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PCR基因芯片上荧光PCR反应的研究

基因芯片技术具有快速多样、微型化和自动化等特点在生物医学领域广泛的应用。但由于其基本原理是基于核酸杂交技术,有着内在的缺陷,实验的敏感性和重复性都存在一定问题。核酸杂交较适合于检测基因的表达,不易检测基因组DNA的基因的重排,突变和缺失。而大多数肿瘤性疾病和一些遗传变异和表型的改变与后者有关。为了解决上述问题,我们将芯片技术与荧光PCR技术相结合,设立设计一种含有大量微反应池的PCR基因芯片,以期 ...

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细胞实验原创经验

丁香园网友zlawrance的观点为: (1)细胞冻存管一般有1.5-2ml左右体积,原则上可以存放1.5ml充满均匀悬浮细胞的冻存液,一些人喜欢灌注1-1.5ml冻存液冻存,这实际上并不好。原因如下:冻存液冻存需要一段时间,如果这段时间冻存管倾斜,液体容易流到管口,很容易在后续的操作中造成污染。建议0.5-1ml之间即可。 (2)许多教科书推荐细胞解冻用37度水,本人发现温度可以适当提高,39度 ...

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细胞名称大汇总

一、遗传变异细胞系和正常组织来源细胞系 1、小鼠类 3T3-Swiss albino   胚胎成纤维细胞    Mo-MuLv/3T3     Mo-MuLv感染的3T3细胞 3T6-Swiss albino   胚胎成纤维细胞    PA317        成纤维细胞 Ana-1 (半贴壁)    巨噬细胞       SRSV/3T3       SRSV转化的3T3细胞 CTLL-2 (悬 ...

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芯片扫描仪的选择(图)

假如你问一个研究人员选择芯片扫描仪(microarray scanner)的时候,主要考虑什么性能?他们很可能回答说:“速度和分辨率”,因此不用感到奇怪生产厂商会在这些关键性能上下大功夫。从以下列出来的芯片扫描仪产品你就可以看到,在扫描芯片的速度和分辨率性能方面总是会出现一山还比一山高的情况。然而对于许多研究人员来说,处理能力和易操作性渐渐也成为了他们挑选芯片扫描仪时的选择 ...

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SNP功能研究进展

丁香园网友yxbo21021提出: SNP的研究在当前仍然可以用入火如荼形容,一方面是各大数据库可以方便检索到几乎任何一个基因的SNP分布及其频率,另一方面SNP的功能研究有非常大的研究空间和前景,这应归于许多SNP的流行病关联研究重复性差,因此只有在功能上对其阐述才能解决根本问题。 当前SNP功能研究主要有以下几方面: 1、报告基因转染技术:这一技术主要用于研究启动子SNP对于mRNA转录效率, ...

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为什么说SNP的变异没有STR大

SNP是单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism )。一般来说它是双等位基因的,就是说一个位点,人群中大部分人是A碱基,那么还有一部分人是T碱基,一般不会是C或者G了,这是一般的规律,没有什么好解释的。举个例子,一个人是正常人他的某一条染色体一段序列是:AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA,反向肯定是一串t了,是吧?另一条染色体也是这个样子的 ...

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SNP扫盲

是一篇蛋白质组学学期报告——Single Nucleotide Polymorphism内容,原文为繁体。 点击下载 ...

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SNP检测技术

snp现有检测技术有主要的3大类别 1、测序 主要发现新的snp位点和比较集中的snp位点,如hla区域,但成本较高,工作量大,不适合大样本做疾病关联分析。 2、taqman探针 结果比较可靠,国外文章也大量应用,不过对于国内成本偏高,同类还有snpshot技术,abi和贝克曼都相应试剂盒。成本和成功率都比taqman要低。 3、snp芯片 国外大规模筛查疾病关联分析常用,illumina和af ...

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双闭环控制的生物芯片点样仪

摘要:在高定位精度的运动系统中,光栅尺做为位置反馈元件大量使用。本点样仪选用Galil公司的DMC1800控制卡、松下交流伺服电机、雷尼绍光栅尺和贝塞德运动单元,定位精度可以满足设计要求。控制软件采用VB编写。 《双闭环控制的生物芯片点样仪》下载 点击这里下载 ...

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SNP的概念和特点

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,平均每500~1000个碱基对中就有1个,估计其总数可达300万个甚至更多。 SNP所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异,这种变异可由单个碱基的转换( ...

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SNP研究中的经验和问题

对于SNP 研究,我个人的感觉是:曾经非常的“热”过,而现在,似乎有些降温。 这种降温在国内的研究领域内主要表现为:SNP研究做得非常多,甚至有些滥了,就象前面有的战友说的,随便做点PCR就可以在国内的杂志发文章了,文章太多太滥,没有多大的价值。 对于国外SNP研究领域,我认为现在也进入了理性思考期。SNP的文章还有很多,但是研究的思路和风格已经和以往不同了。记得2002- ...

