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【分享】荧光定量PCR详细流程和问题解析(一)

前一段时间在百度中搜索,发现多年前写的一个关于荧光定量PCR技术的PPT有很多人看过或引用过,考虑到自己作荧光定量PCR工作已经了五年了,做的实验以及解决的问题远比五年前多了,因此利用过年的时间,写点荧光定量PCR实验中的一些注意事项及感想,无论对错,都是希望对相关的人员有些参考价值。荧光定量PCR原理等大家都已经很熟了,我就不细说了,主要是写一些有人问过的事,希望写的内容是大家都关心的。 普通PCR与荧光定量P ...

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【分享】著名生物技术公司特色简介

一、分子生物学Promega:Promega公司是分子生物学研究工具的经典品牌,已有接近30年的历史,是生命科学这个朝阳产业中的“老字号”。该公司所特有的萤光素酶生物发光技术,灵敏度高,信号/背景比率低,在基础研究和药物筛选领域内得到广泛的应用和认可。应用范围涉及报告基因检测;细胞学活力、细胞毒作用、细胞凋亡检测;蛋白酶、蛋白激酶、核受体检测,以及描述药物先导物的吸收、分布、代谢、排泄等特征性参数的一系列检测方法。Pr ...

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【分享】PCR新手心中的3个疑惑:解决方案!

Routine PCR? Let’s be honest, there’s no such thing. Even with the simplest PCR reaction things can go wrong, so you need to have a good checklist of ideas for troubleshooting and rectifying the problem. Today I have brainstormed all of the ways I can think of to approach problems with standard PCR reactions. ...

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PCR问题的总结,希望给你一些帮助

pcr产物的电泳检测时间一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚致消失。假阴性,不出现扩增条带  pcr反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及活性 ④pcr循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。  模板:①模板中含有杂蛋白质,②模板中含有taq酶抑制剂,③模板中蛋白质没有消化除净,特别是染色体中的组蛋白,④在提取制备模板时丢失过多,或吸入酚。⑤模板核酸变性不彻底。在酶和引 ...

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【公告】8月份中下旬0应助帖,加分从优!

希望战友们积极参与,加分从优!求助变性胶的电压求助LD-PCR的原理、应用、特点求助引物设计分析如何计算hardy-Weinberg平衡的理论值 ?可以用spss软件计算吗?求助NaI提取核酸对PCR的影响做PCR过程中有谁听说过或遇到过气溶胶污染吗? 哪个质粒可以做mRNA 稳定性的测定,可以实现定向连接?外周血抽提RNA是否有时间限制? 用限制性内切酶切片段序列是不是要比环状的载体难得多?帮助分析电泳图求助RT-PCR的 ...

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【原创】PCR常见问题总结

PCR产物的电泳检测时间  一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚致消失。假阴性,不出现扩增条带  PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及, ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。  模板:①模板中含有杂蛋白质,②模板中含有Taq酶抑制剂,③模板中蛋白质没有消 化除净,特别是染色体中的组蛋白,④在提取制备模板时丢失过多,或吸入酚。⑤模 板核酸变性不彻底。在酶和引物质量好时 ...

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[原创]PCR扩增产物的电泳分析

对琼脂糖电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳有非常详细的介绍,对于刚接触分生大的同志很有帮助.PCR扩增产物的电泳分析  凝胶电泳分琼脂糖电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳两种.一、琼脂糖凝胶电泳:  琼脂糖凝胶电泳是一种非常简便、快速、最常用的分离纯化和 鉴定核酸的方法.琼脂糖是从海藻中提取的一种线状高聚物.根据琼脂糖的溶解温度, 把琼脂糖分为一般琼脂糖和低熔点琼脂糖.低熔点琼脂糖熔点为62~65℃,溶解后在 37℃下维持液体状态约数小时,主要用于DNA片 ...

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请教:100分的引物,到底如何

我初次接触PCR,准备做转基因后体内表到的半定量RT-PCR。用primer和oligo设计了一对引物,在primer上二个引物都打了100分,产物98分。但是有人说软件设计的引物有时候得分很高也会做不出来,所以想请各位高手帮忙看一下。:)我对这对引物有两个疑问:1 下游引物以AAT结尾是否不太好?2 产物长度是213,是否太短了,跑胶不好看?Selected Primers-------------------------------------------------- ...

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--PCR/RT-PCR疑难问题解答--

--PCR/RT-PCR疑难问题解答1.问题:RT-PCR灵敏度:在琼脂糖凝胶分析中看到少量或没有RT-PCR产物。可能原因:1)RNA被降解建议解决方法:在用来验证完整性之前先在变性胶上分析RNA使用良好的无污染技术分离RNA;在将组织从动物体取出后立刻处理在100%甲酰胺中储存RNA;如果使用胎盘RNase抑制剂,不要加热超过45℃或pH超过8.0,否则抑制剂或释放所有结合的RNase。而且,在≥0.8mM DTT时加 ...

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请教,为什么扩不出来

基因序列cds,引物,目的片段如下:atggggacgccgggggaggggctg301 ggccgctgctcccatgccctgatccggggagtcccagagagcctggcgtcgggggaaggt361 gcgggggctggccttcccgctctggatctggccaaagctcaaagggagcacggggtgctg421 ggaggtaaactgaggcaacgactggggctacag ...

