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        RNA 测序

        实验分类:

        PCR 技术

        最新修订时间:

        丁香实验推荐阅读

        合作专家 | 黄婕硕士

        生物学 中国科学技术大学

        丁香实验推荐阅读

        审核专家 | 王淼博士

        病原微生物 中国农业科学院

        简介

        提取样本单细胞核后,分离并标记细胞核,在单细胞水平检测核基因表达情况的技术。

        原理

        从冻存的组织中用表面活性剂与 Dounce 匀浆提取出所有细胞的细胞核,再通过组织特异性 marker 进行流式或磁珠分选选出待研究的单细胞核,然后通过二代测序系统对每个细胞核内的 RNA 进行测序,并进行后续分析。

        应用

        为一些复杂或珍稀冻存样品(如脑、心脏、肾脏等)提供单细胞水平研究应用平台。

        来源:李昊桐. 心脏细胞与心脏细胞核转录组差异的比较研究 [D]. 北京协和医学院,2022.

        操作方法

        🔥 单核 RNA 测序(snRNA-seq)

        提取样本单细胞核后,分离并标记细胞核,在单细胞水平检测核基因表达情况的技术。

        🔥 乙酰化 RNA 的测序

        RNA 乙酰化是指在 RNA ac4C 修饰酶作用下,RNA 的 N4 位乙酰胞嘧啶发生乙酰化。ac4C RNA 乙酰化修饰是一类新型 RNA 修饰,利用 RNA 乙酰化测序可检测 RNA 的乙酰化程度和表达水平,从而探究 RNA 乙酰化修饰的生物学意义及其在疾病中的功能。

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