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        丁香实验推荐阅读
        发表医学 SCI 起标题的5个小技巧

        期刊收到你的稿件后,编辑和审稿人最先看的就是论文标题,再根据标题预想论文内容。此外,读者检索文献,标题也会出现在搜索结果的重要位置。所以,标题和重要性丝毫不亚于论文本身。其实,论文标题的撰写可以遵循一定的程序或格式,本文给大家介绍的 5 个步骤,或许可以给你带来深度启发。1.先来回答这几个问题我的论文是关于什么的?答:我的论文研究「X 疗法」能否改善痴呆病患的认知功能。使用了什么设计及技术?答:随机试验。谁研究了什么?答:我研究了 ...

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        WGCNA 的输入矩阵到底是什么格式?

        请问用 tcga 做 wgcna 分析,原始数据输入 tpm 和 fpkm 格式都行吗?如果下的 raw_count 有 r 包转换吗?首先,TCGA 目前的确是以 count 格式的矩阵下载为主至于能不能找到 RPKM 这样的矩阵,肯定是可以的,但是我教大家的主要是 count 值,因为对 RNA-seq 数据的差异分析以这个 count 为 input。然后问题就是,用 tcga 做 wgcna 分析,是不是原始数据输入一定要是 tpm 和 fpkm 格式?(PS,类似的基因表达量的归一化还有很多,详细见:https://hbctrain ...

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        怎么处理植物组织培养过程中出现的各种污染?

        植物组织培养常见问题解析Coolaber1. 培养基的配制注意事项植物组织培养最常用到MS培养基,包含十几种化合物。因为有些化合物相遇会发生化学反应产生沉淀,影响培养基的营养成分,准备MS培养基需要配制多种高倍母液。且配制母液时,尤其涉及大量元素的母液时,一定要等一种成分溶解之后,再缓慢的添加另一种成分,切记“一锅煮”,即不能将各种化合物一齐添加进去。可选用Coolaber的MS培养基基盐(PM1011)在自行加入蔗 ...

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        Cellular And Molecular Life Sciences - 这本低调的欧洲老牌生物学期刊 1 个月就能接收,助你毕业!

        白天做实验,晚上看文献,博士要毕业,文章还没头绪,怎么办?今天笔者给大家安利一本欧洲老牌生物期刊,影响因子还不错(7 分左右):Cellular And Molecular Life Sciences助力你完成毕业大业,上演你科研路上的小欢喜。期刊基本信息Cellular And Molecular Life Sciences 中文名称《细胞和分子生命科学》(简称 CMLS),该期刊由瑞士于 1945 年出版发行 (名 Experientia),1994 年更名 CMLS,半月刊,一年 ...

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        graphpad prism 8.0 - 不用 PS,两招教你做出能发高分 SCI 的组合图!

        在 sci 论文中经常见到组合图。为什么会用到组合图呢?那是因为在投稿时可能会遇到对 figure 数量的 requirements。这样就要求我们将多幅图片组合排版到一起,即条理清晰,又能突出重点,何乐而不为呢。但是组合图 dpi 的要求比较高,除了应用主流的 PS 处理之外,今天给大家示例两个别的方法:一.graphpad prism 8.01. 此时我们将已经输入好的 4 组 data 平铺开,每一组 data 尤其各自的 graph,但是如何将其组合在一起呢?且看:2. 点击箭头所示的 n ...

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        10.16 中科院清华合作揭示 RNA 甲基化调控 R-loop 形成及转录终止机制

        ① 中科院清华合作揭示RNA甲基化调控R-loop形成及转录终止机制m6A修饰作为信使RNA上丰度最高的修饰类型,广泛参与哺乳动物的发育、免疫、干细胞更新、脂肪分化以及肿瘤生成和转移等生命过程。然而,目前尚不清楚m6A是否能作为R-loop中RNA组分的本源特征来调控R-loop水平,进而发挥各种生物学功能。中国科学院北京基因组研究所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前文团队合作,通过斑点分子杂交和免疫荧光技术,发现敲 ...

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        Cancer Research And Treatment - 一本审稿快,助力毕业的 3 分好刊

        今天就给大家推荐 1 份韩国人主办的杂志:《Cancer Research And Treatment》,官方简称 CANCER RES TREAT 。为行文方便,在下文中以 CRT 作为简称。ISSN:1598 - 2998。 一审周期在 1 个月左右,目前影响因子 3 +,正好达到某些院校硬性的毕业标准。1. 期刊基本信息介绍CRT 是韩国癌症协会的同行评审的开放获取出版物。每季度出版一次,每年一卷。它接受与实验和临床癌症研究相关的文章。凡是和肿瘤有关的研究几乎都收录,具体项目从官网摘录 ...

