绘制机制图和假说图，容易上手又高逼格的软件盘点

完成一篇科研论文的时候经常要将很大的精力投入到「分子机制图」或者「序列绘制」的美化中，人靠衣装，佛靠金装，科研成果靠图装，我们通常可以在 Cell Reports 此类的顶级杂志上看到的机制图都是既有内容逼格又高，我们又如何应用绘图软件绘制出高分杂志上的机制图效果呢？

一、IBS

官网链接：http://ibs.biocuckoo.org/download.php

IBS（Illustrator for Biological Sequences）是一款简单又强大的绘图软件，它可以几分钟内完成图形的绘制。同时，还拥有多种模板与配色方案，可显著提升绘图效果，从而为我们作图提供了很大的便利。那如何使用 IBS 进行绘图呢既可以画蛋白质序列，也可以可视化核酸序列。

1. IBS 功能介绍

① 直接 UniProt 的注释信息，搜索蛋白质 ID，可以自动绘制蛋白质功能结构域示意图。

② 画图完成后，还可以保存，可以导出矢量图/ 300dpi 的图片，甚至可以导出 600dpi 的图片。图片清晰读可以得到保证。

2. IBS 绘制的效果图

既可以可视化蛋白序列，还可以可视化核酸序列，还可以在同一张图上可视化多条序列。

3. IBS 优缺点

优点：这款软件简单易学，适合做出细胞信号通路。囊括了分子生物学的基本元素如不同的细胞、细胞器、分子甚至箭头；经典细胞通路的模板比如 NF-KB，JAK/STAT 通路的模板，只要直接在模板上修改即可；还有临床研究中常用的人体肌肉系统、循环系统、神经系统等解剖图，附加器官模型、细胞种类等。相比较微软 PowerPoint、Adobe Illustrator 或 Photoshop 绘制生物序列图来的省时间，更加精确

缺点：配色有点丑，元素颜色和立体感形态已固定，颜色调节和形态调节较麻烦。 因为是在线绘制软件，如遇到断网情况，不好操作

二、Pathway Builder Tool

官网链接：http://www.proteinlounge.com/PathwayBuilder.aspx

这款软件是绘制分子机制图的最常用软件，自带几乎所有分子生物学会用到的元素，如不同的细胞，细胞器，分子，老鼠模型, 器官模型... 另外，这个软件自带很多经典通路，在上面可以直接修改，非常方便。

1. 功能介绍

① 软件提供了一些模板，以及预先设计好的信号通路，如下图所示：

② Pathway Builder Tool 的生物元素

自带几乎所有分子生物学会用到的元素，如不同的细胞，细胞器，分子，老鼠模型...

2. Pathway Builder Tool 绘制的效果图

pathway builder tool 软件自带很多经典通路，在上面可以直接修改，非常方便。

3. Pathway Builder Tool 优缺点

优点：它能够通过最快与最简单的方式创建分子机制图，从而让您能够快速设计自己家的项目，而且软件自动了丰富的模板，帮助用户快速完成创建，而且能够支持编辑插入文字、选择背景色等功能。

另外，提供了细胞器、分子、箭头等多样的工具，从而能够满足用户对于信号通路图的制作需求，非常适用于演示、出版物等型号通路图的需求，且软件内存小，仅仅 5MB，安装快，操作简单，如果不想按照，也可以在线使用

缺点：元素颜色和立体感形态已固定，颜色调节和形态调节较麻烦。模板的颜色不太好变编辑，所以自己调节的的新机制图，配色方面会有弊端，美观性还有待提高

三、Science Slides

ScienceSlides 是一个 PowerPoint 插件，包含 1600 多个生物医学相关对象，在做 PPT 文件时可以直接通过工具条插入使用这些对象，从而免去了到处找相关文件的麻烦，也省了要切换软件拷贝粘贴的麻烦，提高做 PPT 的效率。

ScienceSlides 2005 的对象和模板涉及 Biochemistry、Pharmacology、Methods、Biology、CommonShapes、Molecular、Pathology、Signaling 等领域。

1. ScienceSlides 功能介绍

包含了大量的专业素材，比如神经元，细胞，人体结构，DNA 等等，而且都是彩色的，具有很好的视觉效果。

2. Science Slides 绘制的效果图

绘制出来的图，具有很好的视觉效果。通过修改、组合，画出来的图足以媲美老外的 CNS 了。

3. ScienceSlides 优缺点

优点：图库很精彩，色彩丰富，元素众多。包含 1600 多个生物医学相关对象，在做 PPT 文件时可以直接通过工具条插入使用这些对象，从而免去了到处找相关文件的麻烦，也省了要切换软件拷贝粘贴的麻烦, 操作简单，直接在 PPT 中编辑。

缺点: 安装过程比较麻烦，兼容性差，需要减低 ppt 版本，一般是 Microsoft Office 2003 / 2005 / 2007 适用。在 64 位的操作系统上安装会出现问题，在高于 2010 版的 office 上安装可能也会出现问题

四、PPT

Microsoft Office PowerPoint 是办公软件中主要组件之一，主要用于演示文稿的制作，在演讲，教学，产品演示等方面得到广泛的应用。

1. PPT 功能介绍—绘制的元素

这次的素材元素还有很多，全部都是用 ppt 图形绘制。颜色丰富，没一个图层都可以编辑。

2. PPT 绘制效果图

PT 插件可以绘制出的效果，直接用 ppt 同样可以绘制。效果很形态可以根据自己的需求美化绘制。

3. PPT 优缺点

优点: 色彩丰富美观，绘画功能也很强大，图片可塑性大。排列组合都可以根据自身需求绘制，没有局限性。追求美观精致的用户首选。

缺点：在没有素材的情况下，自我手动绘制比较费时，操作难度系数大，操作过程繁琐。对于时间紧蹙，操作小白的人不推荐全靠 ppt 纯手绘。

使用心得

软件的详细介绍就到这里啦，通过小编的亲测，4 款软件各有千秋，都是很实用的绘图软件，以下是我给大家的一点点总结建议，可供参考：

• 序列图的绘制推荐使用 IBS, 尽管序列图的如见绘制我只推荐了一款，但是下面绘制机制图的软件都是可以绘制序列图的，只是难度系统和精准效果没有 IBS 的好。

• 通路图，对于小白推荐 Pathway Builder Tool，此软件上手很容易，通路模版也较多。对于软件技能强的人，PPT 和 AI 软件首选。绘图不受限制，可根据需求发挥，如有素材可以提高绘图速度。