在siRNA序列设计时，将潜在的序列用BLAST进行同源序列搜索时，出来的结果好象总是存在和其它编码序列同源的序列，郁闷！是不是可以只看E值？还是只看score？这个问题好菜！ 我的目的序列是Human P-glycoprotein (MDR1）中的一个片断，请问出现以下的结果如何判断这个目的序列与其它编码序列不是同源的序列？下面是BLAST的结果： Score ESequences producing significant alignm ...
Version 1.5 of siRNA DNA Designer has been released. The following features have been added.1) BLAST Engine:A BLAST Engine is now included with siRNA DNA Designer 1.5 which permits desktop analysis for potential off-target hits.The Blast engine performs a search for off-target hits using the s ...
1. RNA interference-mediated knockdown of DNA methyltransferase 1 leads to promoter demethylation and gene re-expression in human lung and breast cancer cells.Cancer Res. 2004 May 1;64(9):3137-43.PMID: 15126351 2. A plasmid-based system for expressing small interfering RNA libra ...
我想把目的基因连接到载体上，有几个问题想请教斑竹和各位战友：1、限制性内切酶的选择：我查看论坛说选择酶切位点需要考虑酶切位点在载体上的距离、酶切温度与连接效率、价格、使用频率等等。最后我综合价格、温度、Buffer选定XbaI和EcoRI，打算购买宝生的酶，相应的Buffer用附带的10×M Buffer。不知道我选择的酶切位点合适不合适呢？2、引物设计：引物结构为：保护碱基＋酶切位点＋目的基因末端上游引物5’－CCG TCT ...
试验整体方案1.Scrambled (Negative) siRNA Control2.Positive siRNA Control3.Multiple siRNAs to a Single Target4.Monitor Both Target mRNA and Protein Levels5.Use the Lowest Possible siRNA Concentration6.Validation Via Array Analysis and Rescue ExperimentsTo better under ...
Genetic Recombination: Reviews and Protocols形态项：Publisher: Humana PressNumber Of Pages: 272Publication Date: 2004-01-09Sales Rank: 1384602ISBN / ASIN: 1588292363EAN: 9781588292360Binding: Hardcover内容介绍：Genetic recombination is any process in which DNA sequen ...
影响了版面正常操作表示报欠，现将文章部分列在如下：A hypothermic-temperature-sensitive gene silencing by the mammalian RNAiTakashi Kameda, Kenji Ikegami, Yang Liu, Kunihiko Terada, and Toshihiro SugiyamundefinedDepartment of Biochemistry, Akita University School of Medicine 1-1-1 Hondo, Akita 0 ...
很好的常用关于RNAi的网站大全，也许对你有用。Comprehensive List of RNAi Publications (updated daily)RNA info on the WebRNA World Websitehttp://www.imb-jena.de/RNA.htmlRNA interference (RNAi) PDF files on the WebThe Knowledge Foundation: RNA in drug developmenthttp://www.knowledg ...
这个是RNAi对照最权威的文献了,看了以后对对照产品没有疑惑!Whither RNAi? Nature Cell Biology, 5, 489-490 (2003).Whither RNAi?The generally rapid progress of molecular biology methodologies is punctuated on occasion by discoveries that do nothing less than revolutionise the field. Historical exa ...
Nature Protocols 3, - 1452 - 1456 (2008)Touchdown PCR for increased specificity and sensitivity in PCR amplificationDarren J Korbie & John S MattickTouchdown (TD) PCR offers a simple and rapid means to optimize PCRs, increasing specificity, sensitivity and yield, without the need for leng ...
Do Your Experiments Require Total RNA or mRNA?看看就会有收获Selecting a Purification Strategy . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . 198Do Your Experiments Require Total RNA or mRNA? . . . . . 198Is It Possible to Predict the Total RNA Yield froma Certain Mass of Tissue or Number of Cells? . . . . . . . . 201Is There Protein in Your RNA Preparation, andIf So, Shou ...