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        如何写好论文的摘要部分?

        在经济学中,有宏观与微观之分。SCI 写作同样如此,宏观上,你要知道各个部分的要求、大致框架;微观上,通过不断的锻炼、写作,从而提高自己遣词造句的能力。没有宏观上的把控,写作的时候往往拿捏不准,丢东落西。就像国庆阅兵时的领头标兵,只有方向对了,才能引领队伍正确前行!话不多说,下面就一起翻开 Abstract 修炼手册。主要介绍主流的结构化摘要。跟着我左手右手一个慢动作,燥起来!图片来源:自己做的Abstract ,也就是摘要。主要分为 ...

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        CAMP - 安利一个分析膜蛋白相关信号通路的神器

        原来想给你们找找看有没有什么更好看一些的信号通路工具,但最后发现了这个:CAMP,大家应该也都知道,信号通路最初始是从膜受体接受到信号后,往下传递的。而很多膜受体,也是药物治疗靶标和肿瘤标记物。CAMP 就是用来搜索信号通路中膜受体相关信息的,比如,不同的肿瘤中,可能传递的信号通路也未必一样,不同的影响,对肿瘤的生存预后也不一样。比如,给你们搜一个 EGFR:就出现了这么一个简陋的 Network 图……我们也可以通过筛选,选择不 ...

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        单株 GWAS 与 BSA 结合快速鉴定株高候选 SNP

        GWAS 是定位 QTL 和多种作物性状相关的 SNPs/gene 的重要工具。典型的 GWAS 多用在自然群体中。本研究提出了一种单株 GWAS(sp-GWAS)分析的策略,不需要提供一系列其他不同品种或品系(听起来是不是有些不可思议)。但是 sp-GWAS 依赖于从随机交配群体中取样的单个植物的表型和基因型。更重要的是本文证实了 sp-GWAS 能够有效的和 BSA 策略结合快速确认显著关联的 SNPs。sp-GWAS+BSA 最大的特点就是群体材料的准备不需要庞大的资源 ...

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        如何在 NCBI 查找指定物种及近源物种的基因组信息

        一个合适的参考基因组对于生物信息学的分析至关重要,参考基因组的选择原则一般是同一物种、组装完成度高并且为最新版本,退而求其次也可以选择近源物种的基因组。那么如何知道 NCBI 数据库是否发布了自己关注的物种基因组,又如何去查找某个物种的基因组信息呢?若没有该物种的基因组信息,又如何查找近源物种的信息呢?在我们与客户的沟通中,发现小可爱们总会有这样的困扰,那究竟该如何在 NCBI 上查找指定物种及近源物种的基因组信息呢,接下 ...

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        系统进化树的构建步骤和软件安利

        系统发生树(英文:phylogenetic tree 或 evolutionary tree)又名分子进化树,被认为具有共同祖先的各物种间演化关系的树,它用来表示系统发生研究的结果,是生物信息学中描述不同生物之间的相关关系的方法。通过系统学分类分析可以帮助人们了解所有生物的进化历史过程。如此一来,关注系统分类的亲们就需要先确立一个小目标 —— 构建一棵系统进化树 —— 看看下面的步骤,构建系统进化树拢共需要 5 步。可仅建树方法选择这一步,就有多种选 ...

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        如何知道自己的电脑是否可以运行科学绘图工具ChemOffice 18?

        ChemOffice 18 全新来袭,旨在为科研工作者们提供最新的科学智能应用程序组件,完美支持 Win10 +Office 2016 & Office 365,还能免费订购 ChemDraw 云。很多朋友在选购 ChemOffice 18 套件的时候,不知道自己的电脑是否能正常运行。本教程通过介绍 ChemOffice 18 的系统要求,帮助用户选择适合自己的版本。硬件需求:基本规格:内存 RAM:32 位系统 1 GB 内存,或 64 位系统 2 GB 内存处理器:1.6 GHz 或以上硬盘空闲空间:300MB- 1 GB(1 GB ...

