邻接顺序分析 nearest－neighbor sequenceanalysis

互联网2013-11-14

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为了解核酸合成反应的产物是否反映模板的碱基排列所用的方法。例如对α位磷用³² P标记的 dATP（脱氧 ATP）和不标记的 dGTP、 dCTP、 dTTP作为底物合成 DNA。则合成的 DNA链中 ³² P总是位于脱氧腺苷的第 5位上。如果用小球菌脱氧核糖核酸酶和脾磷酸二酯酶分解此 DNA。则可在 DNA链中以结合于腺苷的 5′位一侧的相邻的核苷 3′位上的形式回收 ³² P。因此假如就四种核苷酸测定 ³² P的分布。则可以了解 DNA 中存在于腺苷 5′位一侧的各核苷酸的量。用其它核苷酸进行同样的实验，而关于用一定模板合成的 DNA的 16种相邻核苷酸的出现频度就可以全部求出。各种 DNA均有其特有的频度值，对于 RNA也能进行同样的分析。