【求助】查microRNA 前面的一段基因序列
丁香园论坛
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我想知道microRNA 前的序列应该怎么查
望高人指点
望高人指点
就在版块上有一个“如何查找pre-miRNA上下游的序列？”既然上下游都可以，你为什么还要来一个上游怎么查？学习不要只到达目的，而在于你的学习过程。请见下面帖子，可能会对你有帮助的。
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=154&id=15429796&sty=1&tpg=1&age=0
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=154&id=15429796&sty=1&tpg=1&age=0
找个找到pre-microRNA 序列在NCBI上进行blast就可以了
把microRNA名称发到论坛上，我帮你查找
vitrogene wrote:
把microRNA名称发到论坛上，我帮你查找
为何你不“授人以渔”而要“授人以鱼”，论坛的主要目的是大家交流，互通有无！你把你的方法贴上来相信版主会加分的。
版主freecell留言:
楼上不是卖“渔”的，是来卖货的。相关内容我已经编辑过了。
楼上不是卖“渔”的，是来卖货的。相关内容我已经编辑过了。
新手也来凑个热闹：
1、要先看看是不是你所做的物种基因组测序公布，如果没有，不一定能很容易的得到你要的序列；
2、如果miRNA是注册过的，那可以从miRBase得到前体序列；如果是一个新的，也就是测序得到的假定序列，那就要blast，但是不知道是不是能得到相对准确的前提序列，一是要依赖基因组测序，而是要根据定义做前体结构分析；
3、得到前体序列以后，到NCBI blast，如果基因组是测序并公布的，自然能得到上下游序列；如果没有公布，根据EST等的结果，不一定能得到准确的上下游序列，但是也可能能得到上下游序列。
敬请各位评判！
1、要先看看是不是你所做的物种基因组测序公布，如果没有，不一定能很容易的得到你要的序列；
2、如果miRNA是注册过的，那可以从miRBase得到前体序列；如果是一个新的，也就是测序得到的假定序列，那就要blast，但是不知道是不是能得到相对准确的前提序列，一是要依赖基因组测序，而是要根据定义做前体结构分析；
3、得到前体序列以后，到NCBI blast，如果基因组是测序并公布的，自然能得到上下游序列；如果没有公布，根据EST等的结果，不一定能得到准确的上下游序列，但是也可能能得到上下游序列。
敬请各位评判！
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