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- 2026年02月04日
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- 英文名：
NanOnCT Panel v1.0
- 库存：
1
- 供应商：
纳昂达（南京）
NanOnCT Panel v1.0 靶向实体瘤研究中被着重关注的 69 个基因，覆盖基因组约 375 kb 区域。支持包括碱基替换，插入 / 缺失，基因重排，基因扩增，微卫星稳定性在内的多种变异信 息的富集。其探针设计经过优化，提升了对细胞外游离 DNA（Cell-free DNA, cfDNA）文库的捕获效果。
基因列表
编码区覆盖
| AKT1 | ALK | APC | AR | ARAF | ATM | BRAF | BRCA1 | BRCA2 | CCND1 |
| CDH1 | CDK12 | CDK4 | CDK6 | CDKN2A | CTNNB1 | DDR2 | EGFR | ERBB2 | ERCC2 |
| ESR1 | EZH2 | FGFR1 | FGFR2 | FGFR3 | GNA11 | GNAQ | GNAS | HRAS | IDH1 |
| IDH2 | JAK2 | JAK3 | KDM6A | KIT | KRAS | MAP2K1 | MAP2K2 | MDM2 | MET |
| MLH1 | MPL | MSH2 | MSH6 | MTOR | MYC | NF1 | NPM1 | NRAS | NTRK1 |
| NTRK2 | NTRK3 | PDGFRA | PIK3CA | PMS2 | PTCH1 | PTEN | PTPN11 | RAF1 | RB1 |
| RET | ROS1 | SMARCB1 | SMO | STK11 | TERT | TP53 | TSC1 | TSC2 |
注：加粗基因覆盖全部编码区域。
非编码区覆盖
| ALK | BRAF | EGFR | FGFR2 | FGFR3 | MET | NTRK1 | NTRK2 | PDGFRA | RET | ROS1 |
微卫星位点
| BAT-25 | BAT-26 | BAT-40 | BAT-RII | NR-21 | NR-22 | NR-24 | NR-27 | MONO-27 |
| D2S123 | D5S346 | D17S261 | D17S520 | D18S34 |
产品表现
表1. NanOnCT Panel v1.0 对 gDNA 和 cfDNA 文库的捕获表现
| gDNA 捕获效率（%） | cfDNA 捕获效率（%） | |
| HiSeq X Ten, PE150 | 87.02 | 87.35 |
| MGISEQ-2000, PE100 | 85.47 | 87.00 |
注：gDNA 样本为人类女性基因组 DNA（Promega，G1521），超声打断，投入量 50 ng；cfDNA 来源于健康捐献者的血浆，投入量为 10 ng。文库制备采用 NadPrep®️ 系列文库构建试剂盒。数据量为 1 M Read pairs。
优化的探针设计 
图1. 优化探针设计的 NanOnCT Panel v1.0 对 cfDNA 文库的目标区域捕获覆盖更加均一。
多种变异分析
图2. NanOnCT Panel v1.0 捕获数据中变异频率与标准品标称频率的一致性。注：标准品为肿瘤 SNV1-25% gDNA 标准品（菁良，GW-OGTM004）。
图3. NanOnCT Panel v1.0 捕获数据中，探针覆盖对基因扩增情况的重现。注：标准品为肿瘤结构变异 5% gDNA 标准品（菁良，GW-OGTM001）。
特定微卫星覆盖
图4. NanOnCT Panel v1.0 在 HiSeq X Ten 平台对 14 个微卫星有效覆盖。可跨过微卫星序列全长的读长被计为有效读长（Effective reads）。
表2. NanOnCT Panel v1.0 对血液 gDNA / FFPE / 血浆cfDNA / 尿液 cfDNA 等样本类型文库的捕获表现
| 血液 gDNA | 血浆 cfDNA | 严重降解 FFPE | 尿液 cfDNA | |
| 以 reads 计算的中靶率（%） | 87.0 | 83.7 | 85.2 | 82.6 |
| 覆盖深度 ≥ 0.2 x 平均值的靶区比例（%） | 100.0 | 100.0 | 100.0 | 99.9 |
| 覆盖深度 ≥ 0.5 x 平均值的靶区比例（%） | 99.9 | 98.6 | 84.9 | 93.2 |
注：数据均来源于Illumina®️ 平台。本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。
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文献和实验A Panel of Stress-Responsive Luminous Bacteria for Monitoring Wastewater Toxicity
In several chapters in this book (Chapters 7 , 8 , 12 , 13 , 17 –22), as well as m other instances (1 –10 ), bacterial constructs were presented that respond by light emission to different environmental stresses. Such strains can serve
a flow cytometric panel for the simultaneous detection of immunophenotypic profile, proliferative capacity, and DNA content measurement in hMSC. Because a relatively small number of cells are needed with this approach, measurements
多色流式实验中，由于不同荧光素的发射波长的覆盖范围不同，可能产生重叠，对实验结果的数据分析造成一定干扰，我们通常会设置单阳管进行调节补偿。同时，单阳管还可以辅助我们调节通道电压，防止信号超出接收范围。 图示：常见荧光素的发射光谱 A. 如何设置单阳管 单阳管即单染管，是只添加一种荧光抗体的样本管。一般来说，实验 panel 有几种荧光，就需要设置几个单阳管。如：APC、PE、FITC 的三色 panel，需要设置三个单阳管。 B. 制备单阳管的要求 ①单阳管和全染管的样本类型、荧光素要保持
