① 华中科技大学最新研究:免疫机制参与心肌梗死后缺血性心力衰竭华中科技大学同济医学院附属协和医院心血管内科程翔教授研究团队发现了缺血性心力衰竭患者心脏局部 T 淋巴细胞免疫组库特征及免疫功能表型,在缺血性心力衰竭的免疫发病机制领域取得重要进展。这一研究团队发现在梗死后心力衰竭患者的心脏局部存在显著的 T 细胞应答;心脏局部的 T 细胞具有克隆扩增和组织特异性的表型,分泌促纤维化及促凋亡因子参与不良心室重构,且能再次进入外周循环;C ...
今天小编为你介绍常用的生信分析工具,这对你撰写研究方案和SCI文章写作很有帮助哦!1. solQTL (了解分析茄科、菊科的表型和基因型)http://solgenomics.net/qtl/ solQTL是番茄基因组测序计划的基因组信息资源门户网站数据库SGN (http://solgenomics.net) 的子模块。在solQTL上可看到全基因组QTL图谱的很多参数资料: 同时,还能清楚看到染色体每个位点: 目前的植物数据库Gramene ( ...
今天给大家安利一个好用的数据库:CircInteractome(Cirular RNA interactome)可以说功能很强大了,下面我们来看看它有哪些功能吧。一、搜索 circRNA 的名字、序列、在基因组上的位置及结合的蛋白首先是 circRNA 的搜索:我们可以根据 circRNA 或者基因名进行搜索,比如以基因 Cul2 为例,在 Gene Symbol 后面的对话框中输入 Cul2,然后单击 circRNA Search:在新页面中就出现了这个基因来源的各个 ci ...
circRNA的数据库还是很多的,以下几个可供参考:1.circBase收集包括以下6个物种的circRNA信息:人 (hg19)、小鼠(mm9) 、秀丽线虫(ce6)、黑腹果蝇 (dm3)、矛尾鱼(latCha1)、腔棘鱼 (latCha1)。该数据库是目前相对收录信息比较全和完整的,数据也能下载,非常实用。2. Circ2Traits是一个收集与人类疾病或性状潜在关联的circRNA数据库。3. circNet,利用464个RNA-seq测序 ...
① 傅嫈惠院士发现 ADRB1 基因能缩短人的睡眠时间!美国科学院院士傅嫈惠,和加州大学旧金山分校神经学家 Louis Ptáček 研究分析了几个家族,他们的睡眠时间只需要 6 个小时,而针对这个家族,研究人员发现了一个名为 ADRB1 的基因,在遗传连锁研究和全外显子组测序研究中,他们发现了这种新颖且非常罕见的突变。研究发现,这个基因编码ß1 -肾上腺素能受体,而这个蛋白的突变体版本稳定性较差,改变了受体的功能。这表明它可能在大脑中产生功能性后果。 ...
CRISPR 基因编辑技术自问世以来,就有着其他基因编辑技术无可比拟的优势,其应用在医学科研领域后,也不断的取得喜人的成果,进而迅速风靡于世界各地的实验室。那么 CRISPR 技术如此受到科研界的青睐,到底有什么过人之处呢?本文则揭开 CRISPR 神秘的面纱,让你快速掌握该基因编辑热门技术的精髓所在。CRISPR 原理及基本结构CRISPR/Cas 系统作为原核生物的免疫系统,可识别外源性遗传物质 DNA,并将其切断,沉默外源基因的表达。在 ...
大多做科研的童鞋们大概都会遇到一个头疼的问题:怎么找文献?如何保证找到的文献都是相关领域的经典文献?本文教你如何根据 H5 指数查找相关领域的高精尖经典文献。首先来了解一下什么是 H 指数、H5 和 H5 中位数?H 指数(H-index):于 2005 年由美国加州大学学圣迭哥分校物理学家 Hirsch 教授提出,用于评价个人学术影响。Hirsch 将该指数定义为:若某位科学家的 Np 篇论文中有 h 篇论文每一篇的引量都至少为 h 次,且其他(Np-h)篇论文中每篇的引量都
① 中国科大 PNAS 揭示 NK 细胞终末成熟调控新机制天然杀伤细胞(Natural killer cells, NK cells)是免疫系统的重要组成部分,在机体抗病毒和抗肿瘤中发挥重要作用。IL- 15 是调控 NK 细胞发育成熟、存活增殖及效应功能的关键分子,目前对 IL- 15 信号通路的负相调控及其对 NK 细胞成熟与功能的影响研究尚少。中国科学技术大学生命科学与医学部等处的研究人员发现 IL- 17A 通过上调 SOCS3 抑制 IL- 15 信号以阻碍 NK 细胞发育成熟,一方面提示 IL- 17 对于 NK 细胞的过度活化 ...
经典的 CRISPR/Cas9 系统具有较多优点,却存在很高的脱靶风险——不仅切割其靶向目标位点,在具有相似序列的位置也可能会发生切割 。下面给大家介绍一下 CRISPR 脱靶的检测方法。目前有很多可以设计 gRNA 并预测脱靶位点的网站,除了常用的 elevation 和 CRISPOR 外,还有 synergizing CRISPR 以及 deep CRISPR 等模型。但是如何从计算机的模拟预测中挑出一个完美 gRNA 呢?目前是 gRNA 切割后,测序检测其脱靶位点。但是还有预测工具 ...
