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FFPE 样本 | 空间转录组测序

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  • ￥29999
  • 伯豪生物FFPE 样本空间转录组测序科研服务
  • 中国
  • 2026年04月21日
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    可以从 FFPE 样本中以高灵敏度和高特异性分析相关基因的空间表达信息。

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    • 提供商：

      伯豪生物

    • 服务名称：

      伯豪生物FFPE 样本空间转录组测序科研服务

    • 规格：

      以电话报价为准

    石蜡包埋小鼠肾脏


    技术介绍   伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案

    空间转录组技术不仅可以提供研究对象的转录组等数据信息，同时还能定位其在组织中的空间位置，对癌症发病机制、神经科学、发育生物学等众多领域的研究来说都具有重要意义。目前该技术主要适用于新鲜冷冻组织样本，临床通常使用的 FFPE（福尔马林固定石蜡包埋）样本资源无法得到更加高效的应用。目前针对 FFPE 样本的空间基因表达解决方案，可以从 FFPE 样本中以高灵敏度和高特异性分析相关基因的空间表达信息。


    技术优势   伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案

    1、打破对新鲜冰冻样本的局限性，使临床上大量的 FFPE 样本得到充分利用；
    2、RNA 模板连接（RTL) 探针集，具有高敏感性和特异性，且探针集覆盖了人和小鼠超过 18000 个基因；
    3、可以结合更广泛的病理信息和预后信息，筛选生物标记物、进行回顾性和纵向研究，揭示更广泛更深入的生物学问题。

    Visium FFPE 实验流程    伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案

    FFPE样本空间转录组测序服务流程图


    样本要求   伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案

    1、满足组织贴片实验（不脱片）；
    2、RNA 完整性：DV200>50%。


    数据分析    伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案

    通过生物信息分析直观地展示 spot 分群和 spot 亚群在组织切片上的空间分布以及差异基因的空间分布。此外，还提供高级分析、个性化分析等丰富的分析内容，包括单细胞数据与空转数据的联合分析等。

    FFPE样本空间转录组测序分析结果图
    图 基于 spot 的 cluster 分类（t-sne 图）和 cluster 在切片上的分布
     
    FFPE空间转录组测序 切片透化分析结果图
    图 海马 marker HCPA 基因在切片上的表达分布（红色区域表达量高）

     

    FFPE空间转录组测序分析软件操作
    图 根据病理信息选择特定区域进行分析（或者多个区域进行比较分析）
     
    FFPE样本空间转录组测序分析结果图
    图 不同细胞类群映射到切片上的结果


    参考文献    伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案

    文章名称：Tertiary lymphoid structures generate and propagate anti-tumor antibody-producing plasma cells in renal cell cancer
    发表时间：2022 年 3 月
    发表期刊：Immunity
    影响因子：31.428
    发表单位：法国索邦大学 Cordeliers 研究院


    伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案

     

     

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