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【求助】请教!!!! Miscellaneous RNA是什么?

cameron 有什么功能吗?谢谢!!!freecell Miscellaneous RNA:是一类庞杂的小RNA分子。# Miscellaneous Small RNA: serves a variety of functions, including some enzyme-like catalysis; many are involved in processing RNA after it is formed; the remaining 2% of RNundefined Recent evidence suggests that some of these sm ...

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【求助】想要看某个microRNA在某个细胞系或组织中的表达水平高低,有没有这样的数据库呢

redsky 我想咨询一下XDJM,如果想要看某个microRNA在某个细胞系或组织中的表达水平高低,有没有这样的数据库呢?就是基于文献总结的数据库,或有什么其它方法可知道?iscience MicroRNA.org (http://www.microrna.org) is a comprehensive resource of microRNA target predictions and expression profiles.竹叶青秦 http://www.mirz. ...

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【求助】酵母双杂交的cDNA文库

会跳舞的蛋糕 请问用于酵母双杂交的cDNA文库有什么特别要求?自己构建好还是公司构建好?iscience 没有什么特别要求。可以给公司做。如果说你自己做好,还是公司做好,那么只能问你自己了。有些人的文库做得比公司的好。zhj008 建议找公司做,自己做浪费时间,关键质量不好,还不会少花钱,我们以前自己做的,发现比公司做的质量差远了,成本也不低。可以找上海海科生物问下,他们做酵母文库很专业,我们实验室在那做过好几个了,都能筛选到 ...

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【求助】如何用液氮研磨小球藻

paper1983_1983 哪位前辈能告诉我用液氮研磨小球藻,提取RNA的具体步骤?军人的炮 1.准备新鲜的小球藻,必须是新鲜的,否则RNA会降解;2.准备小的研钵,每次到一点液氮,快速研磨;3.每次不要等液氮完全没有,大约研磨3-5次;4.最后专用的RNA提取试剂盒按步骤提取就可以了。5.最重要是时间短,快,低温,不要污染。cffhappy 小球藻是单细胞的,不用研磨液可以吧?好好 cffhappy wrote:小球藻是单细胞的,不用研磨 ...

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【求助】急求!!MIFsiRNA的用量

iceman340 本人现在实验,需要要用到MIFsiRNA用来干扰小鼠,请问各位高手,有谁做过这方面的实验,这个MIFsiRNA的用量是多少啊??急求!!不胜感激iscience 你自己看看文献,不就知道了吗?再者说,你如果做这个试验,应该需要做不同梯度的siRNA吧?我告诉你,每只小鼠用0.01ng siRNA, 你相信吗?你就按照这个去做?iceman340 iscience wrote:你自己看看文献,不就知道了吗?再者说,你如果做这 ...

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【求助】前导连复制中5'端RNA引物切除后的空缺怎么补上?

girl19860627 在很多教材或资料中,写到端粒的功能是都说“能补偿滞后链5'末端在消除RNA引物后造成的空缺”,那么在前导连复制中5'端也需要RNA引物,它也会被切除,不也会留下空缺嘛,那这种情况怎么解决啊?版主freecell留言:提问的时候,要在标题说清楚问题。iscience 前导连复制中5'端RNA引物切除后,在原核生物中由DNA聚合酶I来补齐。dll20088002 书上说是由端粒酶参与解决的,该酶可提供R ...

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【求助】关于microRNA的一个小问题

jiangxiaozi76 Highly specific gene silencing by artificial microRNAs in Arabidopsis。p1123页中,Figure2.B图中,箭头上方的分数表示什么呢?:)zhujoker Because ARGONAUTE (AGO) proteins cleave targets invariably opposite of positions 10 and 11 of the small RNA (Kasschau et al., 2003), the 5’ ends of ...

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【求助】可以利用RNA干扰针对某一基因的启动子进行沉默吗?

haidi1214 请教:能否利用RNA干扰沉默某一基因(如P53)的启动子进行沉默?这一想法可行吗?急盼回复!非常感谢!freecell Why not?See review below.The gene-silencing process of RNA interference (RNAi) involves the manufacture of short, double-stranded RNA molecules by an enzyme called DICER, which cleaves RNA dupl ...

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【求助】miRNA 在同一个靶基因上有两个作用位点,应该怎么办

月亮欣 miRNA 在同一个靶基因上有两个作用位点,两个位点相距100bp左右,想请问各位战友,这种情况下,做靶位点的缺失和突变的话是不是两个地方都要做呀,如果只做一个的话,是不是说明不了问题,但是如果两个位点全部做突变的话,有可推荐的好方法没,谢谢freecell Refer to this paper:http://www.plosbiology.org/article/info:doi/10.1371/journal.pbio.0020 ...

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【求助】关于复制中的RNA引物

ouwenwang 问下:我知道罔崎片段上的引物是要切除的,那先导链复制时不是也需要RNA引物的么?复制完成后切除么?如果切除了岂不是新合成链的5端少了一小段?ouwenwang 为什么我看课本上画的示意图的意思好像是先导链复制完了根本就不短啊,只说随从链复制完成后5端要短一些,要用端粒酶补齐的?freecell 先导链的合成是从新链5'端连续聚合单核苷酸,模板的方向是3'到5'。哈佛大学网站有个动画,很形象。http://w ...

