【求助】如何进行BLAST的本地化
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如何进行BLAST的本地化,除了比对询问的序列与网站序列之外,怎么样才能比对自己的二条序列或多条序列?不胜感激,网上搜索的全部都是不太详细的大致的内容. 我是电脑菜鸟,急求.
最好是和NCBI的官方网站一样的用户界面. 不要在DOS下操作,太难了.
或 妹儿 gggchilly @ yahoo.com.cn
3ks.
最好是和NCBI的官方网站一样的用户界面. 不要在DOS下操作,太难了.
或 妹儿 gggchilly @ yahoo.com.cn
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基因库恐怕无法本地化，BLAST就无法本地化。
bioedit 软件可以blast本地化，从ncbi上下载自己感兴趣的数据库，就可以搞定了。
adon wrote:
bioedit 软件可以blast本地化，从ncbi上下载自己感兴趣的数据库，就可以搞定了。
Full NCBI package of local BLAST programs, database creation, and internet BLAST client 2.0, with sample protein database of E. coli open reading frames.
楼主详细读读adon推荐的软件说明书吧，看看能否完成你的任务。
其实国内南京农业大学做了一个很小很方便的软件可以进行简单的BLAST，但必须你自己先找到序列才行的，软件名是：BioXM，你可以试试
gggchilly wrote:
如何进行BLAST的本地化,除了比对询问的序列与网站序列之外,怎么样才能比对自己的二条序列或多条序列?不胜感激,网上搜索的全部都是不太详细的大致的内容. 我是电脑菜鸟,急求.
最好是和NCBI的官方网站一样的用户界面. 不要在DOS下操作,太难了.
或 妹儿 gggchilly @ yahoo.com.cn
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其实不是blast。
blast其实也能本地，将很多数据库下载到自己服务器就可以，不过个数据库很大很大吧。没有超级的服务器我估计放不下。或者只放一些自己感兴趣的物种倒也可以。
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