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确定一种蛋白质的结构和功能是现代生物学许多研究的基础。在过去的几十年里，人们开发了许多用于结构预测的计算工具，其中 Phyre2 因其强大的分析能力与简单的操作被生物科研人员广泛使用，据统计每天都有约 1000 个任务提交到 Phyre2 服务器上。Phyre2 分析能力强大，结果界面丰富直观，可以预测和分析蛋白质的结构、功能和突变。相比之前的版本 Phyre v 1.0，Phyre2 使用更先进的远程同源检测方法来构建蛋白质三维模型，预测配体结合位点 ...

① Nature 子刊：内质网定位的 Hrd1 协同细胞膜 TLR4 受体促进炎症反应机制位于细胞表面的 Toll 样受体 4（TLR4）对于细菌引起的 NF-κB 活化和炎症因子分泌非常关键，但是至今很少有报道提出特定细胞器定位的关键分子能参与 TLR4 通路和巨噬细胞的抗细菌感染功能。9 月 2 日，国际学术期刊 Nature Microbiology 在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）王红艳研究组的最新工作，内质网定位的 E3 泛素连接酶 Hrd1 通 ...

茫茫的实验过程中，你是否遇到过如下的困境：做完 PCR，跑胶发现有多条很诡异的条带……更为可怕的是，做完二代测序发现了一个崭新的突变点，一代测序验证也能开心的验证出来，但发文章时，别人告诉我们，这其实是相似序列引发的假阳性……也就是说，相似序列之间的差异碱基，刚好就是那个所谓的突变点！一代测序也枉然！以上的问题，可能多半都是因为引物不特异。也就是说，同一对引物，能匹配基因组上好几个位置。所以，设计完引物，做一个在线的 PCR，以 ...

① Nature Communications：研究揭示细菌发动蛋白 IniA 调控结核耐药的新机制8 月 29 日，中国科学院院士饶子和率领的上海科技大学科研团队与中国科学院生物物理研究所研究员胡俊杰课题组合作，率先解析了一线抗结核药物——异烟肼诱导蛋白 IniA 的晶体结构，发现其具有典型的细菌发动蛋白（dynamin）构象，并发挥膜分裂的功能，由此揭示了 IniA 蛋白参与药物耐受的新机制。细菌发动蛋白的解析虽然有较多进展，但其生理功能也一直困扰 ...

现在 lncRNA 研究已成热点，每天都有很多的lncRNA被发现。今天我们介绍一款在线数据库：网站链接：http://annolnc.cbi.pku.edu.cn/这个数据库界面特别简洁，小编第一看到他就如获至宝：简单明了不矫情。尤其适合英语 low low 的小编。只要找到你研究的那条 lncRNA 序列就好啦。下面看看它的功能随便找一个 lncRNA：NR_002578.2就他了！查询 lncRNA 序列：复制-粘贴到 Annolnc 主页面的文本框里：GO！不错 ...

是不是做 Western 的时候，会遇到这样的情况呢？没错，就是背景很脏。造成背景脏的原因有很多，比如一抗没洗干净，或者二抗没洗干净，还有就是封闭的时候不完全。但其实，封闭液也是你们很容易忽略的一个环境哈。封闭液有几种？除了脱脂奶粉和 BSA 还有啥你们能想到的？第一种封闭液就是脱脂奶粉，这是异常便宜的封闭液品种，当然也应该是你们最常用的封闭液配方了。（甚至我们用过特仑苏）但是，你们应该注意到的是，脱脂奶粉中有大量的生物素，也就是说 ...

引物设计是 qPCR 非常重要的环节。今天小编给大家推荐 2 款简单实用的在线 qPCR 引物设计网站，让你分分钟搞定 qPCR 引物！Primer3 Plus推荐指数：五颗星理由：严格的 qPCR 引物设计一般要求其中一条引物要跨外显子，最好在 3' 端设计引物，产物的长度在 300bp 以内等。本在线软件可满足 qPCR 引物设计的要求。网址链接：http://www.primer3plus.com/1、选择 Run latest Versionof Primer3Plus，就进入了设计引物的 ...