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DHPLC简介

用以检测T2DM的众多候选基因突变所需要的技术,既要求能够自动化、高通量进行,也要求除PCR之外,勿需进行PCR引物修饰、购买特殊试剂、检测标记信号或作其它的样品处理;而目前已有的许多DNA突变分析技术诸如单链构象多态性 (single-strand conformation polymorphism,SSCP) 、变性梯度凝胶电泳法(denaturing gradient gel electro ...

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提高PCR特异性的方法

1、引物设计 细心地进行引物设计是PCR中最重要的一步。理想的引物对只同目的序列两侧的单一序列而非其他序列退火。设计糟糕的引物可能会同扩增其他的非目的序列。下面的指导描述了一个可以增加特异性的引物所具有的令人满意的特点: 1.典型的引物18到24个核苷长。引物需要足够长,保证序列独特性,并降低序列存在于非目的序列位点的可能性。但是长度大于24核苷的引物并不意味着更高的特异性。较长的序列可能会与错 ...

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一种基于手动芯片点样仪的快捷高效的转基因植物PCR-dot-blot鉴定法

当前检测转基因植物的权威方法是分子杂交,其中Southern、Northern、Western杂交分别从整合、转录、翻译水平检测外源基因的行为,虽然说服力强,但是操作繁琐,费用较高,只适用于随机取样检测。如果用于批量检测,传统做法将会进一步显露出效率偏低、重复性差等缺点。 为建立高速度、高通量的检测方法,近年来发展了生物芯片技术,即将大量DNA或蛋白质等以预先设计的方式固定在载体上形成高密度阵列, ...

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引物

一 设计引物应遵循以下原则 1 、引物长度: 15-30bp,常用为20bp左右。 2 、引物扩增跨度: 以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。 3 、引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC最好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。上下游引物的GC含量不能相差太大。附加序列(RT site P ...

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生物芯片点样仪DY-2001控制系统的研究

摘要:DY-2001型生物芯片点样仪可控制系统的硬件采用当今世界的高科技成果,如高性能的PC计算机、美国Galil公司的高速运动控制卡、德国雷尼绍高精度直线光栅尺和松下交流伺服马达等。同时为了提高系统的抗干扰能力,DY-2001型生物芯片点样仪的硬件接口板增加了抗干扰的特殊电路,如DC-DC、光耦隔离电路、线路板单点接地电路及去耦电容等措施。通过以上方法制造出一种高性能、高可靠性的生物芯片专用设备 ...

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香猪的冬季饲养

(1)保温 香猪的抗寒能力低于当地猪种,保温不好,不但影响正常生长,还会造成损失。猪舍的墙壁一砖半或一坯的厚度为宜,严密,无裂缝。墙壁簿的四周多堆些柴草做为保温层。猪舍要用塑料塑膜扣棚,最好用两层塑料薄膜。棚上夜间加盖草帘子。棚要有通风孔,每天中午前后通1~2次。每次半小时即可。粪便要及时清理,睡卧的地方勤换干草、干树叶、干锯末。如有尿窝子的猪必须调教。 (2)饲料要全价 饲料全价是指喂猪的饲料要 ...

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新型光机结合的二维共焦生物芯片扫描仪设计

引言生物芯片是指在硅片、玻璃、凝胶或尼龙膜上,通过机器人自动打印或光引导化学合成技术,制作的生物分子微阵列探针,然后与标记的样品分子进行杂交,通过检测杂交信号的强度及分布对靶分子的序列和数量进行分析的一项技术,目前广泛应用于生物医学和生命科学研究中,而生物芯片扫描仪是生物芯片能否得到广泛应用的关键仪器。生物芯片的荧光信号检测方法,根据检测中采用的光电探测器的类型,可分为光电倍增管(PMT)型和CC ...

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香猪疾病防治

一、猪瘟 猪瘟又名烂肠瘟,是猪的一种高度传染性病毒病。猪瘟可分急性、亚急性、慢性3种。本病一年四季都可发生,不分猪种、年龄、性别都可感染本病。本病大多由消化道感染,也可通过呼吸道感染。 1、症状 本病的一般症状患病猪表现为发烧,体温达40.5~41℃,精神萎顿,被毛粗乱,畏寒打抖,食欲减退,喜喝脏水,常钻垫草。皮肤有红色出血点.揩压时不褪色。患病猪先便秘,后下痢,恶臭,带有粘液和脓血;有脓性眼屎; ...

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生物芯片及其荧光信号检测

摘要:系统介绍了生物芯片的概念和制造方法,重点讨论了生物芯片的荧光检测方法,并对不同的检测方法进行了对比和分析。总体来说,激光共聚焦芯片扫描仪的荧光检测灵敏度和扫描分辨力较高,而CCD芯片扫描仪的荧光检测灵敏度和扫描分辨力较低,但CCD芯片扫描仪的检测速度较快,成本也较低。 《生物芯片及其荧光信号检测》下载 点击这里下载 ...

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