尽管研究基因组的技术已经相当先进,科学家们还在致力不断的创新和改造技术使之更为强大。现代分子生物学两个划时代的技术——DNA芯片和RNAi (RNA-mediated interference) ,正在掀开生物医药的新篇章。RNAi,通过双链RNA引发目标靶基因沉默的一项强大的新技术,专一性强,可大规模操作,重复性高,应用前景极为广阔。另一方面,DNA芯片技术可以提供特定条件下一个细胞中所有基因表达情况的全景图,同样具有无 ...
Human RNA silences viral DNAMicroRNA plays an unexpected role in the process, researchers report in Science | By Charles Q ChoiRNA silencing can defend against viruses in humans, French scientists report in this week's Science. Surprisingly, say the scientists, microRNA (miRNA) appears ...
据《科学》杂志4月23日报道,MicroRNA在人体发育过程中起着意想不到的作用。法国科学家称核糖核酸沉默机制(RNA silencing)能够抵抗人体中的病毒,不可思议的是,小RNA (miRNA)竟然是组成这一机制的基础。“科学家一直认为miRNA与调节内源基因有关,而小分子干扰核糖核酸(iRNA)能够控制外源基因,尤其是病毒RNA基因,”该文的主要作者、来自法国斯特拉斯堡的植物分子生物学院的查利斯·亨利·莱西利亚在《科学 ...
RNA Related Links MicroRNA LinksThe miRNA Registry at Rfam (Sanger, UK)http://www.sanger.ac.uk/Software/Rfam/mirna/index.shtmlMirScan Web Serverhttp://genes.mit.edu/mirscan/TargetScan Web Serverhttp://genes.mit.edu/targetscan/MirSeeker Web Serve ...
RNA样品的完整性在应用芯片技术(Microarray)和RT-PCR的基因表达分析实验过程中至关重要。传统的RNA样品QC只是界定RNA浓度,而对RNA 完整性没有针对性的测定标准。2100 Bioanalyzer为您提供了一整套快速简便的total RNA 及mRNA完整性测定平台。今天,RNA Integrated Number (RIN),已经成为了世界公认的最为权威可靠的RNA样品质量控制标准之一。“The Introduction ...
一、RNA抽提注意事项_尽可能无RNA酶的环境下操作,最好有专门场所_耗材的处理:电泳槽需0.5 M NaOH处理过夜后DEPC水清洗试管氯仿浸泡处理后DEPC水清洗枪头和eppendorf管DEPC水浸泡后灭菌处理_实验者本身防护:一次性手套,口罩等_启盖前震荡离心管有助于防止气溶胶形成_正确的操作方式二、RNA操作常见问题分析 问题 可能原因 解决方法产量太低 样本裂解或匀浆不充分 延长匀浆时间 RNA沉淀溶解不充分 65℃加热可促进溶解A260/A2 ...
超经典的《miRNA实验指南》,美 Shao-Yao Ying主编军事医学科学院郑晓飞主译。研究microRNA的同仁值得一看。目录第一章microRNA---调控基因功能的RNA基因概述第二章microRNA前体结构分析第三章microRNA的生物形成-----分离与鉴定微处理体复合物第四章Pri-miRNA转录物的识别与切割第五章 以小鼠胚胎干细胞为遗传系统模型探索RNA干扰机制第六章microRNA与信使RNA的回归 ...
找了个公司做RNAi,只做构建载体,转染细胞,找到干扰效果好的片段后,做成腺病毒载体,包装之后给我。公司给了个协议,我改了一下,大家帮忙看看要公司提供的东西够不够全面了,因为这个是论文的一部分,所以必须尽可能详尽,也怕写的不够详细公司偷懒赖账。另外有没有提的要求不合理的,也请大家指出。希望协议既要最大限度的满足我的需要,也要兼顾公平。谢谢呀。第一条 服务内容1.1甲方委托乙方完成COMF-shRNA构建、RNAi筛选、腺 ...
Gene (Ref)Accession #Position from ATGGene Target(Comments)Cell Line Testedß-actin (1) NM_001101972-994aatgaagatcaagatcattgcHuman HeLagamma-actin (1) NM_0016148-30aagagatcgccgcgctggtcaHuman HeLaAIB1 (estrogen receptor coactivator) (22) AAAGAC ...
