Embryo lysates Take 25 embryos and place into 1.7ml centrifuge tube. Rinse once in lysis buffer (add ~ 1ml) and remove by aspiration Add 500 µL lysis buffer per embryo and homogenize with either P1000 ...
Tissue collection storage microdissection sectioning: See separate protocol. Tissue handling: Note that all fresh tissue should be handled as BioSafety Level 2 materials (wear gloves lab coat etc.). ...
RNA Extraction from Frozen Tissue Sections ...
A novel approach for evaluating the efficiency of siRNAs on protein levels in cultured cells.Wu W Hodges E Redelius J Hoog C.Nucleic Acids Res. 2004 Jan 22;32(2):E17. Center for Genomics and Bioinform ...
聚丙酰胺凝胶电泳中性聚丙烯酰胺凝胶电泳安装电泳装置和配制凝胶溶液1. 必要时可用KOH/甲醇清洗玻璃板和间隔片。2. 用温热的去污剂溶液洗涤玻璃板和间隔片，再充分漂洗，先用自来水，再用去离子水。应拿取玻璃的边缘部分或带手套操作，以免手上的油脂残留在玻璃板的工作面上。用乙醇冲洗玻璃板，并将其置于一边晾干。3. （可做可不做）其中一块玻璃板的一面用硅化液处理（如Sigma ...
脉冲场凝胶电泳1）高分子量DNA琼脂糖凝胶块制备和加工1．收集10ml全血，加入30ml细胞裂解液。置冰浴中至少20min直至红细胞完全溶解。2．2000r/min离心10min，移去红色上清液，再次用细胞裂解液洗涤细胞，然后用PBS重悬细胞。3．稀释单细胞悬液并取一小份用Neubauer腔计数细胞。4．用PBS重悬细胞，以达到40μl PBS中含1百万个细胞比例（1百万个二倍体哺乳动物大约含有基 ...
RNAi实验原理与方法 近年来的研究表明，将与mRNA对应的正义RNA和反义RNA组成的双链RNA(dsRNA)导入细胞，可以使mRNA发生特异性的降解，导致其相应的基因沉默。这种转录后基因沉默机制(post-transcriptional gene silencing PTGS)被称为RNA干扰（RNAi）。一、RNAi的分子机制通过生化和遗传学研究表明，RNA干扰包括起始阶段和效应阶段(ini ...
第一向（等电点聚焦，IEF）1）凝胶条的准备1．以帽凝胶端（2个校准环：4mm和10mm）朝下，将4根玻璃管插入两个凝胶灌注装置的每个托架中，这样玻璃管恰好站在两个分隔室之一的“充填船”上。从玻璃管顶端到玻璃管底端拉入PP线（小心，线不易移动），否则以后将不能用它们将胶溶液拉上来。2．溶解分离胶溶液和过硫酸铵溶液。必须监控凝胶溶液的温度，因为高温下（大于25℃）聚合作用太快。3．分离胶溶液除气4分 ...
琼脂糖凝胶电泳1. 用封边带封住塑料托盘开放的两边或清洁干燥的玻璃板的边缘形成一个模具，置一个水平支架上。2. 配制足量的电泳缓冲液（1×TAE或0.5×TBE）用以灌满电泳槽和配制凝胶。 配胶和灌满电泳槽使用同一批缓冲液。3. 根据欲分离DNA片段大小用电泳缓冲液配制适宜浓度琼脂糖溶液：应准确称量琼脂糖干粉加到盛有定好量的电泳缓冲液的三角烧瓶或玻璃瓶中。缓冲液体积应 ...
用考马斯亮蓝R－250染色1．凝胶的固定液中轻微摇荡至少1小时。2．凝胶在染色液中摇荡过夜或至少1小时。3．胶在脱色液中摇荡过夜或至少1小时以消除背景。4．凝胶放于保存液中至少4小时以进一步脱色。在最初的1小时内换两次溶液，以后每一小时换一次溶液。5．封好的胶置于保存液中，4℃下最少可保存5年。 ...
1．将固定液中的凝胶摇动过夜或至少1小时。2．将保温液中的凝胶轻微振荡2小时。3．去离子水清洗凝胶3次，每次20分钟。4．将硝酸银溶液中凝胶轻微振荡30分钟。5．用去离子水快速洗胶30秒。6．将定影液中凝胶摇动5～30分钟，时间由所加的蛋白质量决定。7．如果已经达到所需的颜色深度，将凝胶放到定影液中最少15分钟。8．换定影液。在暗处，4℃定影液中凝胶可保存几个月。 ...
