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PCR引物设计

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【建议】免费引物设计

IPrime为您提供的专业服务,满足各种科研和诊断的需求。我们承诺保证引物工作。因调查需要,现提供第一对引物免费设计的优惠。有需要的朋友可填写表格(附件),将基因信息及引物设计的详细要求,以邮件的形式发送给我们。需要免费引物设计的朋友请使用学术机构域名下的邮箱地址与我们联系:liu.jun(at)yale.edu 如需更多引物设计,请查看附件中的相关引物服务列表。详细服务内容如下:1. 普通PCR引物设计2. Real-time P ...

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【原创】简并引物设计与筛选---供新手学习,与高手交流

最近一直专注于简并引物的设计。从园子里和其他地方学习了不少,终于也设计出了满意的简并引物。现将全过程一并贴出,以供大家学习交流用。所用软件:DNAMAN, FastPCR,在线Blockmaker (http://bioinformatics.weizmann.ac.il/blocks/blockmkr/www/make_blocks.html),在线Codehop (http://bioinformatics.weizmann.ac. ...

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【原创】引物特异性 已经设计好引物 在线引物blast 比对

本帖介绍了在PubMed主页进入引物blast的操作,有需要的战友可以浏览图片。稍等片刻,系统运行中~

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【分享】经典引物设计软件说明 及软件**的oligo6.0

Oligo使用方法介绍转载请注明来自丁香园发布日期: 2006-12-13 19:57 文章来源: 丁香园关键词: Oligo 引物设计 PCR 软件作为目前最好、最专业的引物设计软件,Oligo的功能很强,在这里我们介绍它的一些主要功能,如:普通引物对的搜索、测序引物的设计、杂交探针的设计以及评估引物对质量等等。在正式进行引物设计前,我们首先面临的一个任务就是向Oligo程序导入模板序列,根据不同的实验情况,导入模板有三种方法:1、直接用键盘输入 ...

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【分享】书籍:PCR Primer Design (2007)

PCR Primer DesignBook DescriptionIn the past decade, molecular biology has been transformed from the art of cloning a single gene to a statistical science measuring and calculating properties of entire genomes. New high-throughput methods have been developed for genome sequencing ...

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高手请进:评价设计的引物?急!!!

预扩增包含8344位点的序列:8101 agatgcaatt cccggacgtc taaaccaaac cactttcacc gctacacgac cgggggtata8161 ctacggtcaa tgctctgaaa tctgtggagc aaaccacagt ttcatgccca tcgtcctaga8221 attaattccc ctaaaaatct ttgaaatagg gcccgtattt accctatagc accccctcta8281 ccccctct ...

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紧急求救!用做原核表达的PCR引物

大家好,我都快急哭了,希望各位多多关照...我刚进实验室,老板就给我一课题,就是做病毒外壳蛋白基因的原核表达,我查了大量资料,一点头绪都没有.首先我要设计引物,这是我最大的难题.因为没有人带我,只有自己摸索,万般无奈下,我只好来到丁香家园向大家求救.下面是我课题一些情况:我要作的病毒CP基因序列:ORIGIN1 atgggcacca acaagccagc cactctagct gatttgcaga aggcaattaa tggcatctc ...

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PCR引物设计原则

PCR引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列。因此,引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否。要设计引物首先要找到DNA序列的保守区。同时应预测将要扩增的片段单链是否形成二级结构。如这个区域单链能形成二级结构,就要避开它。如这一段不能形成二级结构,那就可以在这一区域设计引物。现在可以在这一保守区域里设计一对引物。一般引物长度为15~30碱基,扩增片段长度为100~600 ...

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常用引物序列:奉献给大家

RT-PCR引物序列 基因来源 引 物 序 列 产物大小(kb)β-actin 人 有意义链CCTCG CCTTT GCCGA TCC 反义链GGATC TTCAT GAGGT AGTCA GTC 0.62 kbβ-actiundefined 大鼠 有意义链TACAA CCTCC TTGCA GCTCC 反义链GGATC TTCAT GAGGT AGTCA GTC 0.62kbβ-actin 小鼠 有意义链GTCGT ACCAC AGGCA TTGTG ATGG反义链GCAAT GCCTG GGTAC ATGGT GG 0.49 kbGAPDH 人 有意义链 GGTGA AGGTC GGAGT CAACG ...

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【分享】PCR Primer Design (Methods in Molecular Biology) 下载

因为之前有个帖子,邮箱中的资源被不良的人删掉了,所以特发此贴。rayfile地址:http://www.rayfile.com/files/098fe2ee-891e-11dd-9cdc-0014221b798a/不会下的可以留下邮箱号我发给你。Publisher: Humana PressNumber Of Pages: 431Publication Date: 2007-08-02ISBN-10 / ASIN: 158829725XISBN-13 / EAN: 9781 ...

