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外泌体非编码RNA测序

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      北京诺禾致源科技股份有限公司

    • 服务名称

      外泌体非编码RNA测序

    挖掘细胞间通讯信息交流分子

    外泌体非编码RNA测序:

    富集血清、血浆、细胞上清等体液中或者组织培养的外泌体,通过非编码RNA测序筛选差异信号分子,研究潜在biomarker, 预测分子潜在功能,挖掘通路分子间相互作用模式,揭示生命活动胞间信号通讯机制,探索复杂生命活动形态。

    多种富集方式:

    提供试剂盒(PEG沉淀法)、超速离心、SEC(凝胶排阻色谱法)和密度梯度离心法,针对不同样本来源、不同分离需求和不同研究目的的外囊泡进行针对性的富集。

    全套鉴定方法:

    电镜鉴定用于鉴定外泌体囊泡结构,粒径检测用于测量外泌体浓度与直径大小;western-blot/纳米流式用于检测表面标志性蛋白以确定富集样本为外泌体。

     

    应用方向

    肿瘤发生、生长、侵袭与转移
    免疫应答、细胞凋亡、血管生成、炎症反应
    细胞间信号传递与交流媒介
    靶向药物载体
     

    诺禾优势

    1. 富集鉴定手段多样

    2. 质控严格,分析流程全面

    诺禾致源外泌体lncRNA低起始量去核糖体微量建库深度挖掘未知分子;YRNA、tRNA等多类型外泌体smallRNA注释从多角度解析功能机制;疾病、癌症注释等个性化分析升华研究新高度, 打造不同分子间的互作关系网...
    从材料选取,样本富集提取、建库测序,到数据分析,每一步都经过科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

    3. 项目文章以及物种经验丰富

    诺禾致源已经成功完成对血清、血浆、细胞上清、脑脊液、尿液、牛奶、乳汁、精浆、卵泡液、癌组织、富集好的外泌体等多种类型的外泌体非编码RNA测序项目,涉及物种包括人、大小鼠 、牛、鸡、生姜等多个物种,助力客户在Theranostics、JEV等权威杂志发表多篇高水平文章。
    “科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。产品细节图片1

    信息分析

    诺禾致源外泌体非编码RNA测序,针对外泌体中的smallRNA、lncRNA、circRNA以及mRNA进行分析,挖掘调控网络。此外,诺禾致源提供个性化分析的服务,可以根据客户需求定制分析内容。
    标准分析高级分析与绘图
    lncRNA
    smallRNA
    circRNA
    全转录组关联分析
    ceRNA 分析
    WGCNA
    转录因子分析
    GSEA 分析
    STEM 分析
    iPath 分析
    免疫相关因子分析
    个性化 circos 图绘制
    高级热图绘制
    富集圈图
     其他分析小工具可参考云平台 NovoMagic

     

    关联分析

    通过外泌体RNA测序与蛋白组学进行关联分析,可以挖掘潜在的新型编码蛋白,或在表达量层面将基因与蛋白相关联,剖析作用机制或功能特征。详见转录调控与蛋白多组学。
     

    产品细节图片2

     

    送样建议

    样本类型送样建议
    血清/血浆≥4 ml
    细胞上清≥30 ml
    脑脊液≥10ml

     

    常见问题

    1.外泌体鉴定粒径浓度够,但是WB检测无条带的原因是什么?

    因为外泌体存在免疫分型,可能是某样本中表达本来就低,导致检测不到,就是WB有些指标是检测不到的;不是某一个项目的问题,而是由于外泌体本身的特性。没有什么普适的, 尤其是细胞上清没有规律,血浆率低的话,可能WB极限就检测不到了。一般推荐2-3个阳性,1个阴性。阳性率低的原因是跟样本本身有关。

    2. 送血浆(plasma)还是血清 (serum)?

    推荐使用血浆,因为血清收集后在凝血过程中,血小板受到刺激会产生许多外泌体和其他形式的小泡,因此血清中获得的小泡始终比血浆中多,甚至超过50%的小泡来源于血小板。所以血浆是研究病理生理状态下外泌体更好的介质。多数的criculating Exosome研究样本使用的是血浆。
    诺禾致源拥有专业的设计方案、严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务,确保每一个环节都能出色完成,助力您的科学研究。

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    图标文献和实验
    该产品被引用文献

    [1]. Zheng, Mengyue et al. “Exosomal let-7d-3p and miR-30d-5p as diagnostic biomarkers for non-invasive screening of cervical cancer and its precursors.” Molecular cancer vol. 18,1 76. 2 Apr. 2019, doi:10.1186/s12943-019-0999-x

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      非编码RNA(Non-coding RNA)是指不编码蛋白质的RNA,包括miRNA、lncRNA、circRNA、piRNA等。非编码RNA发挥功能的方式很多,可以与蛋白、DNA和RNA相互作用,参与多种细胞活动,主要包括基因的激活和沉默,RNA的剪接、修饰和编辑,蛋白质的翻译等。 1. miRNA:miRNA是一类由内源基因编码的长度约为22个核苷酸的非编码单链RNA分子,它们在动植物中参与转录后基因表达调控。每个miRNA可以有多个靶基因,而几个miRNA也可以调节同一个基因。 图

    • RNA测序简介

      NGS已成为生命科学领域中基因组学和转录组学研究的金标准。虽然它与桑格测序等方法有某些核心相似之处,但NGS所能实现的绝对的高通量水平使它与其他方法截然不同,并彻底改变了科学家的工作方式。 RNA测序(RNA-seq)尤其处于NGS功能应用的前言沿。RNA-seq最简单的形式允许我们在取样时确定样本中的RNAs的丰度。转录组是一个高度动态的细胞特征,并打开了一个巨大发掘潜力的世界。对药物、各种疾病状态、转录后修饰和选择性剪接转录本的反应变化只是 RNA-Seq 使其能够发现的一些例子

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