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        Chemoffice 2018 的安装教程

        安装步骤:安装前先关闭杀毒软件和 360 卫士,注意安装路径不能有中文,安装包路径也不要有中文。试装系统:win10 64bit安装版本:Chemoffice 20181. 解压安装包(注意解压的路径不要有中文)。2. 以管理员身份运行安装程序。3. 软件自解压完成后,遇到如下对话框,直接点击 「quit」。4. 点击 「确定」。5. 点击 「Next」6. 将下拉条拉到最下面,选择 「I accept」,然后点击」Next」.7. 选择安装路径,然后点击 「Next」。8. 选择 chemscript, ...

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        Graphpad 作图教程 | 手把手教你绘制 cleveland 点图

        今天继续给大家介绍科研作图神器 - Graphpad Prism。大家在阅读文献的时候一定看到过下面这种统计图,形似火柴或者棒棒糖,行话叫 Cleveland 点图,用来反映各分组中某指标平均值。图片来源:百度图片话不多说,我们直接进行方法介绍。1. 点击选择 XY 模块,按下图选择①②③④。2. 将数据输入表格,将横坐标轴分成 1 - 20 个分组,Y 轴 1 - 10,10 - 20 的数据分隔开输入,用来表示两种颜色。3. 点击 graphs 下面的 data1,按下图选择,得到图形的 preview。4. 点击 ok 生成图 ...

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        绘制机制图和假说图,容易上手又高逼格的软件盘点

        完成一篇科研论文的时候经常要将很大的精力投入到「分子机制图」或者「序列绘制」的美化中,人靠衣装,佛靠金装,科研成果靠图装,我们通常可以在 Cell Reports 此类的顶级杂志上看到的机制图都是既有内容逼格又高,我们又如何应用绘图软件绘制出高分杂志上的机制图效果呢?一、IBS官网链接:http://ibs.biocuckoo.org/download.phpIBS(Illustrator for Biological Sequences) ...

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        3 种方法注释你的甲基化探针

        甲基化芯片背景甲基化芯片原理:https://www.jianshu.com/p/c4f758e0399d芯片主要分为EPIC和450k两种,EIPC也就是850k,两种探针的都是以cg开头的数字编号,所谓注释也就是提取这些探针的所对应的信息,例如,探针序列的CpG位置信息,对应的基因信息,染色体上的位置信息,等等。很多包在安装的时候都会自动下载这些注释信息,并包装在一起,如果我们想要自己注释这些探针,就要考虑如何获 ...

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        Pubmed 的 3 个实用小功能,解锁文献高级检索姿势!

        PubMed 科研党们收藏夹里必不可少的网页,然而你真的会用它吗?今天给大家介绍 Pubmed 的几个实用小功能,教你精准快速查找文献!一、提高关键词检索精度有时会同时检索多个关键词,Pubmed 会自动以词组为单位进行检索,如果检索到词组还好,但如果没有查到相应词组(多数是因为没有输入最常用的英文专业名词),Pubmed 则会按照各个单词进行检索。所以 colonic Neoplasms drug therapy 就相当于 colonic AND neopl ...

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        如何用 Image J 计算细胞划痕?

        细胞划痕实验是一种简单易行的检测细胞运动的方法,实验成本低,可以用来检测贴壁生长肿瘤细胞的侵袭转移能力。划痕实验大家会做,那么如何将这一大批的图片进行实验距离的测定呢?Image J又要派上用场了,它不仅可以用于分析DNA电泳WB条带的灰度值、细胞计数、细胞共定位,就连细胞划痕面积一样可以计算!一、划痕实验的实验原理和步骤先简单的回顾下划痕实验的实验原理和实验步骤。1.实验原理细胞划痕法是测定肿瘤细胞的运动特性的 ...

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        10.15 Mol Cell 利用 Cas13 开发出经编程后杀死人细胞中 RNA 病毒的新技术——CARVER

        ① Mol Cell 利用 Cas13 开发出经编程后杀死人细胞中 RNA 病毒的新技术——CARVER人们此前已将 Cas13 酶用作一种切割和编辑人类 RNA 的工具,并且将它用作一种检测病毒、细菌或其他靶标存在的诊断试剂。在一项新的研究中,来自美国麻省理工学院、哈佛大学和布罗德研究所等研究机构的研究人员将 Cas13 的抗病毒活性及其诊断能力结合在一起,构建出一种有朝一日可能用于诊断和治疗病毒感染的系统。他们的系统称为 CARVER(Cas13 -Assist ...

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