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        α-标记核苷酸进行热循环测序反应

        相关实验:双脱氧法 DNA 测序实验

        最新修订时间:

        材料与仪器

        实验材料
        试剂、试剂盒
        仪器、耗材

        步骤

        1.  对应于毎个待测模板,分别以A、G、C、T 标记好4个微量离心管。

        2.  分别往标好A、G、C、T 的管子中,加A、G、C、T 测序混合液各3 μl。
         
        3.  对于单链模板:在0.5 ml 微量离心管中混匀下列试剂

        (1)0.04 pmol 单链DNA模板

        (2)0.6 pmol 引物

        (3)1.5 μl 10×VentR(exo-)测序缓冲液

        (4)1 μl 3%Triton X-100

        (5)加水至12 μl

        (6)用吸管上下抽吸轻轻混匀溶液。

        4.  对于双链DNA模板: 在0.5 ml 微量离心管中混匀下列试剂

        (1)0.1 pmol 双链DNA模板

        (2)1.2 pmol 引物

        (3)1.5 μl 10×VentR(exo-)测序缓冲液

        (4)1 μl 3%Triton X-100

        (5)加水至12 μl

        (6)通过用吸管上下抽吸,使溶液混匀。

        5.  毎个模板/引物混合物加1~2 μl 10 mCi/ml[α-35S]dNATP、[α-32P]dNATP或[α-32P]dNATP,用吸管轻轻上下抽吸混合溶液。

        6.  经步骤5操作后的管子,加入1 μl 2 000 U/ml 的VentR(exo-)DNA聚合酶。
         
        7.  立即往步骤2的含VentR(exo-)测序混合物A的管子中加入3.2 μl 步骤5操作后所得的混合物。

        8.  分别重复此过程于C、G、T管,每次均换吸头,反应混合物,置于冰上。

        9.  往每个反应混合物上滴入1滴无菌矿物油。

        10.  在热循环反应装置中设定如下反应条件:20循环:20 s,90℃;20 s,55℃;20 s,72℃反应管放入热循环仪中,启动程序。

        11.  在矿物油层下加入4 μl TCS终止/加样染料。
         
        12.  样品在85℃温育3 min。

        13.  将吸管头插入覆盖矿物油层下面的反应物中,取2 μl 加样于测序胶进行电泳,并读出序列。

        来源:丁香实验

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