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基因组学相关软件列表1、基因组组装分析：phred, phd2fasta, phrap, consed, arachne, RePS　　2、功能注释：glimmer, genewise, genscan, fgenesh, BGF, tRNAscan-SE, MicroRNA, sim4, InterproScan, GO, WEGO, Promoter 2.0, Disembl　　3、重复序列：Repeatmasker, ReAS　　4、比较基因组：cross_match, blastall, blastz, blat, Fasta, CA ...

曾建议成立翻译共同体的，得一些战友支持，选此书练笔，一度中止，偶会继续努力！绒毛组织培养样本准备：20ml注射器，含6ml无血清RPMI1640及两滴500IU/ml的肝素将绒毛组织吸入注射器内，再注入皮氏培养皿后，送至实验室处理1。倒置显微镜下观察，用细镊子将绒毛组织与蜕膜仔细分离，可用HBSS液清洗，将样本分成两等份，一份用于直接法，一份用于培养。2。直接法：将皮氏盘内的培养液换成3ml 37 C 预热20%灭活的胎牛血清，1 ...

1 引言1.1 分子标记概念的界定广义的分子标记(molecular marker)是指可遗传的并可检测的DNA序列或蛋白质。蛋白质标记包括种子贮藏蛋白和同工酶（指由一个以上基因位点编码的酶的不同分子形式）及等位酶（指由同一基因位点的不同等位基因编码的酶的不同分子形式）。狭义的分子标记概念只是指DNA标记，而这个界定现在被广泛采纳。本文中也将分子标记概念限定在DNA标记范畴。1.2 理想的分子标记的界定理想的分子标记必须达到 ...

1.1 核酸序列的检索http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide1.2 核酸序列的同源性分析1.2.1 基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/blast.cgi1.2.2 核酸序列的两两比较http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/bl2.html1.2.3 核酸序列的批量联网 ...

为了方便理解，这里罗列一下碱法质粒抽提用到三种溶液：溶液I，50 mM葡萄糖 / 25 mM Tris-Cl / 10 mM EDTA，pH 8.0；溶液II，0.2 N NaOH / 1% SDS；溶液III，3 M 醋酸钾 / 2 M 醋酸。让我们先来看看溶液I的作用。任何生物化学反应，首先要控制好溶液的pH，因此用适当浓度的和适当pH值的Tris-Cl溶液，是再自然不过的了。那么50 mM葡萄糖是干什么的呢？说起来不可思议，加了葡萄糖后最大的好处只是悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部。因此，如 ...

microRNA 原位杂交 protocol这个我是以exiqon的protocol为蓝本翻译过来的，有些小步骤上有修改。1脱蜡水合 RT二甲苯undefined3min----二甲苯2x3min——无水乙醇undefined3min——无水乙醇undefined3min——96%乙醇浸入5min——70%乙醇5min——PBS 2-5min2蛋白酶k 2ug/ml(临用前配置) 200ul 10min 37度40ug/ml 蛋白酶k 1:20稀释于蛋白酶k buffer3含0.2%甘氨酸PBS * 2 5min RT（暂时省 ...

坑爹啊，一个载体构建，花了我四个月时间，往事不堪回首，为了各位兄弟姐妹们避免重蹈我的覆辙，我就一把鼻涕一把泪的给大家倾诉一下。构建之前啊，我就翻丁香园啊，把里面关于载体构建的精华看了一遍啊，然后呢，以为构建载体很简单啊，以为一个月能搞定啊，所以满心欢喜的就开工了啊。实验室没有载体，就跟别人借。载体借到了，按照文献里报道的选了两个酶切位点，离的太近，先单酶切验证，一切正常。接着往地下做，为了省时间，选用PCR产物直接双酶 ...

本文就基因表达系统选择的原则做一粗略论述，抛砖引玉基因表达是基因工程的重要内容，是工业、医疗和基础研究领域的重要技术。基因表达系统按照基因表达宿主的性质分为原核表达系统和真核表达系统两类，前者主要包括大肠杆菌表达系统和枯草杆菌表达系统等，后者主要包括酵母表达系统、丝状真菌表达系统和哺乳动物细胞表达系统等。原核表达系统以大肠杆菌表达系统为代表，具有遗传背景清楚、成本低、表达量高和表达产物分离纯化相对简单等优点， ...

近日因实验需要，搜索了园中关于高GC含量PCR相关的资料，顺便整理了一下，做一个资源链接小结，以方便需要的战友查阅；也欢迎有体会的战友提供实战经验！===============================高GC含量的PCR应注意什么?【求助】高GC含量片段扩增问题如何解决【求助】高GC含量的基因PCR应注意什么？高GC含量PCR困难，求助求助：高GC含量PCR的扩增【求助】5'高GC含量的pcr怎么做啊【讨论】PCR一定要加DMSO吗?【求助 ...

PCR 引物设计及软件使用技巧自从1985 年Karny Mullis 发明了聚合酶链式反应以来，PCR 技术已成为分子生物学研究中使用最多、最广泛的手段之一，而引物设计是PCR 技术中至关重要的一环。使用不合适的PCR 引物容易导致实验失败：表现为扩增出目的带之外的多条带（如形成引物二聚体带），不出带或出带很弱，等等。现在PCR 引物设计大都通过计算机软件进行。可以直接提交模板序列到特定网页，得到设计好的引物，也可以在本地计算机上运行引物 ...

