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        时空转录组 FFPE 样本收样标准

        相关实验:微量样本核酸

        最新修订时间:

        材料与仪器

        石蜡包埋样本、FFPE 自行切片样本

        步骤

        物种来源

        适用于常见动物物种,主要适用于人类病理样本,另外包括但不限于鼠、猴、猪等样本。

        样品要求及运输条件

        样本要求:

        蜡块制作可参考各医院病理科制作蜡块的流程,要求脱水充分、浸蜡充分,切片可连续成片、无裂痕和空腔(组织本身自带除外),样本切片过程中不会与外部包埋的蜡分离;组织尺寸不应超过 0.9 cm×0.9 cm×2 cm(芯片大小为 1 cm×1 cm 时),组织切片/芯片面积不应超过 80%;RNA 质检要求:DV200≥30%。

        石蜡包埋样本

        石蜡块直接邮寄至百奥智汇。

        1) 石蜡块需要固定在石蜡组织包埋盒上(包埋盒规格要求:外圈,长 4 cm,宽 2.8 cm,高 0.6 cm,盒盖高 0.1 cm);

        2) 蜡块放入密封袋中密封,根据寄送距离和时间,选择大小合适的泡沫盒,其厚度不低于 3 cm,且封口严实,保证泡沫盒密闭;

        3) 寄送使用冰袋寄送,若寄送时间>24 h,应不少于 6 块冰袋(13 cm×23 cm);

        4) 样本做好防撞措施,建议使用泡沫、发泡纸等多层包裹以避免运送过程中碰撞影响样本;

        5) 夏季因外界温度较高,可适当增加冰袋数量,确保样本运输过程中温度仍处于 2-8℃。

        FFPE 自行切片样本

        对于不便于直接邮寄石蜡块的客户,可提前自行进行切片。具体要求如下:

        1) 切片:按照组织切片要求,选取的蜡片需平展,能顺利展片,无需修片;

        注意:不能褶皱过多、破碎,可在蜡片运输前展片测试,如不能成功展片,不建议寄送此蜡片。

        时空转录组 FFPE 样本收样标准

        图 1. 蜡片平展图

        2) 装样:使用小毛刷或镊子将单张蜡片送进全新的 50 mL 离心管中并盖紧罐盖;

        时空转录组 FFPE 样本收样标准

        图 2. 单张蜡片送进离心管图

        3) 密封保存:在 50 mL 离心管外标签处写上样本名称和日期,装入自封袋并放入干燥剂密封保存。预防发生损耗,经过质检的同一样本可一次运输 3-5 张蜡片。

        :若样本还未质检需要百奥智汇进行质检,质检蜡片需另外切片 4-5 片×5μm(根据组织实际大小调整),置于 1.5 mL 离心管内密封,一起寄送。

        时空转录组 FFPE 样本收样标准

        图 3. 离心管外写样本名称和日期图

        运输条件:

        1) 根据寄送距离和时间,选择大小合适的泡沫盒,其厚度不低于 3 cm,且封口严实,保证泡沫盒密闭;

        2) 寄送使用冰袋寄送,若寄送时间>24 h,应不少于 6 块冰袋(13 cm×23 cm);

        3) 样本做好防撞措施,建议使用泡沫、发泡纸等多层包裹以避免运送过程中碰撞影响样本;

        4) 夏季因外界温度较高,可适当增加冰袋数量,确保样本运输过程中温度仍处于 2-8℃。

        :运输后,可直接将自封袋在 4℃ 密封干燥保存 1 周,再进行后续流程。

        来源:丁香实验

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