1．IEF之后，用去离子水充分地清洗管子。2．加热500ml 0.6％ Deconex溶液至60～80℃。3．将玻璃管子浸入Deconex溶液，70℃下放置3次10分钟：每10分钟之后，分别用镊子移走玻璃管，倒出清洗液，加入新的清洗液，再于70℃下清洗10分钟。4．用去离子水浸洗管子。5．加热500ml 0.1mol/L盐酸至95℃。6．将管子放到一个玻璃烧杯中，加0.1mol/L盐酸，直到将烧杯 ...
随机引物法：利用寡核苷酸延伸法进行纯化DNA片段的放射性标记 1. 在一个0.5ml的微量离心管中加入溶于30μl水的模板DNA(25ng)及1μl随机脱氧核苷酸引物（约125ng）。盖紧微量离心管，置于沸水浴中2min。2. 将微量离心管移至冰上放置1min，4℃下离心10s使引物与模板的混合物沉降至管底，将微量离心管重新置于冰上。3. 在引物与模板的混合物中 ...
相互作用在生理上的证实和探索l 通过免疫共沉淀确定结合蛋白1．用磷酸盐缓冲液洗30块10 cm培养板上的适宜细胞。刮去每块板上的细胞到1 ml冰冷的EBC裂解缓冲液中。2．将每毫升细胞悬液转移到微量离心管中，在微量离心机上4℃以最大速度离心15 min。3．收集上清（约30 ml）并加入30μg的适当抗体，4℃摇动免疫沉淀物1 h。4．加入0.9 ml的蛋白质A-Sepharose 悬液 ...
快速分析过去已确定的相互作用l 利用BIAcore通过表面胞质基因共振光谱学分析相互作用的蛋白质RAMc通过伯氨基与CM-5传感芯片表面的结合1．将CM-5传感芯片模块嵌入BIAcore仪器。2．全部采用过滤并除气的HEPES缓冲盐溶液。3．将分别含有NHS、EDC、乙醇胺和RAM Fc以及20 mmol/L HCl各100μl的小管置于BIAcore自动进样器架的适当位置。4．将一个空 ...
叶绿体RNA的体外加工与紫外交联分析RNARNA的合成l DNA模板的线性化1．根据供应商的指导用合适的限制酶酶解含有DNA模板（如亚克隆在转录载体如pBluescript®（Stratagene）上的菠菜叶绿体psbA基因）的质粒（Schuster and Gruissem1991）。2．用DNA琼脂凝胶（Sambrook et al. 1989）分析线性化质粒以检查酶解是否完全。3． ...
荧光原位杂交的染色体分析（一）标本的制备1．室温下，依次用70％、90％和100％的乙醇脱水5min。2．空气干燥载玻片。3．若短期使用，载玻片可在室温贮存数天。若载玻片要长期保存，应在室温下过夜使组织“老化”（aged），然后放入容器中，该容器密封于含干燥剂的塑料袋内，－70℃保存。根据作者的经验，在6个月内使用的载玻片可贮存在－20℃。在杂交实验之前解冻这些载玻片，不提倡反复冻融载玻片。（二 ...
叶绿体mRNA3’末端的体外加工l RNA加工反应1．在1.5ml微量离心管中加入下列反应液：缓冲液IVT（20×） 0.5μl叶绿体蛋白提取物（20μg） Lμl缓冲液E
番茄子叶细胞核的分离提取为例子进行实验步骤2～7须在4℃下使用高压灭菌过的设备进行。1．将番茄种子种在灭菌的水饱和滤纸上，置于小盆内，用薄膜封口后，培养7天。用刀片切下番茄子叶后收集备用。2．将40～50g新鲜组织放入300ml匀浆缓冲液，用韦林氏搅切器先1×4秒而后6×1秒。3．过滤匀浆混合液，使其透过漏斗上的4层厚纱布及纱布下按孔径递减次序放置的3层Nitex尼龙筛网（300μm，100μm， ...
放射性标记DNA探针的制备l 聚丙烯酰胺凝胶的制备1．按照（三）中操作流程灌制非变性聚丙烯酰胺凝胶。将10×TBE稀释成0.5×的工作浓度。聚丙烯酰胺的工作浓度取决于待测DNA片段的大小，200bp左右的片段需要4～5％的凝胶，小于100bp的片段应灌制6～8％的凝胶。l DNA的标记1．用两种限制性内切酶从10μg质粒上将待测DNA片段切下。注意务必使至少一种酶酶切后产生5 ...
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