PCR产物的电泳检测时间　　一般为48h以内，有些最好于当日电泳检测，大于48h后带型不规则甚致消失。假阴性，不出现扩增条带　　PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备，②引物的质量与特异性，③酶的质量及， ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。　　模板：①模板中含有杂蛋白质，②模板中含有Taq酶抑制剂，③模板中蛋白质没有消 化除净，特别是染色体中的组蛋白，④在提取制备模板时丢失过多，或吸入酚。⑤模 板核酸变性不彻底。在酶和引物质量好时 ...

下载：http://www.rayfile.com/zh-cn/files/eb54752e-9d60-11e0-a49d-0015c55db73d/或：miRNA实验指南(中文版).part1.rar下载：http://ishare.iask.sina.com.cn/f/16562038.html?from=likemiRNA实验指南(中文版).part2.rar下载：http://ishare.iask.sina.com.cn/f/165 ...

近年来，ZFN、TALEN、CRISPR/Cas9等基因组编辑技术可谓是层出不穷，尤其是CRISPR/Cas9，一出现便在全球范围内掀起一股热潮。同时，各大公司也开发出一系列相应的产品，其中一种至关重要的就是基因敲除阳性克隆筛选的试剂。目前，市面上只有Genloci的CruiserTM、Transgenomic的SURVEYOR和NEB的T7EI这三种产品和测序这种方法，被用于基因敲除阳性克隆的筛选。然而，SUR ...

1、实验目的提取人体细胞的总RNA和mRNA。2、本实验所需试剂1）、CNE-2细胞及培养细胞的一系列条件，2）、PBS缓冲液， TRIZOL试剂，3）、DEPC处理过的水、大、中、小Tip及1.5 ml EP管,4）、新的氯仿、异丙醇和乙醇，5）、mRNA分离试剂盒：Oligotex mRNA Mini Kit,Cat.no.:70022, QIAGEN。6）、新配的电泳缓冲液，专跑RNA的琼脂糖（Agarose）。3、实验流程3.1 细胞总RNA的提取1）、6孔板 ...

PCR/RT-PCR疑难问题解答（一）［ 作者：佚名 转贴自：210.83.8.237 点击数：23 文章录入：kay76 ］一、问题：RT-PCR灵敏度：在琼脂糖凝胶分析中看到少量或没有RT-PCR产物。可能原因：1．RNA被降解建议解决方法：在用来验证完整性之前先在变性胶上分析RNA使用良好的无污染技术分离RNA；在将组织从动物体取出后立刻处理在100％甲酰胺中储存RNA；如果使用胎盘RNase抑制剂，不要加热超过45℃或pH超过8.0，否 ...

1、植物总RNA的提取以白菜花药组织为试材, 利用改良Tris-硼酸法提取花药总RNA。提取花药RNA的产量高、质量好、纯度高, 适用于mRNA差异显示及基因表达的Northern印迹等的RNA提取。分别采取蕾期和盛花期的花蕾和花朵, 迅速将花药剥离, 分装称重后液氮中速冻, - 80℃保存。1　RNase的灭活　所有用于RNA提取的玻璃器皿均在180℃条件下烘2h以上, 塑料管和枪头用 0. 1%焦碳酸二乙酯(DEPC)溶液在 37℃条件下处理24h后高压灭菌。2　 ...

RNA干扰(RNA interference，RNAi)是正常生物体内抑制特定基因表达的一种现象，它是指当细胞中导入与内源性mRNA编码区同源的双链RNA(double stranded RNA，dsRNA)时，该mRNA发生降解而导致基因表达沉默的现象，这种现象发生在转录后水平，又称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing，PTGS)。外源dsRNA 进入细胞后产生的小分子干扰RNA（s ...

Mutation SurveyorMutation Surveyor 是美国Softgenetics公司和中国华生恒业科技有限公司联合开发的Mutation/SNP检测软件，用来实现高通量(high-throughput)，高灵敏度(sensitivity)和准确率(accuracy)的DNA突变/SNP检测，目前已被全世界数百家知名机构使用(国外著名专家对Mutation Surveyor的评价和意见)，在不到一年的时间内，分 ...

DNA 异常甲基化与肿瘤临床张吉才编译DNA甲基化是一种常见的人类DNA修饰,它是在DNA甲基转移酶（DNMT）催化下将甲基加到CG二核苷酸的C上形成的。因甲基化改变只影响DNA的结构，而不影响遗传编码，它被视为一种外遗传变化，而不是遗传变化。由于人基因组能通过脱氨作用将mC变为T，人基因组有较高清除CG二核苷酸的能力。但人基因组内仍有少量的区域富含CG二核苷酸，长度可达若干kb，这些区域称CPG岛。其它区域内的 ...

原文链接：http://genloci.biomart.cn/news/134612.htm●?我们有专业的团队以凌建群博士（基因重组操作系统IOS技术发明者，曾任美国斯坦福大学医学院资深研究员和实验室主任）为研发核心，来自美国斯坦福大学、丹麦哥本哈根大学、北京大学、浙江大学、南京大学、厦门大学，东南大学等国内外知名院校的优秀学子加盟。● 我们有成熟的技术平台、齐全的实验设备吉锐生物为您提供完整的基因敲除解决方 ...