SCI期刊那么多，一旦选错，费时费力不说，千辛万苦找到一个期刊投稿后，收到“论文内容与期刊不一致”的拒稿通知，对作者来说也是个不小的打击。更有一些水刊...那么我们该如何又快又精确地找到与论文内容最匹配的期刊呢？今天就给大家推荐一个SCI论文精准高效投稿利器：JournalGuide，只需1s，搜索相似论文，查看最匹配SCI期刊，实现精准投稿！网址：https://www.journalguide.com/优势：1、覆盖面广 ...

撰写学术论文已成为当今高材生们的必修课，除了大名鼎鼎的中国知网之外，你还知道哪些好用的论文网站呢？这次小编给大家推荐几个超 nice 的论文网站，方便大家在撰写论文时能更快地获得相关资料，用于借鉴参考。1. 师大云端下载站， 中文论文、专利检索下载链接：lunwenyizhan.com【师大云端】提供一站式论文、专利下载服务，面向全社会开放，国内网络都支持，校内校外都能高速下载。提供包括中国知网在内的八大文献数据库资源下载服务，数 ...

① 组蛋白修饰「阅读器」ZCWPW1 在雄性减数分裂中有决定性作用不孕不育在我国育龄夫妇中的发生率已达 15%，配子（精子或卵细胞）不能产生或其质量低下是引起不孕不育的重要原因，而精子和卵细胞必须经过减数分裂才能产生，一直以来，减数分裂的分子机制及存在的雌雄差异是研究的热点。来自香港大学深圳医院生殖医学研究中心，山东省立医院等处的研究人员发现组蛋白 H3K4me3 修饰「阅读器」ZCWPW1 对雌雄两性减数分裂具有不同效应，Zcwpw1 ...

① 北京基因组所 Autophagy 揭示去泛素化酶 USP33 调控线粒体自噬新机制PINK1 -Parkin 介导的线粒体自噬在线粒体质量控制过程中发挥着关键作用，其调控异常与人类神经退行性疾病发生相关。已有研究表明 Parkin 蛋白泛素化和去泛素化修饰参与线粒体自噬调控过程，但 Parkin 蛋白的去泛素化酶及其调控线粒体自噬的分子机制尚不清楚。中国科学院北京基因组研究所赵永良研究组首次证明去泛素化酶 USP33 定位于线粒体外膜，利用质谱分析 ...

① 华中科技大学最新研究：免疫机制参与心肌梗死后缺血性心力衰竭华中科技大学同济医学院附属协和医院心血管内科程翔教授研究团队发现了缺血性心力衰竭患者心脏局部 T 淋巴细胞免疫组库特征及免疫功能表型，在缺血性心力衰竭的免疫发病机制领域取得重要进展。这一研究团队发现在梗死后心力衰竭患者的心脏局部存在显著的 T 细胞应答；心脏局部的 T 细胞具有克隆扩增和组织特异性的表型，分泌促纤维化及促凋亡因子参与不良心室重构，且能再次进入外周循环；C ...

今天小编为你介绍常用的生信分析工具，这对你撰写研究方案和SCI文章写作很有帮助哦！1. solQTL （了解分析茄科、菊科的表型和基因型）http://solgenomics.net/qtl/ solQTL是番茄基因组测序计划的基因组信息资源门户网站数据库SGN (http://solgenomics.net) 的子模块。在solQTL上可看到全基因组QTL图谱的很多参数资料： 同时，还能清楚看到染色体每个位点： 目前的植物数据库Gramene ( ...

