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        【求助】查microRNA 前面的一段基因序列

        丁香园论坛

        3290
        我想知道microRNA 前的序列应该怎么查
        望高人指点
        就在版块上有一个“如何查找pre-miRNA上下游的序列?”既然上下游都可以,你为什么还要来一个上游怎么查?学习不要只到达目的,而在于你的学习过程。请见下面帖子,可能会对你有帮助的。
        http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=154&id=15429796&sty=1&tpg=1&age=0
        找个找到pre-microRNA 序列在NCBI上进行blast就可以了
        把microRNA名称发到论坛上,我帮你查找
        vitrogene wrote:
        把microRNA名称发到论坛上,我帮你查找


        为何你不“授人以渔”而要“授人以鱼”,论坛的主要目的是大家交流,互通有无!你把你的方法贴上来相信版主会加分的。
        版主freecell留言:
        楼上不是卖“渔”的,是来卖货的。相关内容我已经编辑过了。
        新手也来凑个热闹:
        1、要先看看是不是你所做的物种基因组测序公布,如果没有,不一定能很容易的得到你要的序列;
        2、如果miRNA是注册过的,那可以从miRBase得到前体序列;如果是一个新的,也就是测序得到的假定序列,那就要blast,但是不知道是不是能得到相对准确的前提序列,一是要依赖基因组测序,而是要根据定义做前体结构分析;
        3、得到前体序列以后,到NCBI blast,如果基因组是测序并公布的,自然能得到上下游序列;如果没有公布,根据EST等的结果,不一定能得到准确的上下游序列,但是也可能能得到上下游序列。

        敬请各位评判!

        本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴

        师兄微信号:shixiongcoming

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