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锐博生物
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CLIP测序
在真核生物中,RNA结合蛋白(RNA Binding Protein,RBP)种类繁多,在RNA剪切、转运、序列编辑、胞内定位及翻译控制等多个转录后调控过程中起着重要作用,因此了解RBP蛋白的功能对解开人类疾病有着重大意义。
CLIP-Seq,即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(Cross-Linking and Immunoprecipitation High Throughput Sequencing),是一项在全基因组水平揭示RNA与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。
近年来,该技术广泛应用于miRNA靶标鉴定等研究方向。在动物体内,成熟的单链miRNA与一系列蛋白形成miRNA诱导的沉默复合物(RISC),结合于靶mRNA的3’UTR区,阻止所结合的mRNA的翻译或直接降解靶mRNA。通过CLIP-Seq技术在全基因组范围内鉴定RISC中AGO2蛋白与RNA的结合位点,能够明显地降低miRNA结合位点预测的假阳性,并缩小miRNA结合位点搜寻空间的范围。
服务优势
● 准确性高:从活细胞交联开始,真实反应体内环境下分子间相互作用
● 特异性强:紫外辐射不会造成蛋白和蛋白之间的交联,特异性鉴定蛋白和RNA之间的相互作用
● 应用广泛:特别适用于剪接因子RNA结合图谱、miRNA作用靶点等研究
项目流程

生物信息学分析项目

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文献和实验为明确植物群落的生产结构,由门司正三等(1953)新提出的方法。首先在大致一样的群落内部测量对生产最有关系的深层照度的垂直分布,然后在地上画出一定的面积(例如50×50平方厘米),在此规定的面积上,将其中所包含的全部植物刈分为一定厚度的层(按照群落的高度而分5厘米、10厘米、20厘米等),按照需要还有各种区分,即区别为同化组织的叶和其他非同化组织,测量各自的生产量。得到的数值一般可用下图表示。即:纵轴为高度,中轴的左侧是同化部分的量,右侧为非同化部分的量,是取区画面积的比例。另外,照度
454测序仪的出现极大促进了测序业务的开展,科研人员已经将测序技术作为解决科研工作中许多常见 问题的利器。这是因为454测序仪在以下几个方面取得了质的突破:首先是解决了高通量测序问题;其次它简 化了样品准备步骤,将以往转化大肠杆菌扩增质粒的繁琐过程全部用简单的体外PCR扩增法替代了;最后, 它缩小了测序反应体积,节省了 试剂 。这样,454测序仪做到了以极其低廉的价格进行大规模平行测序反应。 它的测序规模之大、测序费用之低
NGS已成为生命科学领域中基因组学和转录组学研究的金标准。虽然它与桑格测序等方法有某些核心相似之处,但NGS所能实现的绝对的高通量水平使它与其他方法截然不同,并彻底改变了科学家的工作方式。 RNA测序(RNA-seq)尤其处于NGS功能应用的前言沿。RNA-seq最简单的形式允许我们在取样时确定样本中的RNAs的丰度。转录组是一个高度动态的细胞特征,并打开了一个巨大发掘潜力的世界。对药物、各种疾病状态、转录后修饰和选择性剪接转录本的反应变化只是 RNA-Seq 使其能够发现的一些例子
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