今天给大家安利一个好用的数据库：CircInteractome（Cirular RNA interactome）可以说功能很强大了，下面我们来看看它有哪些功能吧。一、搜索 circRNA 的名字、序列、在基因组上的位置及结合的蛋白首先是 circRNA 的搜索：我们可以根据 circRNA 或者基因名进行搜索，比如以基因 Cul2 为例，在 Gene Symbol 后面的对话框中输入 Cul2，然后单击 circRNA Search：在新页面中就出现了这个基因来源的各个 ci ...

circRNA的数据库还是很多的，以下几个可供参考：1.circBase收集包括以下6个物种的circRNA信息：人 (hg19)、小鼠(mm9) 、秀丽线虫(ce6)、黑腹果蝇 (dm3)、矛尾鱼(latCha1)、腔棘鱼 (latCha1)。该数据库是目前相对收录信息比较全和完整的，数据也能下载，非常实用。2. Circ2Traits是一个收集与人类疾病或性状潜在关联的circRNA数据库。3. circNet，利用464个RNA-seq测序 ...

① 傅嫈惠院士发现 ADRB1 基因能缩短人的睡眠时间！美国科学院院士傅嫈惠，和加州大学旧金山分校神经学家 Louis Ptáček 研究分析了几个家族，他们的睡眠时间只需要 6 个小时，而针对这个家族，研究人员发现了一个名为 ADRB1 的基因，在遗传连锁研究和全外显子组测序研究中，他们发现了这种新颖且非常罕见的突变。研究发现，这个基因编码ß1 -肾上腺素能受体，而这个蛋白的突变体版本稳定性较差，改变了受体的功能。这表明它可能在大脑中产生功能性后果。 ...

CRISPR 基因编辑技术自问世以来，就有着其他基因编辑技术无可比拟的优势，其应用在医学科研领域后，也不断的取得喜人的成果，进而迅速风靡于世界各地的实验室。那么 CRISPR 技术如此受到科研界的青睐，到底有什么过人之处呢？本文则揭开 CRISPR 神秘的面纱，让你快速掌握该基因编辑热门技术的精髓所在。CRISPR 原理及基本结构CRISPR/Cas 系统作为原核生物的免疫系统，可识别外源性遗传物质 DNA，并将其切断，沉默外源基因的表达。在 ...

大多做科研的童鞋们大概都会遇到一个头疼的问题：怎么找文献？如何保证找到的文献都是相关领域的经典文献？本文教你如何根据 H5 指数查找相关领域的高精尖经典文献。首先来了解一下什么是 H 指数、H5 和 H5 中位数？H 指数（H-index）：于 2005 年由美国加州大学学圣迭哥分校物理学家 Hirsch 教授提出，用于评价个人学术影响。Hirsch 将该指数定义为：若某位科学家的 Np 篇论文中有 h 篇论文每一篇的引量都至少为 h 次，且其他（Np-h）篇论文中每篇的引量都

小鼠灌胃方法比较简单，需要关注的只有两点：一是要保持小鼠的头部和颈部成一直线，方便灌胃针头进入；二是动作要轻柔，从口角进入，防止损失食道。做的多了自然就熟练了。具体操作过程如下：1. 准备灌胃针头。一般可以从市场上面买到，实在没有的话，可以用 12 号的针头，剪去针尖，用砂纸将头端磨平，也可以用。但是买的灌胃针头的头端用锡或者适宜的方法处理了针头的锐口，自己用砂纸不可能将所有的锐口都磨掉，用这样的针头灌胃，损失小鼠食道的可能性比 ...

SNP，全称Single Nucleotide Polymorphisms，是指在基因组上单个核苷酸的变异，包括转换、颠换、缺失和插入，形成的遗传标记，其数量很多，多态性丰富。从理论上来看每一个SNP 位点都可以有4 种不同的变异形式,但实际上发生的只有两种,即转换和颠换,二者之比为2：1。SNP 在CG序列上出现最为频繁,而且多是C转换为T ,原因是CG中的胞嘧啶常被甲基化,而后自发地脱氨成为胸腺嘧啶。一般而言,SNP 是指变异频率大于1 %的 ...