无论您的研究内容是遗传发育、干细胞、调控，还是疾病……无论您的研究物种是人、大鼠、小鼠，还是植物……无论您的样本类型是组织、细胞、血液，还是石蜡切片……您都可以很简单、很轻松地研究miRNA！什么是miRNA？MicroRNA（miRNA）是真核生物中一类长度为22nt左右的非编码单链RNA分子，在生物进化过程中高度保守。miRNA分子可与靶mRNA3’UTR区或编码区通过碱基互补配对原则特异性结合，诱导靶mRNA降解或 ...
1. The MicroRNA: Overview of the RNA Gene That Modulates Gene Functions2. Structure Analysis of MicroRNA Precursors3. MicroRNA Biogenesis: Isolation and Characterization of the Microprocessor Complex4. Recognition and Cleavage of Primary MicroRNA Transcripts5. Mouse Embr ...
如果有人告诉你有一种不用去NCBI、UCSC、DBTSS等数据库，也不用众多的启动子分析软件去苦苦倒腾，就能准确、快速、高效、直接、简洁、明了的获取目的基因的启动子以及cDNA、shRNA、miRNA等重要信息，道友们一定不会相信，而在今天之前我也不相信，而事实是下面我要分享的这个东东介于牛A和牛C之间，很牛B啊！道友们不信？ 去这个网站吧http://www.genecopoeia.com/product/search/i ...
不知道大家做突变的时候都用什么方法。有经验的战友不妨来交流一下啊。说说我的先。由于本人没有这方面的经验，所以**求各位战友的意见和建议啊。大家多多批评指正。我要做一构建好的质粒上约100bp的片段的缺失，利用反向PCR的方法。以下是利用实验室现有资源的实验设计：1 Phosphorylation of the 5’-end of a primer10×kinase buffer 2ulprimer (20uM) 5ul10mM ATP 2ulpolynucleo ...
Nucleic Acids Research是做生物信息学和分子生物学必读的文章，许多文章本身就是经典的protocol，这里收集2003年最热门的文章，希望大家能喜欢，这里包括最热门的文章，最热门的数据库，最热门的方法学文章，以及Nucleic Acids Research上自从创立以来阅读最多的文章。TOP STANDARD CATEGORY PAPERS, 2003Short hairpin type of dsRNAs that are controlled ...
终于开始批量流传到公开网络上了估计存活时间不会太长Methods In Molecular Biology Collection - Volumes 1-100MMB.Vol1.Proteins.rarMMB.Vol2.Nucleic_Acids.rarMMB.Vol3.New_Protein_Techniques.rarMMB.Vol4.New_Nucleic_Acid_Techniques.rarMMB.Vol5.Animal_Cell_Cu ...
1。大量提取质粒试剂盒推荐http://www.dxy.cn/bbs/thread/1270315http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/448717_0.htmlhttp://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/2267272_0.htmlhttp://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=64&id=370826&sty=3&keyword ...
RNAi从发现到现在，短短几年时间，已经由一种生理现象发展为生物医学研究的重要手段和具有很大潜力的治疗手段。目前，哺乳动物细胞的RNAi主要依赖于长19～21bp，3‘端悬挂2nt的对称的RNA双链，即短干扰RNA（siRNA）。这里，作者报道了一种长15bp、3’和5‘端分别悬挂3nt的反义核苷酸的非对称的RNA双链，即非对称干扰RNA（aiRNA），可以有效诱导哺乳动物细胞RNAi的发生。研究表明aiRNA诱导的 ...
以下是美国冷泉港(CSHL)Hannon领导的研究小组报道的29bp shRNA可以在哺乳动物中起RNAi效应：Paddison PJ, et al. Short hairpin RNAs (shRNAs) induce sequence-specific silencing in mammalian cells. Genes Dev. 2002 Apr 15;16(8):948-58. 免费全文网址：http://www.genesdev.org/cgi/content/full/16/8/948该 ...
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