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- 提供商：
伯豪生物
- 服务名称：
伯豪生物FFPE 样本空间转录组测序科研服务
- 规格：
以电话报价为准
技术介绍 伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案
空间转录组技术不仅可以提供研究对象的转录组等数据信息，同时还能定位其在组织中的空间位置，对癌症发病机制、神经科学、发育生物学等众多领域的研究来说都具有重要意义。目前该技术主要适用于新鲜冷冻组织样本，临床通常使用的 FFPE（福尔马林固定石蜡包埋）样本资源无法得到更加高效的应用。目前针对 FFPE 样本的空间基因表达解决方案，可以从 FFPE 样本中以高灵敏度和高特异性分析相关基因的空间表达信息。
技术优势 伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案
1、打破对新鲜冰冻样本的局限性，使临床上大量的 FFPE 样本得到充分利用；
2、RNA 模板连接（RTL) 探针集，具有高敏感性和特异性，且探针集覆盖了人和小鼠超过 18000 个基因；
3、可以结合更广泛的病理信息和预后信息，筛选生物标记物、进行回顾性和纵向研究，揭示更广泛更深入的生物学问题。
Visium FFPE 实验流程 伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案
样本要求 伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案
1、满足组织贴片实验（不脱片）；
2、RNA 完整性：DV200>50%。
数据分析 伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案
通过生物信息分析直观地展示 spot 分群和 spot 亚群在组织切片上的空间分布以及差异基因的空间分布。此外，还提供高级分析、个性化分析等丰富的分析内容，包括单细胞数据与空转数据的联合分析等。
参考文献 伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案
文章名称：Tertiary lymphoid structures generate and propagate anti-tumor antibody-producing plasma cells in renal cell cancer
发表时间：2022 年 3 月
发表期刊：Immunity
影响因子：31.428
发表单位：法国索邦大学 Cordeliers 研究院
伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案
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文献和实验1、Single-cell and spatial analysis reveal interaction of FAP+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in colorectal cancer
2、Clinical challenges of tissue preparation for spatial transcriptome
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