【求助】如何查找miRNA存在于哪一段基因序列中
丁香园论坛
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我测了一段miRNA的种子序列，如何查找它存在于哪一段基因的区域内，BLAST、miRBase、TargeScan如何使用，还请各位战友提供帮助。谢谢！
有了目的序列后这个我想BLAST应该可以出来了吧。具体做法你自己摸索估计比让人在网上教更快。当然什么具体问题可以提出来。mirbase和targetscan也是一样。下面的连接是NCBI的中文教程，希望对你有所帮助。
http://biochemistry.dxy.cn/bbs/topic/18460560?tpg=1&age=0
http://www.dxy.cn/bbs/thread/2129072?&keywords=NCBI+%D6%D0%CE%C4
http://biochemistry.dxy.cn/bbs/topic/18460560?tpg=1&age=0
http://www.dxy.cn/bbs/thread/2129072?&keywords=NCBI+%D6%D0%CE%C4
这个blast能测miRNA的转录起始位置么，这是我最关心的问题，麻烦高人指点一下！
blast后也会是非常多的位置，对你的实验帮助很少
那该怎么办啊，有什么方法可以删选miRNA呢
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