小弟最近在做荧光定量。由于荧光定量的灵敏性,一个处理组如果只做3个生物学重复(即每个处理组取3尾实验动物,分别提RNA,分别反转录,做定量),那个体之间的差异,势必会使实验结果难以分析。【以上内容可参考: http://www.dxy.cn/bbs/topic/16659187 下文中,第1种思路类似该帖中第1种情况。】为了增大样本量,以更好地估计总体,同时为了减小个体间的差异对实验的影响,且为不使试验成本过高,我身边的人有以下3 ...
http://www.ambion.com/techlib/tb/tb_502.htmlPublished siRNA Target SequencesApril 2003 - The significant increase in the rate of publication of siRNA target sequences has made it difficult to maintain a comprehensive list of these sequences. Therefore, we will no longer be upda ...
设计原则:1.克隆到shRNA表达载体中的shRNA包括两个短反向重复序列,中间由一茎环(loop)序列分隔的,组成发夹结构,由polⅢ启动子控制。随后在连上5-6个T作为RNA聚合酶Ⅲ的转录终止子。2.两个互补的寡核苷酸两端须带有限制性酶切位点。3.Stratagene发现29个寡核苷酸较之原先推荐的23个寡核苷酸可以更有效的抑制目的基因。4.在启动子下游的酶切位点下方紧连一个C,使插入片段和启动子有一定空间间隔 ...
美国FDA已批准用RNAi进行临床研究。我国要加快进行RNAi临床前研究,需合成单位、研究单位和药厂通力合作,请各位对合成siRNA的成本降低、修饰、靶向给药、体内给药方式和剂量、药代动力学方法等提出宝贵意见。以便联系合作和互相促进、共同提高。附上RNAi临床前研究和临床新进展。4364753@sina.com.cn近据国外医药信息刊物报道,一种全新生物工程药品“RNA干扰剂”(非干扰素)业已浮出水面并有望在3年内上 ...
一旦生物样品被收集采摘,它的RNA会立刻变得非常不稳定,极易被降解。由于特异及非特异的RNA降解,或者由于应激反应产生新的RNA都会引起RNA状态的改变。对于生物芯片、基因表达矩阵分析(Array Analysis)、定量RT-PCR等实验来说,采 样后立即稳定样品里的RNA以保存当时RNA的表达状态,是精确/定量研究基因表达分析的重要前提。为了达到这个目的,往往需要将液氮或者干冰带到采样现场,采样后立即运回实验室保存。 ...
【共享】英文)RNAi实验中双链短RNA(dsRNA)制备过程,本实验方法来自于加州大学Jim教授实验的.====请给出来源或连接.Procedure for the Generation of dsRNA for use in RNAi1. Design polymerase chain reaction (PCR) primers that will amplify 600-800 bp of sequence corresponding to the message of interest. Both primers shou ...
1. 对每个基因设计并检测两到四个siRNA序列为了找到潜在靶位点,扫描靶基因中的AA序列。记录每个AA 3’端19个核苷酸作为潜在siRNA靶位点。潜在靶位点需通过GENBANK数据库的BLAST分析,去除那些与其它基因明显同源的靶位点。如果可能,siRNA应根据mRNA低二级结构的区域设计。美国著名RNA产品公司Ambion提供网上在线设计工具,帮助您更快地完成这项工作。网址为:www.ambion.com/tec ...
MIRNA(microRNA)检测实验流程(加polyA法)一:概述microRNA(miRNA)是一类有大约22个核苷酸组成的非编码小分子RNA,其广泛存在于真核生物中。miRNA在个体发育的不同时期及不同组织中有不同的表达模式,都表明了其在发育和分化中起有重大的调控作用。迄今为此,对miRNA的检测方法主要有Northern Blot 等基于分子杂交的方法,这些方法敏感度低、耗时长、RNA的用量较大。miRNA qPCR D ...
miRNA是一类小分子RNARecent discoveries of small regulatory RNA molecules have been keeping the research community abuzz. Thus far, two classes of tiny regulatory RNA molecules have been identified.siRNAsThe first class encompasses the small interfering RNAs (siRNAs), which have an ...
RNAdraw是一个进行RNA二级结构计算的软件。1.RNAdraw 是windows下的多文档窗口(multiple documentinterface)软件,允许你同时打开多个数据处理窗口。主窗口的工具条提供一些基本功能:打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排窗口、以及即时帮助和退出程序。主窗口底部状态栏最左边的方框显示鼠标所在的菜单命令的提示信息,而右边三个方框提供了当前激活窗口内容的信息。2.RNAdr ...
1.Human embryonic stem cells express a unique set of microRNAs • ARTICLEDevelopmental Biology, Volume 270, Issue 2, 15 June 2004, Pages 488-498Mi-Ra Suh, Yoontae Lee, Jung Yeon Kim, Soo-Kyoung Kim, Sung-Hwan Moon, Ji Yeon Lee, Kwang-Yul Cha, Hyung Min Chung, Hyun Soo Yoon, Shin Yong Moon et al.SummaryPl ...