① 禁食可以减少炎症,且不会降低免疫力!Cell 最新文章又一力证我们知道热量限制会改善炎症和自身免疫性疾病,但对于减少热量摄入,控制炎症的机制却知之甚少。西奈山研究人员利用人体和小鼠免疫细胞进行研究,结果发现间歇性禁食可减少血液循环中称为「单核细胞」的促炎细胞的释放。进一步的研究表明,在禁食期间,这些细胞会进入「睡眠模式」,而且比未禁食的人体内发现的单核细胞更少。这项新研究指出,短期和间歇性禁食可以减少慢性炎症,改善慢 ...
① Science 子刊:联合激活 GHSR1α和 DRD1 有望治疗阿尔茨海默病海马体突触病变是阿尔茨海默病(AD)中最早的变化之一,也是定义阿尔茨海默病的一种病理学特征。目前针对阿尔茨海默病的治疗努力并不能有效地校正海马体突触缺陷。生长激素促分泌素受体 1α(GHSR1α)对海马体突触生理学至关重要。在一项新的研究中,来自中国山东第一医科大学和美国德克萨斯大学达拉斯分校的研究人员报道β-淀粉样蛋白(Aβ)直接结合 GHSR1α,抑制 GH ...
今天推荐的 2 款写作工具,不仅可以帮你检查文章错误,还能免费查重~PaperRater网址:https://www.paperrater.com/一个使用非常方便快捷的在线网站,无需注册直接免费使用。主要功能包括 Grammar Check(语法检查)、Writing Suggestions(写作建议)、Plagiarism Checking(抄袭检查)1、Grammar Check 和 Writing Suggestions通过强大的语法检查,可以帮你找 ...
当文献越来越多,如何管理文献就成了一个大问题。目前大家在用的文献管理软件至少有几十种,其中主流的有:Endnote、Mendeley、Zotero 等。今天我们就来盘点分析,对比那些常见主流文献管理软件的优缺点,帮助大家在众多文献管理软件中,挑选出最适合自己的文献管理软件~1.EndNote官网:https://endnote.com/product-details/ Endnote 是 SCI(Thomson Scientific 公司)的 ...
① 北大汤富酬教授等人最新 Nature:利用单细胞转录组和 DNA 甲基化组图谱重构人类胚胎着床过程北京大学生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)、生物医学前沿创新中心(BIOPIC)汤富酬课题组携手北京大学第三医院乔杰课题组合作,结合体外模拟人类着床策略 1 和高精度单细胞多组学测序技术 2,3(single-cell RNA-seq, single-cell Trio-seq2),首次利用单细胞转录组和 DNA 甲基化组图谱重构了人类胚胎 ...
做科研最大的悲哀莫过于自己准备投稿了,别的课题组同样的内容已经在线了,这种事情在现实中经常出现,越是前沿的内容越是这样,个别的大牛或许可以将这样的结果扭转成背靠背发表,但毕竟还是少数。国自然申请对国内每一个课题组应该都不是小事,所以自然拿自己最有把握并且已经获得较多研究基础的内容用来申请基金,所有通过查询国自然相关内容就可以知道一些实验室在做哪些研究,也就是说通过查询自己课题的关键词,就能查到一部分相关结果 ...
尚在读研究生的弟弟妹妹们,尤其是在为博士学位仍苦苦挣扎的各位英雄们,一定对 SCI 这个词非常敏感,说又爱又恨估计一点也不过分吧。本人 2008 年农学博士毕业,后到一个事业单位就职,前前后后写了也有一二十篇 SCI 论文吧,在此把我之前写 SCI 论文的经验和大家分享分享,分享过程的同时也是我整理思路的一个过程,一举两得。首先把所有结果的图表做好我记得我在写第一篇 SCI 论文的时候,是相当的痛苦。总觉得自己英语不行,好几天坐在电脑前生憋,就是下不 ...
SCI 论文中,试验介绍以及数据分析是整个论文的核心部分,尤其是试验部分,为了让读者能够有条件重复你的试验结果,作者必须非常详细地阐述试验过程中的所有细节。因为你描述的试验是已经完成的,所以通常用过去时描述之前的工作。如何描述试验过程呢?对于论文而言,有很多语言是通用的,你要做的是像填空一样把你的试验内容填进去就好了。现在,我就给大家介绍 99 个描述试验过程的短语及句式,建议大家收藏一下,在写论文的时候拿出来直接用就好了 ...
① Cell:中性进化决定寿命和衰老自然界的物种在寿命上有很大的不同,从几小时就成年的蜉蝣到几百年的鲸鱼。自然选择应该倾向于长寿,因为原则上长寿会导致更多的后代和更高繁殖机会繁殖,把遗传基因给下一代。但是为什么短命的物种会进化呢?为了回答这个问题,来自马克斯·普朗克衰老生物学研究所 Dario Valenzano 小组的 Rongfeng Cui 调查了非洲 鳉鱼家族。科隆马克斯·普朗克衰老生物学研究所的科学家们研究了自然界中不同的寿命是 ...
科研要挖掘的,就是基因间的相互关系。但大多时候,你们要知道两个基因间,甚至两个信号通路间的关联,也都没什么特别好的办法。只能查查 KEGG……但 KEGG 吧,看着跟电路图一样,我们又不是学无线电专业的,这乱七八糟的。今天夏老师给你们讲的这个神奇工具——Sign ,就是用来分析信号通路间联系的:
不少研究中药或者小分子药物的同学想从研究的分子出发预测靶蛋白和相关的功能(比如信号通路),今天我们就来介绍三个工具。1. BATMAN-TCM(http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/)这个网站我们以前介绍过,这里再简单说一下使用方法:以三七为例,第一部分输入三七的拼音:san qi,第二步是确定参数:最后单击 Start 就可以了:等一下以后就出来结果了:2. STITCH(http://stitch.embl.de ...