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请教yong主任和各位高手,几个PCR引物设计的深层次的问题

目的:RT-PCR克隆全长目的基因做表达基因11: M25157. Rat Cu, Zn supero... LinksLOCUS RATSODCZL 601 bp mRNA linear ROD 27-APR-1993DEFINITION Rat Cu, Zn superoxide dismutase mRNA, complete cds.ACCESSION M25157VERSION M25157.1 GI:207011KEYWORDS superoxide dismutase.SOURCE Rattus norveg ...

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恳请相助:Taq man引物和探针设计

实验要求为:用实时荧光定量PCR检测损伤前后大鼠某一基因的表达变化,选用Taq man法,从ncbi中查到基因cDNA序列如下:(基因编号:NM_053613)1 atgaagaggg cgtcctccgg aggaagccgg ctgccgacat gggtgttatg gctacaggcc61 tggagggtag caacgccctg ccctggtgcc tgtgtgtgct acaatgagcc caaggtcaca121 acaagccgcc ccca ...

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下面是我设计的引物的BLAST结果,请大虾帮我解释一下。谢谢

下面是我设计的引物的BLAST结果,请大虾帮我解释一下。我这对引物做PCR是否有问题?谢谢。Query=(40 letters)Database: All GenBank+EMBL+DDBJ+PDB sequences (but no EST, STS,GSS,environmental samples or phase 0, 1 or 2 HTGS sequences)2,862,112 sequences; 12,768,194,998 total lettersIf you have any problems or q ...

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UNISTS的序列是否可以直接作为RT-PCR的引物?

我要做一个RT-PCR看看PEDF在组织中的表达在uni-sts里找到PEDF的STS请问是否可以直接拿Forward primer: AGAACAAAGATGAACGGTCGGTReverse primer: ACCAACTCTTTGCAGGACATGA来做RT-PCR的引物?如何验证?谢谢http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/sts/sts.cgi?uid=211288UniSTS:211288 Li ...

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[分享]Blastn之引物序列验证篇

先找到需要设计引物的目标基因的在有引物序列的mRNA序列,可以通过全文(如最先发现该基因的文章),全文中有时可以找到大鼠c-jun mRNA序列的ACCESSION NUMBER,在PubMed中的“Nucleotide”中用此ACCESSION NUMBER就能找到序列。可以利用这个ACCESSION NUMBER在PubMed中的“Nucleotide”中搜索到序列后,点击右边的“Links”,再点击里面的“Related Se ...

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【原创】PCR 引物设计及软件使用技巧

PCR 引物设计及软件使用技巧摘要:本文旨在介绍使用软件设计PCR 引物的技巧。在PCR 引物设计原则的基础上,详细介绍了两种常用引物设计软件的基本使用方法,并对其各自的优缺点进行了比较。一般性引物自动搜索可采用“Premier Primer 5”软件,而引物的评价分析则可采用“Oligo 6”软件。关键词:PCR;引物设计中图分类号:Q524 文献标识码: 文章编号:1自从1985 年Karny Mullis 发明了聚合酶链式反应以来,PCR 技术已成为分子 ...

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紧急求教各位高手:引物设计

我要作半定量RT-PCR,在文献上查引物序列用Primer分析,才50-60分,不知是直接引用文献的好,还是自己设计.下面是我从文献上查的几对引物,请帮忙看一下,可否直接引用,还是要重新设计。本人就要开始作RT-PCR了,急需您的帮助。Smad3 (308 bp, GenBank Accession No. NM_005902)5’-CAGAACGTCAACACCAAGT (nt 238–256)and 5’-ATGGAATGGCTGTAGTCGT (nt 545 ...

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请各位同道用blast帮我分析一下我的引物是否合适。急!!!先谢谢大家了

AIB1-U primer (5'-ATA CTT GCT GGA TGG TGG ACT-3'; sense; positions 110–130; GenBank accession no. AF012108)AIB1-L primer (5'-TCC TTG CTC TTT TAT TTG ACG-3'; antisense; positions 458–438; GenBank accession no. AF012108);如上为我的目的基因上下游引物,请各位同道帮忙用软件及blast分析一下,本人非常焦急,因试验结果很不好,正在 ...

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紧急求救.非常急,关于引物

大家好,我都快急哭了,希望各位多多关照...我刚进实验室,老板就给我一课题,就是做病毒外壳蛋白基因的原核表达,我查了大量资料,一点头绪都没有.首先我要设计引物,这是我最大的难题.因为没有人带我,只有自己摸索,万般无奈下,我只好来到丁香家园向大家求救.下面是我课题一些情况:我要作的病毒CP基因序列:ORIGIN1 atgggcacca acaagccagc cactctagct gatttgcaga aggcaattaa tggcatctc ...

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【旧帖整理】PCR引物设计常用软件

献给丁香园新站友1.Primer premierPrimer premier5.0http://www.premierbiosoft.com/DATAFILES/PP500Installer.exe注册机http://www.dxy.cn/bbs/user/download/471211/primer%205.0%E6%B3%A8%E5%86%8C%E6%9C%BA.zip使用教程http://www.bio-soft.net/down/PPr ...

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