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【求助】急问,怎样才能使前体miRNA 主要表达 star miRNA (miRNundefined)

veer2 急问,怎样才能使前体miRNA 主要表达 star miRNA (miRNundefined)在下正在作star miRNA 的研究,想把前体miRNA 克隆到载体,然后表达成熟miRNA,但有一个问题,怎样才能使前体miRNA 主要产物为star miRNA (miRNundefined)呢,或者说怎样才能构建主要表达star miRNA (miRNundefined)的克隆呢,先谢谢了freecell My suggestion is using antisense inhibitor to block the domina ...

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【求助】请教关于转录因子归类

lantianshi 想找一些转录因子的归类方面的相关资料,比如各种转录因子的DNA结合区的特征,结合区的序列,不知道有没有什么数据库什么的?我在分子生物学上看过一点,但是数量比较少。我是因为找到一个基因启动序列上面的很多的转录因子的结合,我只能一个一个查找这些转录因子是什么吗?yaoliduli82 我也想请教这方面的问题lantianshi 顶一下,看是否有回答sunpingli :转录因子结合位点(Transcrip ...

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【讨论】植物中miRNA knockout or knockdown 的方法

kexuely 各位:我在园里里溜达了一下,基本没发现做植物miRNA的。我是做植物的,拟南芥和大豆。我查到的文献中从没见过植物中miRNA的knockout和knockdown,我想请各位讨论一下原因。先说说我的观点,因为对动物几乎很无知,说的可能不靠谱,敬请批评指正:首先说动物里miRNA的knockout和knockdown的方法,基因组水平的可能还是07年那个基因敲除的小鼠,用的是基因重组的原理,其他的像L ...

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【求助】慢病毒的RNAi载体能否同时带上两个标记基因?

mayingsheng 我想给慢病毒转染的RNAi带上抗药性筛选靶位和生物素酶的基因,有公司说不能同时带上两个标签,我的问题是:1、能否同时带上两个标记?2、那家公司可以做到:既设计RNAi及构建慢病毒载体,并带上以上两个标记?谢谢版主freecell留言:"那家“和”哪家“是不同的指代名词。ztxia 这里面主要有一个基因大小的问题,慢病毒载体一般要少于4KB,最好在2KB以下。同时带这两个标签可能超出的这个范围.版主f ...

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【求助】关于双报告基因

gingerdaming 做miRNA的报告基因,用的是miRNA mimics 和miRNA inhibitor转染.结果与对照相比,荧光强度miRNA mimics 对照〉miRNA inhibitor。本人第一次做双报告,望指教!jiachengyou2007   结果与想要的正好相反。  请问你的荧光强度相差多少?建议下次再提问时把问题说得清楚一点。别人更容易直接回答。  gingerdaming 不好意思,mimics的荧光强度约是对照的1.5倍,对照 ...

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【讨论】考考你的判断力:2篇关于microRNA的文章,是不是简单重复?

zhujoker 2篇文章,美国人做的。1.The Oncogenic microRNA-27a Targets Genes That Regulate Specificity Protein Transcription Factors and the G2-M Checkpoint in MDA-MB-231 Breast Cancer Cells。2.Oncogenic microRNA-27a is a target for anticancer agent methyl 2-cyano-3,11-dioxo-18b-o ...

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【求助】转录调控的问题请教

skmaple 本人最近正在做:一个蛋白A是否可以与一个基因B的启动子区域结合,并且上调B启动子的活性。现在的问题是A蛋白经验证是存在于细胞内(胞浆及胞核)的一种蛋白,那么我在研究A蛋白是否可以结合到B的启动子区域并且增强B启动子的活性的时候,是否需要外源性转染构建的携有A的真核表达载体?还是说选用一个天然不表达A蛋白的细胞,然后再外源性转染携有A的真核表达载体?还是说细胞本身就表达A蛋白,这个时候就不需要外源 ...

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【求助】有没有工具能够针对某一特定片段(3'UTR)预测与其作用的microRNA

allshine 各位目前有没有工具能够针对某一特定片段(3'UTR)预测与其作用的microRNA?因为我最近在做3'UTR上的一个突变,想确认这个点突变是否会引入一个新的microRNA作用靶点,而常用的预测软件好像都是针对一个大的基因或者microRNA来进行预测的,所以如果有战友以往有过类似的经验的话请指教。谢谢zhujoker 这个软件倒是真的没有见过,不过你可以把你的序列用RNA22这个软件和一些你认为 ...

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【求助】关于siRNA设计

caroline0701 我最近要设计几对化学合成的siRNA,在网上看了一些资料,想请问一下siRNA的结果该怎么分析啊?Max score, Total score, Query coverage, E value, Max ident 都是什么意思?谢谢大家的指导!预祝大家国庆节快乐中秋快乐freecell 不同的算法有不同的评价参数。不给出具体信息,难以判断。caroline0701 Target sequence 24: AATCTTTGGAAGAACTACCA ...

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【求助】查microRNA 前面的一段基因序列

sunji 我想知道microRNA 前的序列应该怎么查望高人指点zhujoker 就在版块上有一个“如何查找pre-miRNA上下游的序列?”既然上下游都可以,你为什么还要来一个上游怎么查?学习不要只到达目的,而在于你的学习过程。请见下面帖子,可能会对你有帮助的。http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=154&id=15429796&sty=1&tpg=1&age=0vitrogene 找个找到pre-mi ...

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