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【Protocol】 for competitive RT-PCR

Protocol for competitive RT-PCRFor quantifying mRNA, we use a competitive RT-PCR protocol with internal standard RNAs. These are added in a defined quantity to the RNA sample prior to the RT reaction. The resulting standard cDNA is coamplified with the same primers as the endogenous target seq ...

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【心得】RT PCR的△△ct法的原理和一个简单的excel处理表

数据分析excel地址http://d.dxy.cn/detail/4503890△△Ct法的推导过程PCR指数扩增公式是:Xn = X0 * ( 1 + Ex )n 式中,Xn是第 n 个循环后目标分子数,Xo 是初始目标分子数,Ex是目标分子扩增效率,n 是循环数。用Ct 代表目标扩增产物达到设定阈值所经历的循环数,因此:Xt = X0 * ( 1 + Ex )Ctx 式中,Xt 是目标分子X达到设定的阈值时的分子数,是一个常数。Ctx 是目标分子X扩增达到阈值时(即达到规定的拷贝数时)的循环数。对于看家基因的P ...

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【分享】PCR资源

以下是在我查的因物设计要注意的一些问题,和大家共享PCR引物设计的黄金法则1.引物最好在模板cDNA的保守区内设计。DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在NCBI上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。2.引物长度一般在15~30碱基之间。引物长度(primer length)常用的是18-27 bp,但不应大于38,因为 ...

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请教:如何找几个亚型基因的保守序列?

我想根据keratin基因(有30多个亚型)的共有保守序列,设计引物扩增,那位大侠能帮我找一下好吗?谢谢!keratin 5atgtctc gccagtcaag181 tgtgtccttc cggagcgggg gcagtcgtag cttcagcacc gcctctgcca tcaccccgtc241 tgtctcccgc accagcttca cctccgtgtc ccggtccggg ggtggcggtg gtggtggctt301 cggcagggtc ag ...

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【分享】Primer Premier中文使用说明

Primer Premier 4.10Primer Premier4.0是由加拿大的Premier公司开发的专业用于PCR或测序引物以及杂交探针的设计,评估的软件,和Plasmid Premier2.02一起是该公司推出的最新的软件产品。其主要界面同样也是分为序列编辑窗口(Genetank),引物设计窗口(Primer Design),酶切分析窗口(Restriction Sites)和纹基分析窗口(Motif)。这里我们主要介绍其引物 ...

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【转帖】邹承鲁院士写他是如何读文献的

邹承鲁院士写他是如何读文献的无论题目从何而来,都必需紧密追踪当前有关科学领域发展的动向。从研究生时代开始,在导师 教导下,以周围同学为榜样,我就养成了每周必定去图书馆浏览最新期刊的习惯,几十年如一日,雷打不动。如果确实有事,下周必定补上。我当时有一个小记录册,登录所有对本专业重要的刊物,每期读过后,一定做记录,决不遗漏一期,直至今日。现在可以在网上阅读所有重要刊物的目录和摘要,这就更容易做到了。掌握文献、对文献进行综合, ...

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【旧贴整理】6.1~6.15零应助帖整理

应助后请PM求助者!【求助】相同条件下,模板稀释后扩增不出来目标条带http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=6324633&sty=1&tpg=11&age=0请问同一种属不同品系的同一基因的MRNA相同吗http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=6328875&sty=1&tpg=10&age=0【求助】请教真菌中RT-PCR的内参http://www.d ...

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请教real time PCR的RT部分能否使用传统半定量RT-PCR试剂盒的反转录部分?

各位老师:您们好!偶欲做几个基因的RT-PCR实验。偶先用传统的半定量两步法RT-PCR试剂盒(TaKaRa DRR019A)扩增了几个基因,并用该试剂盒反转录了不少cDNA。但还有2个基因偶打算用real time PCR法来扩增。拟采用TaKaRa DRR041S试剂盒。但是TaKaRa DRR041S试剂盒说明书上写的反转录步骤是使用另外一个单独的RT Reagents (TaKaRa DRR033A),得到cDNA再用TaKaRa DR ...

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【原创】新手总结PCR/RT-PCR疑难杂症(为PCR痛苦的xdjm进来看看)

这里,很多经常遇到的问题,比如引物设计,PCR体系和条件,电泳条带分析等,我没有一一详细列举,因为这些原因比较容易找到,我这里列举的可能多是些容易忽略的疑难杂症,希望对大家有帮助。(说了是疑难杂症了,可能有一些看法走极端了,但是为了做出实验,怀疑一切,狗急跳墙,没事找抽也是值得的)。1.引物设计引物的参数合理控制,像发卡结构,错配,二聚体等,只要别太过分,问题应该不大,当然没有最好,个人感觉上下游两条引物的退火温度这个参 ...

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PCR 问题总结

PCR常见问题总结PCR产物的电泳检测时间一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚致消失。假阴性,不出现扩增条带  PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及活性 ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。  模板:①模板中含有杂蛋白质,②模板中含有Taq酶抑制剂,③模板中蛋白质没有消化除净,特别是染色体中的组蛋白,④在提取制备模板时丢失过多,或吸入酚。⑤模板核酸 ...

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