时间。至于是否必须用封闭过的磁珠,这取决于实验的需要和具体情况。如果非特异性结合的情况比较严重,使用封闭过的磁珠可以降低干扰信号的产生,但
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扫描电镜
bamboopiggy
用酒精处理无菌以后可以直接放到培养皿里,让细胞自然沉降上去
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小鼠乳腺癌肺组织,救助,这是坏死了还是血栓??
bamboopiggy
你养了多久的小鼠?会不会是乳腺肿瘤的转移?
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磁珠法植物DNA提取试剂盒提取的核酸,纯度只有1.1左右,是什么原因? 应该如何调整?
huarenqiang5
考虑以下原因: (1)裂解不充分; (2)微球分散性不好; (3)微球吸附能力太强。 (4)磁珠吸附能力较弱; (5)磁珠洗脱效率较弱; (6)提取试剂(pH、盐、醇)与磁珠不匹配。 建议按以下几点进行优化:(1)优化试剂裂解液配方; (2)筛选合适粒径及表面的磁珠; (3)磁珠表面钝化处理。 (4)改变表面基团种类及密度; (5)减少干燥时间、加热洗脱
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用试剂盒提取蝗虫基因组DNA,提取完之后跑胶,条带不怎么亮,有可能是裂解的时间不够,但是加样孔处很亮,想问一下是什么原因?
sswei
一般是样品处理或者配胶的时候不注意,混入了一些内切酶,或是电泳温度高,导致核酸降解,尤其是跑rna电泳,很容易这样。建议用新胶,重新跑一次,样品用醋酸铵重新纯化,电泳槽用缓冲液冲洗多次再用。另外可以在电泳槽周围放冰,降低电泳温度,并适当调低电压,因为高温对核酸降解也有促进作用。
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HLA高分序列确定
sswei
IMGT/HLA数据库中查找“HLA-A02:01”,然后选择一个具有最高分数的亚型来进行匹配,因此有利于研究的顺利进行,获得正确结果。
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细胞电镜求分析
小锦鲤木子
图片在哪里呀???建议到教材中好好学学细胞器
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IP 磁珠和琼脂糖
loveliufudan
一般来说,抗体可以偶联在磁珠表面进行免疫磁珠层析等实验。但是,不同类型的抗体偶联到磁珠上的适用性可能会有所不同,因此最好在实验前进行一定的验证。建议可以先购买一些小规模的磁珠进行实验验证,或者咨询厂家或其他有经验的专业人士的建议。同时,需要注意抗体的偶联条件,如pH值、交联剂、偶联时间等,这些条件对于不同类型的抗体可能会有差异,需要进行优化和确定。
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生物合成基因簇
huarenqiang5
化合物的生物合成基因簇可以是生物合成途径中参与的反应的酶。
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如何做mRNA变性胶
土井挞克树
变性聚丙烯酰胺凝胶,是分子生物学常用技术之一,凝胶的灌制比水平电泳槽凝胶灌制困难,漏胶和产生气泡常在所难免,需经过反复实践才能掌握其灌制技巧。
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问
想说明某因子促进病毒复制从而致瘤有关研究,转染和接毒顺序是啥样?
土井挞克树
在病毒感染的前提下做过转染成功率高
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